Diseño y estudios de RMN de péptidos cíclicos dirigidos al dominio N-terminal de la proteína tirosina fosfatasa YopH

Informamos sobre el diseño y evaluación de nuevos péptidos cíclicos dirigidos al dominio N-terminal de la proteína tirosina fosfatasa YopH de Yersinia.. Se han diseñado péptidos cíclicos a partir de una secuencia corta de la proteína SKAP-HOM [DE(pY)DDPF (pY = fosfotirosina)], y todos contienen el motivo DEZXDPfK (donde Z es una fosfotirosina o un mimético de fosfotirosina no hidrolizable, X es un ácido aspártico o una leucina y f es una d-fenilalanina). Estos péptidos presentan una arquitectura de "cabeza a cola", permitiendo la ciclación mediante la formación de un enlace amida entre las cadenas laterales del primer ácido aspártico y los residuos de lisina. Se han llevado a cabo estudios de perturbación del cambio químico para controlar la unión de estos péptidos al dominio N-terminal de YopH.. Los péptidos que contienen un resto fosfotirosina exhiben afinidades de unión en el rango micromolar bajo.; la sustitución de la fosfotirosina por uno de sus derivados no hidrolizables reduce drásticamente las afinidades de unión. Estos estudios preliminares pueden allanar el camino para el descubrimiento de ligandos basados ​​en péptidos más potentes y selectivos del dominio N-terminal de YopH que podrían investigarse más a fondo por su capacidad para inhibir las infecciones por Yersiniae..