Ntughari bu ntughari, ọ bụghị ihe mgbakwunye
Otu peptide cyclic nke na-egbochi HIF-1a site n'itinye akpa PAS-B bụ igodo ịkpụ iji dabara otu mkpọchi.. Ịtụnye ya ka ọ bụrụ onye na-eweda ala pụtara ịgbado ọkụ n'ime igodo ahụ: onye njikọ gbakwunyere ihe na-ewebata VHL, etinyere ya ka mgbanaka ahụ ka nọkwa n'akpa ahụ ka ogwe aka ọhụrụ na-erute iwere ligase ahụ. Ezé enweghị ike ịgbanwe. Ihe ọ bụla ọzọ nwere ike.
Ọdịiche ahụ na-akpali ọrụ ahụ dum. N'okwu arịlịka, A na-ewu njikọ njikọ na VHL ligand dị ka amino acid bifunctional omenala ma tinye ya ozugbo n'oge njikọ peptide siri ike., kama ịbụ onye a na-ejikọta ya mgbe ịgba ígwè gachara (JACKS, cyclic Peptide PROTACs weghachi VHL-Mediated HIF-1α mmebi na Hypoxia, 2026). Ihe ga-esi na ya pụta bụ na ebe mgbakwunye na-aghọ nhọrọ nhazi nke edoziri n'oge agbụ-mgbakọ, Ọ bụghị mgbanwe ị na-akụ ma emechaa na bench.
Mkpebi ọ bụla dị ala na-esite na nkwa ahụ: nke gradient na-edozi conjugate, nke conformational nlele na-egosi na mgbanaka dị ndụ, na nke nnwale nwere ike ịmata ọdịiche dị n'imebi n'ebe obibi naanị.
Kedu vector ọpụpụ kwesịrị iburu njikọ ahụ?
Nhọrọ njikọ-saịtị bụ mkpebi mbụ na-amachibido nke ọ bụla emechaa, na iwu dị mfe ikwu: họrọ ọnọdụ opekempe ka ọ ga-emebi njikọ yana yikarịrị ka ọ ga-ekpughere ihe mgbaze (Usoro dị ugbu a maka imewe nke ndị njikọ PROTAC, 2020). Mgbe nrụkọ-kristal nke peptide cyclic gị jikọtara na ebumnuche dị, a ga-aza iwu ahụ site na nyocha. Mgbe ọ bụghị, nnyocha enweghị ike ikpebi ajụjụ, na-eme ka ọ bụghị otú mmemme na-atụfu ọnwa.
Ọrụ Ebe mgbakwunye abụghịkwa nzọụkwụ mwepu ị na-agbanye mgbe emechara peptide. Ọ bụ a yinye-mgbakọta nhọrọ imewe, edozi tupu njikọ amalite, dị ka ọ dị na arịlịka ikpe. Ịgbanwe uche gị ma emechaa pụtara ịmegharị peptide ahụ, adịghị edezi a n'akụkụ yinye.
Iwu ogo nke pụtara ìhè: wepụta vectors n'ọkwa site n'ihe onye ọ bụla na-echekwa, n'usoro a: ebumnuche ebumnuche, emesia omume ternary- mgbagwoju anya, emesia nbibi. SAR dị warara n'ọnọdụ yiri ihe mgbaze bụ ịdọ aka ná ntị, ọ bụghị mkpọtụ. Ọkwa ahụ na-ebu ibu, na a ga-emegharị ọkwa ahụ.
Ịwụnye njikọ na ihe E3
Mkpebi ụzọ na-ebute ụzọ, n'ihi na on-resin na ngwọta conjugation ada n'ebe dị iche iche. Ntinye na resin nke amino acid bifunctional na-ewuli njikọ n'ime yinye n'onwe ya, ya mere atụmatụ nchekwa otu ahụ ga-edobe aka orthogonal nke njikọ ahụ Ụlọ ahịa njikọ ọ bụla na-esote na usoro ịgba ígwè. Ngwakọta ngwọta mgbe ịgba ígwè gachara na-adị ngwa ikwugharị, mana ọ na-ekpughere peptide n'efu na kemistri rụọ ọrụ ugboro abụọ wee hapụ gị ka ị sachapụ ngwakọta nke isomers ọnọdụ ma ọ bụrụ na ihe reactive abụghị ihe pụrụ iche..
