Пептид модификациялары
FRET пептиды
Нимә ул FRET пептид?
FRET пептид маркировкаһы донор молекулаһына һәм акцепторға эйә (шартлатыусы матдә) молекула. Күпселек осраҡта ., донор һәм акцептор парҙары — ике төрлө буяу. Әгәр акцептор люминесцент булмаған буяу булһа (шартлатыусы матдә), люминесцент донорҙан күсерелгән энергия молекуляр тирбәлеүҙәргә әйләнә. Ҡасан FRET туҡтатыла (донор менән акцепторҙы айырыу юлы менән), донор флуоресценцияһының артыуын асыҡларға мөмкин. Донор һәм акцептор буяуҙары ла флуоресцент булғанда, тапшырылған энергия оҙонораҡ тулҡын оҙонлоғондағы яҡтылыҡ рәүешендә сығарыла, донор һәм акцептор флуоресценцияһы интенсивлығы нисбәтендәге үҙгәрештәрҙе үлсәү мөмкинлеген бирә. Һөҙөмтәле FRET ярылыу өсөн, флюорофор һәм шартлатыусы матдә молекулалары бер-береһенә яҡын булырға тейеш (~10—100 А) һәм ярсыҡ агенттың һеңдерелеү спектры флюорофор эмиссия спектры менән ҡапланырға тейеш. Донор-шартлаусы FRET системаларын проектлағанда донор флуоресценция спектрын һәм ярсыҡ агентының абсорбция спектрын ентекле сағыштырыу талап ителә ..
FRET пептидтары тураһында фән
FRET пептидтарының төп өҫтөнлөктәре:
·Ферментлы реакцияларҙы һәм аҡһым эшмәкәрлеген реаль ваҡытта күҙәтеү.
·Сиктән тыш юғары асыҡлау һиҙгерлеге арҡаһында уникаль яҡынлыҡ нигеҙендә энергия тапшырыу.
·Универсаль өсөн in vitro һәм in vivo ҡушымталар, ҡатмарлы биологик процестарҙы аңлау.
|
Флюорофор
|
Һүндергес
|
Элекке донор
|
|---|---|---|
|
Абз |
Днп 2,4-динитрофенил |
320 нм/420 нм |
|
Абз |
Днп 2,4-динитрофенил |
320 нм/420 нм |
|
Мка |
Днп 2,4-динитрофенил |
325 нм/392 нм |
|
Трп |
Днп 2,4-динитрофенил |
280 нм/360 нм |
|
ФАМ |
Дабцыл4-([4'-диметиламино)фенил]оҫталыҡ)бензоил |
492 нм/517 нм |
|
Люцифер Һары |
Дабсыл .4(Диметиламино)азобензол-4'-сульфонил |
430нм/520нм |
Һайланма цитаталар
Ультраһиҙгер шеш үтеп инеүсе протеаза эшмәкәрлеге нанодатчиктары
Эндоген биомаркерҙар менән яман шеш сирҙәрен асыҡлау мөмкинлеге әлеге ваҡытта диаметры ~1 см булған шештәр менән генә сикләнә. Беҙ күптән түгел хәбәр итте экзоген идара итеү шеш үтеп инеүсе нанодатчик, тип ҡойоп, шешкә хас протеазаларға яуап итеп, пептид фрагменттары, уларҙы һуңынан һейҙектә асыҡларға мөмкин. Бында, беҙ оптимизация тураһында хәбәр итәбеҙ, фармакокинетик математик модель ярҙамында хәбәр ителә, өҫкө презентацияһы пептид субстраттары һәм маҡсатлы протеаза ярылыуын көсәйтергә һәм маҡсаттан тыш ярылыуҙы минималь кимәлгә еткерергә, һәм шеш микромөхитендә әүҙемләшеүҙе арттырыу өсөн әүҙем трафикинг юлдарын йәлеп иткән шеш үтеп инеүсе лигандтар менән нанодатчиктарҙы функционалләштереү тураһында.. Һөҙөмтәлә алынған нанодатчик кеше эпителий шештәрендә 5 мм-ҙан кәмерәк йәрәхәттәрҙе айыра һәм медиана диаметры 100-ҙән бәләкәйерәк төйөндәрҙе асыҡлай. 2 мм йомортҡалыҡ яман шешенең ортотопик моделендә. Беҙ шулай уҡ иммунокомпетентлы модель колоректаль бауыр метастаздары һейҙектә сигнал генерацияһының рецепторҙарға бәйле көсәйтелгән спецификаһын күрһәтәбеҙ ., һәм кеше шеше микромассивтарында нанодатчиктарҙы флюороген зимография зондтары булараҡ яңынан эшләгәндә in situ әүҙемләштереү.
Пептидтарҙы модификациялау хеҙмәттәре
пептид гликозилләшеүе
пептид гликозилләшеүе
Пептидтар гликозилләшеүе — пептидтар физик-химик үҙенсәлектәрен потенциаль яҡшырта алған ковалент модификация .
Тулыһынса уҡырғапептид фосфорилләшеүе
пептид фосфорилләшеүе
Серинда фосфорлашыу булыуы мөмкин (S, Булырға), Треонин (Т., Тр) һәм тирозин (Y, Тыр) фосфоэфир бәйләнеше барлыҡҡа килтереү юлы менән ян сылбырҙары
Тулыһынса уҡырғаСтеплерлы пептидтар
Степлерлы пептидтар
Составында α-метил булған ике тәбиғи булмаған аминокислота индереү, пептид сылбырҙарының ҡаты фазалы синтезы ваҡытында α-алкенил төркөмдәре.
Тулыһынса уҡырғаЦикллы пептид
Цикллы пептид
Пептидтар циклизацияһы пептидтар конформацион тотороҡлолоғон арттыра (уларҙың һыҙыҡлы аналогтарына ҡарата) һәм пептидтар үҫешендә дөйөм стратегия булып тора.
Тулыһынса уҡырғапептид модификацияһы
Пептидтарҙы модификациялауҙа ҙур тәжрибәгә эйә, пептидтарҙы тикшерергә бер нисә йәшәүгә һәләтле юлдарҙы тәьмин итеү.