Pelabelan isotop stabil adalah reagen kimia yang molekul suatu senyawa mengandung satu atau lebih atom isotop stabil dan dianalisis serta ditentukan menggunakan sifat pelacak uniknya..

Teknik pelabelan isotop stabil didasarkan pada prinsip pelabelan suatu reaktan dengan mengganti atom tertentu dengan isotop, yang kemudian menyebabkan reaktan mengalami reaksi dan mendeteksi atom dengan perubahan jumlah neutron, yang dapat dilacak melalui reaksi, jalur metabolisme atau sel. Isotop stabil (13C, 15N, 13C15N) peptida berlabel biasanya digunakan sebagai 'label kimia' dalam proteomik kuantitatif untuk mendeteksi dan menelusuri sampel biologis. Metode proteomik kuantitatif terutama menggunakan spektrometri massa resolusi tinggi untuk memisahkan ion peptida atau ion peptida berlabel isotop dan tidak berlabel., dan menggunakan nilai intensitas sinyal yang terdeteksi untuk perhitungan kuantitatif.

Teknologi pelabelan isotop stabil memiliki keunggulan sensitivitas yang tinggi, pemosisian sederhana dan kuantifikasi yang akurat, yang membuat modifikasi isotop semakin mendapat perhatian luas di bidang kedokteran dan biokimia.