Ọrụ Southampton na-egosi ihe ntugharị ahụ na-azụta. Usoro nke malitere na cyclo-CLLFVY kwagara n'isi agha ọgbọ nke abụọ, cyclo-CLLF(CF3)Ọ BỤRỤ na(Br), na-ebu ogologo njikọ amino acid na-ekwekọghị n'okike wuru n'ime usoro kama itinye ya ma emechaa (McDermott et al., 2025). Iwuli njikọ n'ime agbụ bụ ihe na-eme ogologo njikọ dị iche iche na-agbanwe agbanwe kama nsogbu ịdị ọcha.
Nke ahụ dị mkpa n'ihi na isi ihe iyi egwu nke ịdị ọcha peptide na mpịachi n'ụzọ a bụ epimerization, ma a na-ezere ya n'ụzọ igwe. Ime amino acid rụọ ọrụ na-etolite oxazolone planar nke na-adịru nwa oge na α-carbon., yabụ reprotonation nwere ike ịlaghachi ma ọ bụ L- ma ọ bụ D-nhazi. Ihe ize ndụ ịrị elu na ịgbalite ịgbalite, ukwuu reactive njikọ njikọ reagents, na chịkọbatara arụ ọrụ etiti, na ihe fọdụrụ dị ka phenylglycine, cysteine na histidine na-adịkarị mfe karị (Bachem; Epimerisation na Peptide Synthesis, 2023).
Ogo ya dabere n'ụzọ, na ọrụ ike nke onye na-ere ahịa na-egosi mgbasawanye karịa ịtọ ntọala: mkpirisi ụzọ mkpirisi nke a na-emepụta nke ọma 13% e guzobere epimer ma kwụsị, ebe ụzọ ọzọ gosipụtara 2-3% epimerization na-ebili ihe dị ka 5% mgbe emechara ọcha, na linear SPPS nyere mkpụrụ kacha elu na-enweghị epimerization achọpụtara (Bachem). Gụọ nke ahụ dị ka ihe mgbaàmà nke klaasị ụzọ na-ebu ihe egwu, ọ bụghị dị ka ọnụego ị nwere ike ịtụ anya na usoro nke gị. Ihe gbasara
Kedu data ịdị ọcha RP-HPLC nwere ike ma enweghị ike ịgwa gị
Otu pasent isi kacha elu na 214 nm akwadoghị njikọ ziri ezi ma ọ bụ mpịachi ziri ezi. Ọ na-agwa gị na ụdị ndị na-anabata UV na nlele gị na-adị elu dị ka otu eriri na otu gradient. Nke ahụ bụ eziokwu bara uru, na ọ bụ a nta eziokwu karịa ọtụtụ mmemme na-emeso ya dị ka.
Maka ibu, ọzọ hydrophobic conjugate, usoro a na-edozi obere karịa ka ọ mere maka nne na nna cyclic peptide. Ihe njikọ na ihe E3 na-agbakwunye ebe elu hydrophobic, oge njide na-agbanwe, na ụdị ndị kewara n'usoro na gradient nne na nna na-amalite imekọ ọnụ. Ihe mmemme peptide degrader disulfide-cyclized nke ebipụtara na-akọ na omume nkwadebe ya nke ọma: otu nzọụkwụ RP-HPLC na a 0.1% Mmiri TFA/acetonitrile gradient na-agba ọsọ 26-43% karịa 40 nkeji na 10 ml/min, nchọpụta na 220 nm, oxidation nke a na-enyocha site na uka spectrometry n'akụkụ HPLC, na nlele ikpeazụ nke HPLC tupu lyophilization (Oke na Immunology, 2023). Rịba ama ihe akwụkwọ ahụ na-ekwughị: ọnụ ụzọ ịdị ọcha ọ bụla. Nọmba ahụ bụ mmepụta usoro, ọ bụghị nkọwapụta.
Ndị na-ebunye ihe na-akọwakarị ịdị ọcha ≥95% RP-HPLC dị ka ala maka nleba anya nke ndu., ≥98% maka ọnụọgụ ọnụọgụ na ọrụ nzaghachi dose, na ≥99% maka ọrụ ụkpụrụ ntụaka, A kọwapụtara ịdị ọcha dị ka mpaghara isi-elu karịa mkpokọta kacha elu site na nchọpụta UV na 214-220 nm (GenScript; Okike Proteomics, 2025). Were eriri ndị ahụ dị ka nkwekọrịta ịzụrụ kama ịchọta nchọta gbasara molekul gị. Ha na-akọwa ihe onye na-ere ahịa ga-akwado, ọ bụghị ihe conjugate gị chọrọ.
Ọdịiche dị mkpa n'ihi na ịdị ọcha peptide na mpịachi bụ ajụjụ dị iche iche, na RP-HPLC na-aza naanị nke mbụ. Epimer na-ejikọta ọnụ, isomer disulfide ezighi ezi, ma ọ bụ nne na nna na-emeghị ihe na-eme na-agba ọsọ n'otu oge njide niile dị ka otu ọnụ ọgụgụ dị ọcha. njirimara oke, stereochemistry, na nhazi usoro nke ọ bụla chọrọ usoro orthogonal.
Gụọ matrix ahụ ka nlele mkpuchi, ọ bụghị ọkwa. RP-HPLC na-ekpuchi hydrophobicity na ịdị ọcha. LC-MS na HRMS na-ekpuchi njirimara oke, nke bụ otu esi akwado njikọ njikọ ahụ n'ezie. Chiral LC na-ekpuchi stereochemistry, nke bụ otu esi ejide epimerization na saịtị njikọ. NMR na CD mkpuchi nkwekọrịta nkwekọrịta, nke bụ otu ị ga-esi mata ọdịiche conjugate apịaji na nke agbasaghị. Ọ dịghị otu ahịrị na-ekpuchi ihe karịrị otu kọlụm, na mmemme nke na-akọ naanị ahịrị mbụ nwere ihe akaebe maka otu n'ime ajụjụ anọ.
Nsonaazụ bara uru maka nhọrọ saịtị njikọ: ọ bụrụ ngwungwu nyocha gị bụ otu nchọta RP-HPLC, ị nwebeghị ike ịma ma vector ọpụpụ ị họọrọ mepụtara conjugate ị haziri. Tinye ụzọ orthogonal tupu ịme ụzọ ahụ, ọbụghị mgbe nyocha nke njide gachara na-alọghachi ewepụghị.
Mpịakọta na nkwenye nkwenye
Peptide Synthesis cyclization na-egbochi ọkpụkpụ azụ, mana ọ naghị ekwe nkwa na conformation bioactive na-adị ndụ mgbakwunye njikọ. Ọdịiche ahụ bụ ya mere ihe akaebe conformal ga-eji bụrụ orthogonal na ihe akaebe dị ọcha: Klas usoro ọ bụla na-aza ajụjụ ndị ọzọ enweghị ike.
Chiral LC na-edozi stereochemistry, ya mere ọ na-agwa gị ma conjugate racemized na residues ị na-eche banyere. CD na-akọ banyere nhazi nke abụọ ngwọta, yana NMR na-akọ na kọntaktsị ndị akọwapụtara nke na-akọwa mpịakọta ejikọta. Ọ dịghị nke ọ bụla n'ime ndị a dochie ọzọ, na ọdịghị nke ọ bụla n'ime ha nọchiri anya ngụpụta na-arụ ọrụ. Otu ụkpụrụ ahụ na-achịkwa usoro nyocha: naanị mgbaama mgbagwoju anya ezughi oke, na cellular DC50/Dmax ụkpụrụ naanị bụ phenotypic kama arụzigharị (Uzo esi amụ usoro ihe nleba anya ma na-akpụpụta atụmatụ nke ndị na-emebi ihe, ewepụtara 2026-05-14).
Ntugharị igodo: Ịdị ọcha HPLC dị elu abụghị conjugate ziri ezi. Ọnụ ọgụgụ kasị elu nke dị ọcha na nke ekwenyesiri ike ka nwere ike ibu akụkụ na-ezighị ezi n'ime usoro nyocha.
