ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳು
ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್
ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಎಂದರೇನು?
ಸೆಲ್ಯುಲಾರ್ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಒಂದು ಮಾರ್ಪಾಡುಯಾಗಿದ್ದು ಅದು ಚಟುವಟಿಕೆಯನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸಬಹುದು, ಬಂಧಿಸುವ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳು, ಅಥವಾ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಅಥವಾ ಕಿಣ್ವಗಳ ಸೆಲ್ಯುಲರ್ ಸ್ಥಳೀಕರಣ. ಇದು ಒಂದು ಪ್ರಮುಖ ನಿಯಂತ್ರಕ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯಾಗಿದ್ದು, ಇದು ಅನೇಕ ರೋಗ ರೋಗಶಾಸ್ತ್ರಗಳಲ್ಲಿ ನಿರ್ಣಾಯಕ ಪಾತ್ರವನ್ನು ವಹಿಸುತ್ತದೆ, ಉರಿಯೂತ ಸೇರಿದಂತೆ, ಕ್ಯಾನ್ಸರ್, ನರವೈಜ್ಞಾನಿಕ ಮತ್ತು ಚಯಾಪಚಯ ಅಸ್ವಸ್ಥತೆಗಳು. ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಉಳಿಕೆಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳನ್ನು ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಟ್ ಮಾಡುವ ಕಿಣ್ವಗಳು (ಉದಾ., ಟೈರೋಸಿನ್, ಪ್ರಶಾಂತ, ಮತ್ತು ಥ್ರೋನೈನ್) ಕೈನೇಸ್ ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ. ಜಲವಿಚ್ಛೇದನದ ಮೂಲಕ ಫಾಸ್ಫೇಟ್ ಗುಂಪನ್ನು ತೆಗೆದುಹಾಕುವ ಕಿಣ್ವಗಳನ್ನು ಫಾಸ್ಫೇಟೇಸ್ ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ. ಏಕೆಂದರೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಿಗ್ನಲ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಡಕ್ಷನ್ ಮಾರ್ಗಗಳಿಗೆ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಕೇಂದ್ರವಾಗಿದೆ, ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಟೆಡ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ಗಳು (ಅಂದರೆ, ಫಾಸ್ಫೋಪೆಪ್ಟೈಡ್ಗಳು) ಮೇ ಸೆಲ್ಯುಲಾರ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕೈನೇಸ್‌ಗಳು ಮತ್ತು ಫಾಸ್ಫಟೇಸ್‌ಗಳ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ.
ಫಾಸ್ಫೊರಿಲ್ ಗುಂಪುಗಳ ವಿಶಿಷ್ಟ ಸ್ಥಳ
ಸೆರಿನ್ ಮೇಲೆ ಫಾಸ್ಫೊರಲೇಶನ್ ಸಂಭವಿಸಬಹುದು (ಎಸ್, ಎಂದು), ಥ್ರೋನೈನ್ (ಟಿ, Thr) ಮತ್ತು ಟೈರೋಸಿನ್ (ವೈ, ಟೈರ್) ಫಾಸ್ಫೋಸ್ಟರ್ ಬಂಧ ರಚನೆಯಿಂದ ಅಡ್ಡ ಸರಪಳಿಗಳು. CPC ಸೈಂಟಿಫಿಕ್ ಫಾಸ್ಫೋಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳನ್ನು ಸಂಶ್ಲೇಷಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಫಾಸ್ಫೋಸೆರಿನ್ನ ಏಕ ಅಥವಾ ಬಹು ಸಂಯೋಜನೆಗಳನ್ನು ಸಂಯೋಜಿಸುತ್ತದೆ (pS), ಫಾಸ್ಪೋಥ್ರೋನೈನ್ (pT), ಅಥವಾ ಫಾಸ್ಫೋಟೈರೋಸಿನ್ (pY).
ಫಾಸ್ಫೋಸೆರಿನ್
ಫಾಸ್ಫೋಸೆರಿನ್ ಒಂದು ಸಣ್ಣ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಅಥವಾ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸರಪಳಿಯಾಗಿದ್ದು ಅದು ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಟೆಡ್ ಸೆರಿನ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ (pSer), ಅಂದರೆ, ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ತುಣುಕು ಇದರಲ್ಲಿ ಹೈಡ್ರಾಕ್ಸಿಲ್ ಗುಂಪು (-ಓಹ್) ಸೆರಿನ್ ಶೇಷವನ್ನು ಫಾಸ್ಫೇಟ್ ಗುಂಪಿನಿಂದ ಮಾರ್ಪಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ (-PO₄²-).
