Пептид модификациялары
Пептид биотинилләшеүе
Нимә ул пептид биотинилләшеүе?
Яраҡлы рәүештә билдәләнгән пептидтарҙы йәки биотинилланған пептидтарҙы асыҡлау (мәҫ.. маркировкаланған антитәнсәләр менән)Биотинилланған пептидтарҙы йәки билдәләнгән пептидтарҙы билдәләнмәгәндәрҙән айырыу (мәҫ.. бәйләнгән антитәнсәләр менән)
Биркалар биотин кеүек бәләкәй органик молекулалар булыуы мөмкин (стрептавидин менән ныҡ һәм ковалент булмаған бәйләнгән) йәки ҡыҫҡа пептид эҙмә-эҙлеге. Иң күренекле миҫалдар өсөн пептид эҙмә-эҙлеклелеге ҡулланыла биркалар булараҡ эпитоп биркалар кеүек Flag билдәһе ., HA тегы һәм Myc тегы. Яңыраҡ эшләнгән билдә ALFA пептид билдәһе булып тора .. Бөтә тегтар өсөн, антитәнсәләр сауҙала бар. Тейешле эҙмә-эҙлеклелек өсөн түбәндә ҡарағыҙ.
МОЛ үҙгәрештәр ғәҙәти рәүештә төрлө билдәләр йөрөткән билдәләнгән пептидтарҙы синтезлай. Билдәләр, ғәҙәттә, N-осында йәки C-осында беркетелә (лизин йәки цистеин аша), әммә принцип буйынса теләһә ҡайҙа урынлаштырырға мөмкин. Бөтә биркалар пептидтан төрлө төрлө тип аталған линкерҙар йәки төрлө оҙонлоҡтағы һәм полярлыҡтағы проставка молекулалары ярҙамында айырыла ала .. Теләгегеҙ булһа, линкерҙарҙы ярылырлыҡ итеп эшләргә мөмкин, мәҫ.. һиҙгер дисульфид бәйләнештәрҙе кәметеү юлы менән. Ҡарап сығығыҙ исемлеге бар линкер / проставка / ПЭГилләшеүҙәр. Бында йыш индерелгән тегтар күрһәтелгән.
Биотинилланған һәм билдәләнгән пептидтар
Яҡынлыҡ билдәләре, мәҫәлән, биотин өсөн ҡулланырға мөмкин
·Яҡшы билдәләнгән пептидтарҙы йәки биотинилланған пептидтарҙы асыҡлау (мәҫ.. маркировкаланған антитәнсәләр менән)
·Биотинилланған пептидтарҙы йәки билдәләнгән пептидтарҙы билдәләнмәгәндәрҙән айырыу (мәҫ.. бәйләнгән антитәнсәләр менән)
Биркалар биотин кеүек бәләкәй органик молекулалар булыуы мөмкин (стрептавидин менән ныҡ һәм ковалент булмаған бәйләнгән) йәки ҡыҫҡа пептид эҙмә-эҙлеге. Иң күренекле миҫалдар өсөн пептид эҙмә-эҙлеклелеге ҡулланыла биркалар булараҡ эпитоп биркалар кеүек Flag билдәһе ., HA тегы һәм Myc тегы. Яңыраҡ эшләнгән билдә ALFA пептид билдәһе булып тора .. Бөтә тегтар өсөн, антитәнсәләр сауҙала бар. Тейешле эҙмә-эҙлеклелек өсөн түбәндә ҡарағыҙ.
МОЛ үҙгәрештәр ғәҙәти рәүештә төрлө билдәләр йөрөткән билдәләнгән пептидтарҙы синтезлай. Билдәләр, ғәҙәттә, N-осында йәки C-осында беркетелә (лизин йәки цистеин аша), әммә принцип буйынса теләһә ҡайҙа урынлаштырырға мөмкин. Бөтә биркалар пептидтан төрлө төрлө тип аталған линкерҙар йәки төрлө оҙонлоҡтағы һәм полярлыҡтағы проставка молекулалары ярҙамында айырыла ала .. Теләгегеҙ булһа, линкерҙарҙы ярылырлыҡ итеп эшләргә мөмкин, мәҫ.. һиҙгер дисульфид бәйләнештәрҙе кәметеү юлы менән.
|
Яҡынлыҡ билдәһе
|
Эҙмә-эҙлелек
|
Комментарий
|
|---|---|---|
|
Флаг билдәһе |
ДЫКДДДДК |
Анти флаг антитело |
|
HA көнө |
ЙПЫДВПДЯ |
Анти HA антитело |
|
Күп ваҡыт . |
ЭККЛИСЕДЛ |
Анти Myc антитело |
|
КПП
|
Эҙмә-эҙлелек
|
Комментарий
|
|---|---|---|
|
Тат (47-57) |
ЙГРККРРҠРР |
Күҙәнәккә үтеп инеүсе пептид |
|
Олиго-аргинин |
РРРРРРР |
Күҙәнәккә үтеп инеүсе пептид |
МОЛ үҙгәрештәр шулай уҡ һеҙҙең менән тәьмин итеү мөмкинлеге киң спектр реактив ярлыҡтар беркетелгән пептидтар .. Миҫалдарға 1990 йылдың индерелеүе килтерелә.
