Peptidimuutokset
Isotooppimerkityt peptidit
Mikä on isotooppimerkityt peptidit?
Stabiili isotooppileimaus on kemiallinen reagenssi, jossa yhdisteen molekyylit sisältävät yhden tai useamman stabiilin isotooppiatomin ja jotka analysoidaan ja määritetään käyttämällä ainutlaatuisia merkkiominaisuuksia..
Stabiilit isotooppileimaustekniikat perustuvat siihen periaatteeseen, että reagoiva aine merkitään korvaamalla tietyt atomit isotoopilla, joka sitten saa reagoivan aineen käymään läpi reaktion ja havaitsee atomit neutroniluvun muutoksilla, joita voidaan seurata reaktioilla, aineenvaihduntareittejä tai soluja. Stabiili isotooppi (13C, 15N, 13C15N) leimattuja peptidejä käytetään yleisesti "kemiallisina tunnisteina" kvantitatiivisessa proteomiikassa biologisten näytteiden havaitsemiseen ja jäljittämiseen.. Kvantitatiivisissa proteomiikan menetelmissä käytetään pääasiassa korkean erotuskyvyn massaspektrometriaa isotooppileimattujen ja leimaamattomien peptidi-ionien tai peptidi-ionien erottamiseen, ja käyttävät havaittujen signaalien intensiteettiarvoja kvantitatiivisiin laskelmiin.
Vakaan isotooppimerkintätekniikan etuna on korkea herkkyys, yksinkertainen paikannus ja tarkka kvantifiointi, mikä saa isotooppien modifioinnit saamaan yhä enemmän huomiota lääketieteen ja biokemian alalla.
Isotooppimerkityt peptidit
Tarkkuustyökalut tutkimukseen
Stabiilit isotooppileimatut peptidit syntetisoidaan korvaamalla tiettyjä atomeja luonnollisissa aminohapoissa raskailla isotoopeilla, kuten 12C:n korvaaminen 13C:lla, 14N ja 15N, tai 1H 2H:lla (deuterium). Nämä modifikaatiot johtavat isotoopilla merkittyihin yhdisteisiin, jotka säilyttävät samat fysiokemialliset ominaisuudet ja kemiallisen reaktiivisuuden kuin leimaamattomat vastineensa.. Tämä tekee niistä välttämättömiä monissa tieteellisissä sovelluksissa, mukaan lukien massaspektrometria, NMR-tutkimukset, ja farmakokineettiset analyysit.
|
Aminohappo
|
Isotooppi
|
Massaero leimaamattomaan AA:han
|
|---|---|---|
|
Alaniini |
U- 13C3, U-15N |
+4 Ja |
|
Arginiini |
U- 13C6, U-15N4 |
+10 Ja |
|
Leusiini |
U- 13C6, U-15N |
+7 Ja |
|
Lysiini |
U- 13C6, U-15N2 |
+8 Ja |
|
Fenyylialaniini |
U- 13C9, U-15N |
+10 Ja |
|
Proliini |
U- 13C5, U-15N |
+6 Ja |
|
Valine |
U- 13C5, U-15N |
+6 Ja |
Suositellut lainaukset
Stabiilin isotooppileimauksen käyttö edistääksemme ymmärrystämme Alzheimerin taudin etiologiasta ja patologiasta
Stabiili isotooppileimaus massaspektrometrialla (MS)-perustuvasta proteomisesta analyysistä on tullut tehokas strategia proteiinin vakaan tilan tasojen arvioimiseksi, proteiinin kiertokulkua, ja proteiinin lokalisointi. Näiden analyysialustojen soveltaminen neurodegeneratiivisiin sairauksiin voi paljastaa uusia näkökohtia näiden tuhoisten sairauksien etiologiassa. Äskettäin, stabiileja isotooppeja-MS:ää on käytetty Alzheimerin taudin varhaisten patologisten mekanismien tutkimiseen (ILMOITUS) AD:n kaltaisen patologian hiirimalleilla. Tässä arvostelussa, teemme yhteenvedon näistä stabiileista isotooppi-MS-kokeellisista suunnitelmista ja viimeaikaisesta sovelluksesta AD-patologian yhteydessä. Kuvaamme myös tämänhetkisiä ponnistelujamme ydinmagneettisen resonanssin hyödyntämiseksi (NMR) stabiilien isotooppileimattujen amyloidifibrillien analyysi AD-hiirimallin aivoista. kollektiivisesti, nämä menetelmät tarjoavat uusia mahdollisuuksia tutkia proteomimuutoksia AD:ssa ja muissa hermostoa rappeutuvissa sairauksissa selvittämällä mekanismeja hoitoon ja ehkäisyyn..
Aiheeseen liittyvät peptidien muokkauspalvelut
peptidiglykosylaatio
peptidiglykosylaatio
Peptidiglykosylaatio on kovalenttinen modifikaatio, joka voi mahdollisesti parantaa peptidien fysikaalis-kemiallisia ominaisuuksia
Lue lisääpeptidin fosforylaatio
peptidin fosforylaatio
Serinillä saattaa esiintyä fosforalaatiota (S, olla), Treoniini (T, Thr) ja tyrosiini (Y, Tyr) sivuketjut fosfoesterisidoksen muodostumisen kautta
Lue lisääNidotut peptidit
Nidotut peptidit
Kahden ei-luonnollisen aminohapon, jotka sisältävät α-metyyliä, lisääminen, α-alkenyyliryhmät peptidiketjujen kiinteän faasin synteesin aikana.
Lue lisääSyklinen peptidi
Syklinen peptidi
Peptidien syklisaatio lisää peptidien konformaatiostabiilisuutta (suhteessa niiden lineaarisiin analogeihin) ja se on yleinen strategia peptidien kehittämisessä.
Lue lisääpeptidimuunnos
Laaja kokemus peptidien modifioinnista, tarjoaa useita käyttökelpoisia mahdollisuuksia peptiditutkimukselle.