Maka ngwugwu data gị, oghere ahụ bụ ihe ize ndụ imechi. Njikọ nke na-agafe ịdị ọcha na njirimara oke mana enyochaghị ya nke ọma na-ebu ihe egwu na-enweghị atụ na-aga n'ihu., na ndị otu nyocha ketara ya. Mesoo ịdị ọcha peptide na mpịachi dị ka ahịrị akaebe abụọ dị iche iche, onye ọ bụla nwere usoro nke ya na akara nnabata nke ya, tupu ewepụta ihe na bayoloji.
Ahịrị ihe akaebe na-arụ ọrụ
Mkpebi mmebi iwu bụ nkwupụta usoro, ma ọ dịghị otu nyocha na-ebu ya. Agbụ ihe akaebe nwere njikọ anọ, na onye nyocha ga-achọ ihe anọ ahụ: ternary mgbagwoju nhazi, lekwasịrị anya n'ebe niile, ịdabere na proteasomal, na ike quantitative na n'uko readout. Ọ bụrụ na ngwugwu gị kwụsịrị mgbe njikọ nke mbụ gachara, i gosila njikọ, ọ bụghị nbibi.
Kpebisie ike n'agbụ ahụ megide data nke gị. Ihe mgbagwoju anya: otu kristal ma ọ bụ nyocha biophysical na-egosi ebumnuche, PROTAC na E3 ligase n'otu mgbakọ. Ebe obibi: a na-agụ ozugbo ma ọ bụ na-apụtaghị ìhè na ebumnuche n'onwe ya na-enweta ubiquitin. Ndabere Proteasomal: nnapụta site na proteasome inhibitor. Ike na uko ụlọ: DC50 na Dmax sitere na otu usoro nzaghachi dose ahụ.
Njikọ nke atọ bụ nke a na-amalikarị, na ọ dị ọnụ ala imechi. Na ọrụ peptide cyclic, Ọnwụ PD-L1 na 2.5 µM mgbe 4 MG132 gbochiri awa, nke bụ ihe na-ekewa nbibi na mmetụta ntụgharị nke ala (Oke na Immunology, 2023). Enwere ike igosi ntinye aka n'otu ụzọ ahụ: Nnwale mgbanwe okpomọkụ cellular kpaliri DHHC3 site na 49 Celsius C na mkpụrụ ndụ anaghị agwọta 55 Celsius C n'ime sel ndị a na-agwọ peptide, na-egosi na ngwakọta ahụ erutela protein tupu a tụọ mmebi ọ bụla (Oke na Immunology, 2023).
Chaatị ahụ bụ arụmụka kachasị ike n'ime edemede a maka ịgwọ ihe E3 dị ka ihe na-agbanwe agbanwe kama ịtụgharị uche n'azụ.. Ịgbanwe CRBN maka VHL, na otu warhead chemistry, kwagara DC50 site na 0.103 µM na 1.92 µM, na ogwe aka IAP ka 7.530 µM (Ọnwụ Cell & Ọrịa, 2024). Ihe fọrọ nke nta ka ọ bụrụ iwu abụọ nke ịdị ukwuu na-ekewa ogwe aka kacha mma na nke kacha njọ n'otu nyocha ekwentị.
Ugbu a ọdịiche. Otu usoro ahụ na-akọ ụkpụrụ DC50 mana enweghị Dmax, ya mere, ike na-atụnyere n'ofe ogwe aka ebe elu ụlọ nke mmebi adịghị (Ọnwụ Cell & Ọrịa, 2024). Ngwakọta nwere ike ịdị ike ma ka na-ahapụ ọtụtụ n'ime ebumnuche ahụ guzoro. Mgbe ị na-enye ngwugwu sitere na kemistri gaa na bayoloji, rịọ maka usoro nzaghachi dose zuru ezu, ọ bụghị otu nọmba: nkwado nyocha ọrụ pụtara mgbanaka, njikwa nnapụta, na nyocha njikọ ọnụ, n'ihi na nke ahụ bụ ihe onye nleba anya ga-ajụ maka mmebi HIF-1a ma ọ bụ ihe ọ bụla ọzọ ị na-ebu n'ihu.