- Азидтар (алкиндар менән реакция – клик химияһы)
- Рәсем сәнғәтендә . (тиолдар менән реакция, мәҫ.. Cys)
- Тиолдар (малеимидтар менән реакция)
- Cys(Пыс/Нпыс) (тиолдар менән реакциянан дисульфидтар барлыҡҡа килтерә)
Һайланма цитаталар
Миелоидҡа хас кеше CD33 — SHP-1 һәм SHP-2 фосфатазаларын рекрутлауҙа дифференциаль ITIM функцияһы булған ингибитор рецепторы.
CD33 — сиал кислотаһын бәйләүсе рецепторҙар ғаиләһенең миелоид специфик ағзаһы һәм миелоид ата күҙәнәктәрҙә юғары кимәлдә, әммә дифференциацияланған күҙәнәктәрҙә күпкә түбәнерәк кимәлдә экспрессиялана.. Кеше CD33 цитоплазма доменында ике тирозин ҡалдығына эйә (Й340 һәм Й358). Фосфорланғанда, был тирозиндар фосфатазалар өсөн док-урын булып эшләй ала, ШП-1 һәм/йәки ШП-2., CD33-тең ингибитор рецепторы булып эшләү мөмкинлеген бирә. Бында беҙ күрһәтәбеҙ, CD33 тирозин фосфорилировать булғанда фосфатаза ингибиторы ., перванадат, һәм ШП-1 һәм ШП-2 рекруттары ала.. Коэкспрессия тикшеренеүҙәре күрһәтеүенсә, Src-ғаилә киназаһы Lck Y340 фосфорилләштереүҙә һөҙөмтәле., әммә Y358 түгел, был ҡалдыҡтар адаптер молекулаларын һайлап алыуҙа эшләй ала һәм айырым функциялар башҡара ала тип фаразлай. Ҡапланыу өсөн артабанғы ярҙам, әммә артыҡ булмаған, ролдәре өсөн Y340 һәм Y358 килә пептид-бәйләүсе тикшеренеүҙәр, асыҡланған рекрутинг һәм SHP-1 һәм SHP-2 Y340 әммә тик SHP-2 Y358. SHP-1 мутанттарын ҡулланып анализлау күрһәтеүенсә, CD33-тең Y340-ын бәйләү тәү сиратта SHP-1-ҙең амино Src гомологияһы-2 доменына бәйләнгән.. CD33-тең ингибитор рецепторы булараҡ эшләү мөмкинлеге уның CD64-индуцированный кальций мобилизацияһын U937-лә түбәнгә көйләү мөмкинлеге менән күрһәтелгән.. Был тормошҡа ашырыуҙы тормошҡа ашырыуҙы SHP-1-гә бәйлелеге CD33-медиациялы эффекттарҙы доминант кире SHP-1 менән блоклау юлы менән күрһәтелгән.. Был һөҙөмтә CD33 ингибитор рецепторы булыуын һәм шулай уҡ SHP-1 фосфатазаһы CD33 функцияһын медиациялауҙа мөһим роль уйнауын күҙ уңында тота.. Артабанғы тикшеренеүҙәр рецепторҙы асыҡлау өсөн мөһим .(с) CD33 in vivo һәм уның миелоид нәҫел үҫешендәге функцияһын тормошҡа ашырыуҙы тормошҡа ашыра.
Пептидтарҙы модификациялау хеҙмәттәре
пептид гликозилләшеүе
пептид гликозилләшеүе
Пептидтар гликозилләшеүе — пептидтар физик-химик үҙенсәлектәрен потенциаль яҡшырта алған ковалент модификация .
Тулыһынса уҡырғапептид фосфорилләшеүе
пептид фосфорилләшеүе
Серинда фосфорлашыу булыуы мөмкин (S, Булырға), Треонин (Т., Тр) һәм тирозин (Y, Тыр) фосфоэфир бәйләнеше барлыҡҡа килтереү юлы менән ян сылбырҙары
Тулыһынса уҡырғаСтеплерлы пептидтар
Степлерлы пептидтар
Составында α-метил булған ике тәбиғи булмаған аминокислота индереү, пептид сылбырҙарының ҡаты фазалы синтезы ваҡытында α-алкенил төркөмдәре.
Тулыһынса уҡырғаЦикллы пептид
Цикллы пептид
Пептидтар циклизацияһы пептидтар конформацион тотороҡлолоғон арттыра (уларҙың һыҙыҡлы аналогтарына ҡарата) һәм пептидтар үҫешендә дөйөм стратегия булып тора.
Тулыһынса уҡырғапептид модификацияһы
Пептидтарҙы модификациялауҙа ҙур тәжрибәгә эйә, пептидтарҙы тикшерергә бер нисә йәшәүгә һәләтле юлдарҙы тәьмин итеү.