Conception et études RMN de peptides cycliques ciblant le domaine N-terminal de la protéine tyrosine phosphatase YopH

Nous rapportons la conception et l'évaluation de nouveaux peptides cycliques ciblant le domaine N-terminal de la protéine tyrosine phosphatase YopH de Yersinia.. Des peptides cycliques ont été conçus sur la base d'une courte séquence de la protéine SKAP-HOM [DE(pY)DDPF (pY = phosphotyrosine)], et ils contiennent tous le motif DEZXDPfK (où Z est une phosphotyrosine ou un mimétique de phosphotyrosine non hydrolysable, X est un acide aspartique ou une leucine et f est une d-phénylalanine). Ces peptides présentent une architecture « tête-bêche », permettant la cyclisation grâce à la formation d'une liaison amide entre les chaînes latérales du premier acide aspartique et les résidus lysine. Des études de perturbation par déplacement chimique ont été réalisées pour surveiller la liaison de ces peptides au domaine N-terminal de YopH.. Les peptides contenant un fragment phosphotyrosine présentent des affinités de liaison dans la plage micromolaire faible; la substitution de la phosphotyrosine par l'un de ses dérivés non hydrolysables réduit considérablement les affinités de liaison. Ces études préliminaires pourraient ouvrir la voie à la découverte de ligands peptidiques plus puissants et sélectifs du domaine N-terminal de YopH, qui pourraient être étudiés plus en détail pour leur capacité à inhiber les infections à Yersiniae..