Oke ikuku oxygen na ikpe arịlịka
Arịlịka cyclic peptide PROTAC na-eweghachi mmebi nke HIF-1a gbadoro anya VHL nke ọma na 3% O₂, na egosighi nbibi net na 1% O₂. Nke ahụ abụghị ọdịda ike. N'okpuru ọnọdụ a kọrọ, onye na-eweda ala na-anọgide na-etinye aka- na nbibi-zuru oke na 1% O₂, mana nrụgharị nke ebumnuche ahụ na-ewepụ mkpochapụ, ya mere ọdọ mmiri ahụ kwụ ọtọ adịghị ada (JACKS, cyclic Peptide PROTACs weghachi VHL-Mediated HIF-1α mmebi na Hypoxia, 2026).
Gụọ nke ahụ dị ka iwu imewe karịa ederede ala ala ala: A na-atụgharị agụ nbibi naanị megide ọnụego resynthesis nke ebumnuche n'otu ọnọdụ cellular. A DC50 tụrụ n'otu ikuku oxygen adịghị ebufe ọzọ, n'ihi na ọnụọgụgụ ị tụrụ bụ nha nha nha, ọ bụghị mkpochapụ mgbe niile.
Tupu itule njikọ gị na DC50 ebipụtara, kwadoro esemokwu oxygen, eriri cell, na omume resynthesis nke ebumnuche n'okpuru otu ọnọdụ ahụ.
Echiche na-ezighị ezi ndị na-eri oge mmemme
Njehie mkpebi anọ na-akpata ihe ka ukwuu n'ime oge furu efu na mmemme imewe cyclic peptide PROTAC. Onye ọ bụla na-anọchi nha dị ọnụ ala karịa ajụjụ mmemme chọrọ azịza.
Ịdị ọcha HPLC dị elu abụghị njikọ ziri ezi. Otu ọnụ ọgụgụ dị nkọ na 95% na-agwa gị na ihe ahụ bụ otu n'ime otu usoro nchọpụta. Ọ naghị agwa gị onye njikọ ahụ na-anọdụ ala na ihe fọdụrụ echere, na stereochemistry lanarịrị conjugation, ma ọ bụ na E3 ligand adịghị. Ihe ndozi bụ njirimara orthogonal: LC-MS maka nkwenye oke, na usoro chromatographic nke abụọ ma ọ bụ spectroscopic nke na-ekewa conjugate na isomers ọnọdụ ya..
Enwetaghị njigide ebumnuche echekwabara. Nnwale na-ejikọta ọnụ na-akọ na ọ nọ. Mweda n'ala na-achọ ebe niile, njikọ aka proteasomal na mfu ebumnuche, Ọ dịghị nke ọ bụla n'ime ihe njide agụpụta na-achọpụta. Ndozi ahụ bụ ịgwọ njide dị ka ọnụ ụzọ ámá, ọ bụghị njedebe, na ịchọ nleba anya protein quantification tupu na-ekwu nbibi.
Ihe mgbagwoju anya nke ternary na nyocha biophysical abụghị mmebi nke cellular. Nhazi mgbagwoju anya nke ternary dị mkpa mana ezughị oke; mgbagwoju siri ike ka nwere ike ịla n'ebe niile. Ndozi bụ iburu nkwupụta ahụ n'ime sel ma tụọ ọkwa protein ezubere iche ozugbo.
DC50 na-enweghị Dmax bụ foto ike nke akụkụ. Ike na oke bụ ihe dị iche iche, na ngwakọta nke na-eweda ala 40% nke ebumnuche na saturation bụ echiche dị iche na nke na-ekpochapụ 90%. Ndozi bụ ịkọ akụkọ abụọ ahụ, mgbe niile, site na otu usoro nzaghachi dose ahụ.
Usoro mkpebi maka ntụgharị
Gbaa akwụkwọ ndenye ego ise ndị a iji megide mmemme nke gị. Nke ọ bụla nwere ọnọdụ ọdịda agbakwunyere, na onye ọ bụla dị ọnụ ala karịa idozi tupu nke ọzọ.
