Peptidimuutokset
peptidin fosforylaatio
Mikä on peptidifosforylaatio?
Solujen fosforylaatio on modifikaatio, joka voi muuttaa aktiivisuutta, sitovia ominaisuuksia, tai proteiinien tai entsyymien lokalisaatio soluun. Se on myös tärkeä säätelyprosessi, jolla on kriittinen rooli monissa sairauspatologioissa, mukaan lukien tulehdus, syöpä, neurologiset ja aineenvaihduntahäiriöt. Entsyymit, jotka fosforyloivat proteiineja tietyissä aminohappotähteissä (esim., tyrosiini, seriini, ja treoniini) niitä kutsutaan kinaaseiksi. Entsyymejä, jotka poistavat fosfaattiryhmän hydrolyysillä, kutsutaan fosfataaseiksi. Koska fosforylaatio on keskeinen useimmille signaalinsiirtoreiteille, fosforyloidut peptidit (eli, fosfopeptidit) käytetään proteiinikinaasien ja fosfataasien analysointiin toukokuun solumäärityksissä.
Fosforyyliryhmien tyypillinen sijainti
Serinillä saattaa esiintyä fosforalaatiota (S, olla), Treoniini (T, Thr) ja tyrosiini (Y, Tyr) sivuketjut fosfoesterisidoksen muodostumisen kautta. CPC Scientific voi syntetisoida fosfopeptidejä ja sisällyttää yksittäisiä tai useita fosfoseriiniyhdistelmiä (pS), fosfotreoniini (pT), tai fosfotyrosiini (pY).

Fosfoseriini
Fosfoseriini on lyhyt peptidi tai peptidiketju, joka sisältää fosforyloitua seriiniä (pSer), eli, peptidifragmentti, jossa hydroksyyliryhmä (-VOI) seriinitähteen on modifioitu fosfaattiryhmällä (-PO₄²-).

Fosfotreoniini
Fosfotreoniini on lyhyt peptidi tai polypeptidiketju, joka sisältää fosfotreoniinia (pThr), eli. peptidi, jossa hydroksyyliryhmä (-VOI) Treoniinitähteestä on modifioitu fosfaattiryhmä (-PO₄²-).

Fosfotyrosiini
Fosfotyrosiini on lyhyt peptidi tai polypeptidiketju, joka sisältää fosfotyrosiinia (pTyr), eli. peptidi, jossa fenolinen hydroksyyliryhmä (-VOI) tyrosiinista (Tyr) jäännös on modifioitu fosfaattiryhmällä (-PO₄²-).
Suositellut lainaukset
PRMT5 C-terminaalin fosforylaatio moduloi 14-3-3/PDZ-vuorovaikutuskytkintä*
PRMT5 on ensisijainen entsyymi, joka vastaa symmetrisen dimetyyliarginiinin laskeutumisesta nisäkässoluihin. Yritetään ymmärtää, kuinka PRMT5:tä säädellään, tunnistimme treoniinin fosforylaatiokohdan C-terminaalisen häntämotiivin sisällä, joka on Akt/seerumin kohteena- ja glukokortikoidilla indusoituvat kinaasit. Tutkiessaan tämän translaation jälkeisen muunnelman toimintaa, huomasimme hurjasti, että sen vapaa C-terminaalinen häntä sitoo PDZ-domeeneja (kun se on fosforyloimaton) ja 14-3-3 proteiinit (fosforyloituneena). Pohjimmiltaan, fosforylaatiotapahtuma C-terminaalin hännän viimeisten tähteiden sisällä synnyttää translaation jälkeisen modifikaatiosta riippuvan PDZ/14-3-3-vuorovaikutuksen "kytkimen". PRMT5:n C-terminaalinen motiivi tarvitaan plasmamembraanien assosiaatioon, ja tämän kytkentäkapasiteetin menetys ei ole yhteensopivaa elämän kanssa. Tämä signalointiilmiö raportoitiin äskettäin HPV E6 -onkoproteiinille, mutta sitä ei ole vielä havaittu nisäkäsproteiineilla. Tutkia PDZ/14-3-3-kytkennän yleisyyttä signaalinsiirrossa, rakensimme proteiinidomeenin mikrosirun, joka sisältää PDZ-domeeneja ja 14-3-3 proteiinit. Olemme käyttäneet tätä mikrosirua tutkiaksemme pienen ryhmän ehdokasproteiinien C-terminaalisia häntäitä ja tunnistaneet ERBB4:n, PGHS2, ja IRK1 (sekä E6 ja PRMT5) tämän signalointimoodin mukaiseksi, viittaa siihen, että PDZ/14-3-3-vaihto voi olla laaja biologinen paradigma.
Aiheeseen liittyvät peptidien muokkauspalvelut
peptidiglykosylaatio
peptidiglykosylaatio
Peptidiglykosylaatio on kovalenttinen modifikaatio, joka voi mahdollisesti parantaa peptidien fysikaalis-kemiallisia ominaisuuksia
Lue lisääpeptidin fosforylaatio
peptidin fosforylaatio
Serinillä saattaa esiintyä fosforalaatiota (S, olla), Treoniini (T, Thr) ja tyrosiini (Y, Tyr) sivuketjut fosfoesterisidoksen muodostumisen kautta
Lue lisääNidotut peptidit
Nidotut peptidit
Kahden ei-luonnollisen aminohapon, jotka sisältävät α-metyyliä, lisääminen, α-alkenyyliryhmät peptidiketjujen kiinteän faasin synteesin aikana.
Lue lisääSyklinen peptidi
Syklinen peptidi
Peptidien syklisaatio lisää peptidien konformaatiostabiilisuutta (suhteessa niiden lineaarisiin analogeihin) ja se on yleinen strategia peptidien kehittämisessä.
Lue lisääpeptidimuunnos
Laaja kokemus peptidien modifioinnista, tarjoaa useita käyttökelpoisia mahdollisuuksia peptiditutkimukselle.