ಫಾಸ್ಫೋಥ್ರೋನಿನ್
ಫಾಸ್ಫೋಥ್ರಿಯೋನೈನ್ ಒಂದು ಸಣ್ಣ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಅಥವಾ ಪಾಲಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸರಪಳಿಯಾಗಿದ್ದು, ಫಾಸ್ಪೋಥ್ರಿಯೋನಿನ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ (pThr), ಅಂದರೆ. ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಇದರಲ್ಲಿ ಹೈಡ್ರಾಕ್ಸಿಲ್ ಗುಂಪು (-ಓಹ್) ಥ್ರೋನೈನ್ ಶೇಷವನ್ನು ಫಾಸ್ಫೇಟ್ ಗುಂಪಿನಿಂದ ಮಾರ್ಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ (-PO₄²-).
ಫಾಸ್ಫೋಟೈರೋಸಿನ್
ಫಾಸ್ಫೋಟೈರೋಸಿನ್ ಫಾಸ್ಫೋಟೈರೋಸಿನ್ ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಸಣ್ಣ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಅಥವಾ ಪಾಲಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸರಪಳಿಯಾಗಿದೆ (pTyr), ಅಂದರೆ. ಒಂದು ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಇದರಲ್ಲಿ ಫೀನಾಲಿಕ್ ಹೈಡ್ರಾಕ್ಸಿಲ್ ಗುಂಪು (-ಓಹ್) ಒಂದು ಟೈರೋಸಿನ್ ನ (ಟೈರ್) ಶೇಷವನ್ನು ಫಾಸ್ಫೇಟ್ ಗುಂಪಿನಿಂದ ಮಾರ್ಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ (-PO₄²-).
ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗೊಳಿಸಿದ ಉಲ್ಲೇಖಗಳು
PRMT5 C-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ 14-3-3/PDZ ಇಂಟರಾಕ್ಷನ್ ಸ್ವಿಚ್ ಅನ್ನು ಮಾಡ್ಯುಲೇಟ್ ಮಾಡುತ್ತದೆ*
PRMT5 ಸಸ್ತನಿ ಕೋಶಗಳಲ್ಲಿ ಸಮ್ಮಿತೀಯ ಡೈಮಿಥೈಲಾರ್ಜಿನೈನ್ ಶೇಖರಣೆಗೆ ಕಾರಣವಾದ ಪ್ರಾಥಮಿಕ ಕಿಣ್ವವಾಗಿದೆ.. PRMT5 ಅನ್ನು ಹೇಗೆ ನಿಯಂತ್ರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ಅರ್ಥಮಾಡಿಕೊಳ್ಳುವ ಪ್ರಯತ್ನದಲ್ಲಿ, ನಾವು C-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಟೈಲ್ ಮೋಟಿಫ್‌ನೊಳಗೆ ಥ್ರೋನೈನ್ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಸೈಟ್ ಅನ್ನು ಗುರುತಿಸಿದ್ದೇವೆ, ಇದು ಅಕ್ಟ್/ಸೀರಮ್‌ನಿಂದ ಗುರಿಯಾಗಿದೆ- ಮತ್ತು ಗ್ಲುಕೊಕಾರ್ಟಿಕಾಯ್ಡ್-ಪ್ರಚೋದಕ ಕೈನೇಸ್‌ಗಳು. ಈ ಅನುವಾದದ ನಂತರದ ಮಾರ್ಪಾಡಿನ ಕಾರ್ಯವನ್ನು ತನಿಖೆ ಮಾಡುವಾಗ, ಅದರ ಉಚಿತ ಸಿ-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಟೈಲ್ PDZ ಡೊಮೇನ್‌ಗಳನ್ನು ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ನಾವು ಆಕಸ್ಮಿಕವಾಗಿ ಕಂಡುಹಿಡಿದಿದ್ದೇವೆ (ಅನ್ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಟ್ ಮಾಡಿದಾಗ) ಮತ್ತು 14-3-3 ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು (ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಟೆಡ್ ಮಾಡಿದಾಗ). ಮೂಲಭೂತವಾಗಿ, C-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಟೈಲ್‌ನ ಕೊನೆಯ ಕೆಲವು ಅವಶೇಷಗಳೊಳಗಿನ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಘಟನೆಯು ಅನುವಾದದ ನಂತರದ ಮಾರ್ಪಾಡು-ಅವಲಂಬಿತ PDZ/14-3-3 ಸಂವಾದ "ಸ್ವಿಚ್" ಅನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸುತ್ತದೆ. ಪ್ಲಾಸ್ಮಾ ಮೆಂಬರೇನ್ ಅಸೋಸಿಯೇಷನ್‌ಗೆ PRMT5 ನ C-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಮೋಟಿಫ್ ಅಗತ್ಯವಿದೆ, ಮತ್ತು ಈ ಸ್ವಿಚಿಂಗ್ ಸಾಮರ್ಥ್ಯದ ನಷ್ಟವು ಜೀವನಕ್ಕೆ ಹೊಂದಿಕೆಯಾಗುವುದಿಲ್ಲ. ಈ ಸಿಗ್ನಲಿಂಗ್ ವಿದ್ಯಮಾನವು ಇತ್ತೀಚೆಗೆ HPV E6 ಆಂಕೊಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗೆ ವರದಿಯಾಗಿದೆ ಆದರೆ ಸಸ್ತನಿ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳಿಗೆ ಇನ್ನೂ ಗಮನಿಸಲಾಗಿಲ್ಲ. ಸಿಗ್ನಲ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಡಕ್ಷನ್‌ನಲ್ಲಿ PDZ/14-3-3 ಸ್ವಿಚಿಂಗ್‌ನ ಪ್ರಭುತ್ವವನ್ನು ತನಿಖೆ ಮಾಡಲು, ನಾವು PDZ ಡೊಮೇನ್‌ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಪ್ರೊಟೀನ್ ಡೊಮೇನ್ ಮೈಕ್ರೋಅರೇ ಅನ್ನು ನಿರ್ಮಿಸಿದ್ದೇವೆ ಮತ್ತು 14-3-3 ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು. ಅಭ್ಯರ್ಥಿ ಪ್ರೊಟೀನ್‌ಗಳ ಒಂದು ಸಣ್ಣ ಗುಂಪಿನ ಸಿ-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಟೈಲ್‌ಗಳನ್ನು ಪ್ರಶ್ನಿಸಲು ನಾವು ಈ ಮೈಕ್ರೋಅರೇ ಅನ್ನು ಬಳಸಿದ್ದೇವೆ ಮತ್ತು ERBB4 ಅನ್ನು ಗುರುತಿಸಿದ್ದೇವೆ, PGHS2, ಮತ್ತು IRK1 (ಹಾಗೆಯೇ E6 ಮತ್ತು PRMT5) ಈ ಸಿಗ್ನಲಿಂಗ್ ಮೋಡ್‌ಗೆ ಅನುಗುಣವಾಗಿ, PDZ/14-3-3 ಸ್ವಿಚಿಂಗ್ ಒಂದು ವಿಶಾಲವಾದ ಜೈವಿಕ ಮಾದರಿಯಾಗಿರಬಹುದು ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ.
ಸಂಬಂಧಿತ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಮಾರ್ಪಾಡು ಸೇವೆಗಳು
ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಗ್ಲೈಕೋಸೈಲೇಷನ್
ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಗ್ಲೈಕೋಸೈಲೇಷನ್
ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಗ್ಲೈಕೋಸೈಲೇಷನ್ ಒಂದು ಕೋವೆಲನ್ಸಿಯ ಮಾರ್ಪಾಡು ಆಗಿದ್ದು ಅದು ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳ ಭೌತರಾಸಾಯನಿಕ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಸಮರ್ಥವಾಗಿ ಸುಧಾರಿಸುತ್ತದೆ.
ಮುಂದೆ ಓದಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್
ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್
ಸೆರಿನ್ ಮೇಲೆ ಫಾಸ್ಫೊರಲೇಶನ್ ಸಂಭವಿಸಬಹುದು (ಎಸ್, ಎಂದು), ಥ್ರೋನೈನ್ (ಟಿ, Thr) ಮತ್ತು ಟೈರೋಸಿನ್ (ವೈ, ಟೈರ್) ಫಾಸ್ಫೋಸ್ಟರ್ ಬಂಧ ರಚನೆಯಿಂದ ಅಡ್ಡ ಸರಪಳಿಗಳು
ಮುಂದೆ ಓದಿಸ್ಟೇಪಲ್ಡ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ಸ್
ಸ್ಟೇಪಲ್ಡ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ಸ್
α-ಮೀಥೈಲ್ ಹೊಂದಿರುವ ಎರಡು ಅಸ್ವಾಭಾವಿಕ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಪರಿಚಯ, ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸರಪಳಿಗಳ ಘನ-ಹಂತದ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ α- ಆಲ್ಕೆನೈಲ್ ಗುಂಪುಗಳು.
ಮುಂದೆ ಓದಿಸೈಕ್ಲಿಕ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್
ಸೈಕ್ಲಿಕ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್
ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸೈಕ್ಲೈಸೇಶನ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳ ಹೊಂದಾಣಿಕೆಯ ಸ್ಥಿರತೆಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುತ್ತದೆ (ಅವುಗಳ ರೇಖೀಯ ಸಾದೃಶ್ಯಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದಂತೆ) ಮತ್ತು ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಯಲ್ಲಿ ಸಾಮಾನ್ಯ ತಂತ್ರವಾಗಿದೆ.
ಮುಂದೆ ಓದಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಮಾರ್ಪಾಡು
ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳಲ್ಲಿ ವ್ಯಾಪಕ ಅನುಭವ, ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸಂಶೋಧನೆಗೆ ಬಹು ಕಾರ್ಯಸಾಧ್ಯವಾದ ಮಾರ್ಗಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸುವುದು.