-
Kpọọ onye ndoro-ndoro ochichi wepụrụ vectors n'ụzọ doro anya, ọ bụghị site na nyocha. Gosipụta otu ihe mgbochi cyclic na onye njikọ na ọnọdụ abụọ ma ọ bụ atọ dị iche iche, na-agba ọsọ conjugate usoro site na ebumnuche-jide nyocha, ka ọkwa ọkwa họrọ onye meriri. Ụdị ọdịda: Ịhọrọ vector nke kachasị dị na ihe nlereanya ahụ wee chọpụta mgbe ọ gbasasịrị na njide adịkwaghị.
-
Kpebie ụzọ tupu ịmee njikọ ahụ. Nkwekọrịta ngwọta na resin na-ekpebi ole ihe ize ndụ epimerization ị na-ebu, yabụ were ya dị ka mkpebi ụzọ kama ịkachasị oge. Ụdị ọdịda: conjugate nke na-asachapụ nke ọma mana tụfuru stereochemistry nke njide data dabere na.
-
Mee ka ọ dị ọcha, wee mara orthogonally. RP-HPLC ịdị ọcha na nkwenye oke na-aza ajụjụ dị iche iche, na ọ dịghị onye na-akọ banyere conformation. Ụdị ọdịda: ntọhapụ ntọhapụ nke otu ụzọ na-agafe ogbe ezighi ezi.
-
Nyochaa mpịachi tupu ị mefuo mmefu ego nyocha. Dichroism okirikiri, NMR, ma ọ bụ usoro-enwe mmetụta na-adịgide adịgide na-agụ akwụkwọ na-egosi na conjugate ka na-enwe nkwekọrịta e bu n'obi.
-
Wụpụta agbụ nyocha tupu ị na-ekwu nbibi. Usoro mgbagwoju anya nke atọ, lekwasịrị anya njikọ aka, Peptides sịntetik na a mweda readout bụ atọ dị iche iche na-ekwu, na nsonaazụ ọnụọgụ abụọ na-akwado naanị nke mbụ.
Ntugharị igodo： Nkwenye nkwenye bụ ihe mmemme na-amakarịkarị. Data ịdị ọcha na nkwenye oke enweghị ike ịgwa gị ma conjugate apịaji nke ọma, ya mere otu ogbe nwere ike ịgafe ọnụ ụzọ nyocha ọ bụla ma ka na-ada n'ọrụ.
Usoro dị mkpa karịa otu nzọụkwụ ọ bụla: mmemme nke na-ebute vectors nke mbụ ma na-achọpụta ngbanwe tupu ọrụ nyocha na-ezere ịmegharị njikọ nke ọ maralarị..
Nzọụkwụ ọzọ
Ọ bụrụ na mmemme imewe cyclic peptide PROTAC dị na map ụzọ gị, nzọụkwụ ọzọ bara uru bụ mkparịta ụka na-enweghị atụ karịa mkpebi ịzụrụ. Weta ihe atọ: usoro arịlịka gị na data nhazi ọ bụla, vector ọpụpụ ị họrọla ma ọ bụ ndị na-azọ ọkwa ị na-atụ, na nyocha nke agụpụta ndị otu gị ga-anabata dị ka ihe akaebe nke mmebi iwu. Ntinye atọ ndị ahụ na-ekpebi ma ntụgharị ahụ ọ bụ nrụnye njikọ kwụ ọtọ ma ọ bụ nrụgharị nke chọrọ kemistri ọhụrụ.
Maka otu ndị chọrọ njikọ na njirimara onye mmekọ, MOL Mgbanwe na-ekwupụta ike n'ofe usoro siri ike yana njikọ fermentation microbial, a na-achịkwa-gburugburu ọcha, HPLC/MS na ịmụ nwa QC, na mg-to-kg ọnụ ọgụgụ. Oke ahụ kacha dị mkpa mgbe mmemme conjugate na-esi n'ọ̀tụ̀tụ̀ ihe nyocha gaa n'ọ̀tụ̀tụ̀ nke usoro nnwale na-arụ ọrụ chọrọ.. Mmepụta Peptide
Ntugharị igodo： Ihe nrụpụta akọwara ebe a bụ reagent nyocha. Ntụgharị asụsụ ụlọ ọgwụ ọ bụla chọrọ nkwado onwe ya, ọ nweghịkwa ihe dị na ntuziaka a na-anọchi anya nkwenye nyocha na nke ndu gị.
