Пептид модификациялары
N-терминал модификацияһы
What is N-terminal modification?
N-terminal acetylation removes the charge from the amino terminus of a peptide. Ғөмүмән, ., acetylation modification is recommended if the peptide is to mimic its natural structure in the protein. Өҫтәүенә, the acetylation modification stabilises the peptide chain and makes it less susceptible to enzymatic degradation at the end of the peptide chain.
In addition to acylation, other N-terminal modifications (мәҫ., urea, carbamate, sulfonamide, alkylamine) can be performed.
Radioligands are often attached to the N-terminus of a peptide if the pharmacodynamics of the peptide allow it. Мәҫәлән, DOTA, ФАЙҘАЛАНЫУ, NODAGA, һ. б.. can be attached.
N-terminal modification technical
Тип модификации
N-terminal modification improves the stability of peptides because this modification generates a structure similar to the natural protein structure. Шулай итеп, this modification method can improve the biological activity of the polypeptide and prevent enzymatic degradation.
|
5-ФАМ
|
БСА (-NH2 of N terminal)
|
Hexanoic acid
|
|---|---|---|
|
5-FAM-Ahx |
CBZ |
HYNIC |
|
Абз |
Дэнсил |
КЛХ (-NH2 of N terminal) |
|
Ацетилләшеү |
Dansyl-Ahx |
Lauric acid |
|
Acryl |
Decanoic acid |
Lipoic acid |
|
Аллок |
DTPA |
Maleimide |
|
Benzoyl |
Fatty Acid |
MCA |
|
Биотин |
ФИТК |
Myristoyl |
|
Biotin-Ahx |
ФИТК-Ахх |
Octanoic acid |
|
BOC |
Фмок |
ОВА (-NH2 of N terminal) |
|
Br-Ac- |
Formylation |
Palmitoyl |
Һайланма цитаталар
Proteome-derived peptide libraries for deep specificity profiling of N-terminal modification reagents
Protein and peptide N termini are important targets for selective modification with chemoproteomics reagents and bioconjugation tools. The N-terminal α-amine occurs only once in each polypeptide chain, аҡһым биоконъюгацияһы өсөн ылыҡтырғыс маҡсатҡа әйләндерә. Күҙәнәктәрҙә, яңы N-терминдарҙы протеолит ярылыу юлы менән генерацияларға һәм N-терминаль модификациялау реагенттары ярҙамында тоторға мөмкин, улар тандем масс-спектрометрияһы менән протеаза субстраттарын протеом киңлегендә асыҡлау мөмкинлеген бирә. (ЖК-МС/МС). Модификациялау реагенттарының N-терминаль эҙмә-эҙлеклелеге үҙенсәлеген аңлау был ҡушымталар өсөн һәр береһе өсөн мөһим.. Протеомдарҙан алынған пептид китапханалары LC-MS/MS менән бергә N-терминаль модификация реагенттарының эҙмә-эҙлеклелек спецификаһын профилләштереү өсөн ҡөҙрәтле ҡорал булып тора.. Был китапханалар бик күп төрлө ., һәм LC-MS/MS бер тәжрибәлә тиҫтәләгән мең эҙмә-эҙлеклелектең модификациялау һөҙөмтәлелеген анализлау мөмкинлеген бирә. Протеомдарҙан алынған пептид китапханалары ферментлы һәм химик пептидтарҙы маркировкалау реагенттарының эҙмә-эҙлеклелек үҙенсәлектәрен профилләштереү өсөн ҡөҙрәтле ҡорал булып тора.. Субтилигаза һәм 2-пиридинкарбоксальдегид (2ПКА) Һайлап алыу N-терминаль пептидтарҙы модификациялау өсөн эшләнгән һәм протеомдан алынған пептид китапханаларын ҡулланып өйрәнергә мөмкин булған ике реагент булып тора.. Был протоколда N-терминаль төрлө протеомдарҙан алынған пептид китапханаларын генерациялау һәм был китапханаларҙы N-терминаль модификациялау реагенттарының спецификаһын профилләштереү өсөн ҡулланыу өсөн аҙымдар билдәләнгән.. 2-пиридинкарбоксальдегидтың спецификаһын профилләштереү өсөн аҙымдарҙы ентекләп өйрәнәбеҙ., химик модификациялау реагенты, һәм субтилигаза, ферментлы модификациялау реагенты. Был протоколдарҙы еңел генә альтернатив протеом сығанаҡтарына һәм башҡа N-терминаль пептид маркировкалау реагенттарына яраҡлаштырырға мөмкин ..
Пептидтарҙы модификациялау хеҙмәттәре
пептид гликозилләшеүе
пептид гликозилләшеүе
Пептидтар гликозилләшеүе — пептидтар физик-химик үҙенсәлектәрен потенциаль яҡшырта алған ковалент модификация .
Тулыһынса уҡырғапептид фосфорилләшеүе
пептид фосфорилләшеүе
Серинда фосфорлашыу булыуы мөмкин (S, Булырға), Треонин (Т., Тр) һәм тирозин (Y, Тыр) фосфоэфир бәйләнеше барлыҡҡа килтереү юлы менән ян сылбырҙары
Тулыһынса уҡырғаСтеплерлы пептидтар
Степлерлы пептидтар
Составында α-метил булған ике тәбиғи булмаған аминокислота индереү, пептид сылбырҙарының ҡаты фазалы синтезы ваҡытында α-алкенил төркөмдәре.
Тулыһынса уҡырғаЦикллы пептид
Цикллы пептид
Пептидтар циклизацияһы пептидтар конформацион тотороҡлолоғон арттыра (уларҙың һыҙыҡлы аналогтарына ҡарата) һәм пептидтар үҫешендә дөйөм стратегия булып тора.
Тулыһынса уҡырғапептид модификацияһы
Пептидтарҙы модификациялауҙа ҙур тәжрибәгә эйә, пептидтарҙы тикшерергә бер нисә йәшәүгә һәләтле юлдарҙы тәьмин итеү.