Даследаванні дызайну і ЯМР цыклічных пептыдаў, накіраваных на N-канцавы дамен бялку тыразінфасфатазы YopH

Мы паведамляем аб распрацоўцы і ацэнцы новых цыклічных пептыдаў, накіраваных на N-канцавы дамен бялку тыразінфасфатазы YopH з Yersinia. Цыклічныя пептыды былі распрацаваны на аснове кароткай паслядоўнасці бялку SKAP-HOM [OF(pY)DDPF (pY = фасфатыразін)], і ўсе яны ўтрымліваюць матыў DEZXDPfK (дзе Z - фасфатыразін або негідралізаваны міметык фасфатыразіну, X - гэта аспарагінавая кіслата або лейцын, а f - d-фенілаланін). Гэтыя пептыды ўяўляюць сабой архітэктуру «галава да хваста»., забяспечваючы цыклізацыю праз утварэнне аміднай сувязі паміж бакавымі ланцугамі першай аспарагінавай кіслаты і рэшткамі лізіну. Даследаванні абурэння хімічнага зруху былі праведзены для маніторынгу звязвання гэтых пептыдаў з N-канцавым даменам YopH. Пептыды, якія змяшчаюць фрагмент фасфатыразіну, праяўляюць сродства да звязвання ў нізкім мікрамолярным дыяпазоне; замена фасфатыразіну адным з яго негідралізаваных вытворных рэзка зніжае сродства да звязвання. Гэтыя папярэднія даследаванні могуць адкрыць шлях для адкрыцця больш магутных і селектыўных пептыдных лігандаў N-канцавога дамена YopH, якія могуць быць дадаткова даследаваны на прадмет іх здольнасці інгібіраваць інфекцыі, выкліканыя Yersiniae..