Nkpughe: nzukọ onye edemede na-enye njikọ peptide na njirimara njirimara nke ụdị a tụlere n'isiokwu a.
Kwurịtara mmemme conjugate omenala. Kekọrịta usoro arịlịka gị, vector ọpụpụ ebumnuche na njedebe nyocha achọrọ, ma rịọ ngwungwu akwụkwọ nyocha (usoro ịdị ọcha, gradient, Nkwenye MS na mpịachi data) n'akụkụ oku na-aga n'ihu. Malite mkparịta ụka mmemme.
Ajụjụ a na-ajụkarị
Kedu ihe m ga - eme ma ọ bụrụ na enweghị nhazi co-crystal nke peptide cyclic m jikọtara na ebumnuche?
Kpọọ onye ndoro-ndoro ochichi n'ụzọ doro anya kama ichere nhazi. Gosipụta peptide na njikọ na ihe fọdụrụ onye ọ bụla, wee tụọ n'usoro: echedoro mmekọrita ebumnuche, ternary-mgbagwoju anya e guzobere na E3 ligase, na mmebi cellular. Ọkwa nke na-anabata nnọchi na-edobe mmekọrịta ya; onye na-anaghị eru eru. Mekọrịta mmekọrịta dị warara-nhazi-mmekọrịta n'ọkwa onye ndoro-ndoro anya dị ka mgbama nkwụsị, n'ihi na ọ ga-abụ na e liri vector ọpụpụ na interface njikọ.
Ọ bụ onye njikọ ogologo oge ka mma maka peptide PROTAC cyclic?
Mba. Ogologo njikọ na ihe mejupụtara na-agbanwe geometry ternary-complex, na geometry ahụ na-akpali ike n'akụkụ abụọ ahụ. Nke a na-ekwukarị 5-15 mpio atọm na-abịa site na mkpegharị nke abụọ nke enweghị ike ịgụ ibe akwụkwọ mbụ ya na ọsọ a, ya mere were nso nso a kapịrị ọnụ dị ka echiche mmalite iji nwalee gafee obere usoro, ọ bụghị nkọwapụta iji chepụta megide.
Kedu ka m ga-esi mata ọdịiche dị n'etiti epimerization na nsogbu mpịachi na data nyocha m?
Jiri ụzọ orthogonal, n'ihi na otu RP-HPLC isi ọnụ ọgụgụ enweghị ike ikewapụ ụdị ọdịda abụọ ahụ. Chiral LC ma ọ bụ NMR na-edozi stereochemistry na ihe fọdụrụ emetụtara; okirikiri dichroism na NMR na-akọ banyere ngbanwe ngwọta. Epimerization bụ ihe egwu ama ama nke kemịkalụ njikọ kama ịbụ ebe onye na-ere ahịa, yabụ mgbe peptide dị ọcha na mpịachi ma na-ele anya nke ọma na ọrụ ka na-agbada, Gbaa nyocha stereochemical tupu ịmegharịa njikọ ahụ.
Gịnị bụ opekempe assay atọrọ na-ekwu nbibi kama mgbochi?
nha anọ: ternary-mgbagwoju anya nhazi, lekwasịrị anya n'ebe niile, ndabere proteasomal kwadoro site na ụdị nnapụta MG132, yana ọnụọgụ DC50 na Dmax sitere na usoro nzaghachi dose. Ihe mgbagwoju anya naanị ezughị oke, ebe ọ bụ na ijikọ na-enweghị mbufe ebe ọ bụla na-egosi na ọ dịghị ihe ọ bụla gbasara mmebi. DC50 na Dmax naanị bụ phenotypic: ha na-egosi na ebumnuche ahụ furu efu na-egosighi proteasome kpatara ya. Kọọ ihe nhazi ọnụ, ma kwupụta ahịrị cell na oge oge maka nke ọ bụla.
