Peptidimuutokset
FRET-peptidi
Mikä on FRET-peptidi?
FRET-peptidileimauksessa on luovuttajamolekyyli ja vastaanottaja (räjähdysaine) molekyyli. Useimmissa tapauksissa, luovuttaja- ja vastaanottajaparit ovat kaksi eri väriainetta. Jos vastaanottaja on ei-fluoresoiva väriaine (räjähdysaine), fluoresoivasta luovuttajasta siirretty energia muunnetaan molekyylivärähtelyiksi. Kun FRET lopetetaan (erottamalla luovuttaja ja vastaanottaja), luovuttajan fluoresenssin lisääntyminen voidaan havaita. Kun sekä luovuttaja- että vastaanottajavärit ovat fluoresoivia, siirretty energia säteilee pidemmän aallonpituisena valona, mikä mahdollistaa muutosten mittaamisen luovuttajan ja vastaanottajan fluoresenssin intensiteettisuhteessa. Tehokas FRET-purkaus, fluorofori- ja murtoainemolekyylien on oltava lähellä toisiaan (~10-100 Å) ja murtoaineen absorptiospektrin on oltava päällekkäinen fluoroforin emissiospektrin kanssa. Luovuttajan fluoresenssispektrin ja murtoaineen absorptiospektrin huolellinen vertailu on tarpeen suunniteltaessa donori-purkausaine FRET-järjestelmiä.
FRET-peptiditiede
FRET-peptidien tärkeimmät edut:
· Entsymaattisten reaktioiden ja proteiiniaktiivisuuden reaaliaikainen seuranta.
·Erittäin korkea tunnistusherkkyys ainutlaatuisen läheisyyspohjaisen energiansiirron ansiosta.
·Monipuolisuus in vitro ja in vivo -sovelluksiin, tarjoaa tietoa monimutkaisista biologisista prosesseista.
|
Fluorofori
|
Sammuttaja
|
Entinen lahjoittaja
|
|---|---|---|
|
Abz |
Dnp 2,4-dinitrofenyyli |
320 nm/420 nm |
|
Abz |
Dnp 2,4-dinitrofenyyli |
320 nm/420 nm |
|
Mca |
Dnp 2,4-dinitrofenyyli |
325 nm/392 nm |
|
Trp |
Dnp 2,4-dinitrofenyyli |
280 nm/360 nm |
|
FAM |
Dabcyl4-([4'-dimetyyliamino)fenyyli]voi)bentsoyyli |
492 nm/517 nm |
|
Luciferin keltainen |
Dabsyl4(Dimetyyliamino)atsobentseeni-4'-sulfonyyli |
430nm/520 nm |
Suositellut lainaukset
Ultraherkät kasvaimeen tunkeutuvat proteaasiaktiivisuuden nanosensorit
Kyky tunnistaa syöpäleesiot endogeenisillä biomarkkereilla rajoittuu tällä hetkellä halkaisijaltaan ~1 cm:n kasvaimiin. Ilmoitimme äskettäin eksogeenisesti annetusta kasvaimeen tunkeutuvasta nanosensorista, joka irtoaa, vasteena kasvainspesifisille proteaaseille, peptidifragmentteja, jotka voidaan sitten havaita virtsasta. Tässä, raportoimme optimoinnista, farmakokineettisen matemaattisen mallin perusteella, peptidisubstraattien pinnan esittely sekä tehostaa kohdeproteaasin pilkkoutumista että minimoi kohdealueen ulkopuolisen pilkkoutumisen, ja nanosensorien toiminnallisuudesta kasvaimeen tunkeutuvilla ligandeilla, jotka aktivoivat aktiivisia kuljetusreittejä aktivoidakseen kasvaimen mikroympäristössä. Tuloksena saatu nanosensori erotti alle 5 mm:n vauriot ihmisen epiteelisoluissa ja havaitsi kyhmyjä, joiden mediaanihalkaisija oli pienempi kuin 2 mm munasarjasyövän ortotooppisessa mallissa. Osoitamme myös virtsan signaalinmuodostuksen parantuneen reseptorista riippuvaisen spesifisyyden kolorektaalisten maksametastaasien immunokompetentissa mallissa, ja nanosensorien in situ -aktivointi ihmisen kasvaimen mikrosiruissa, kun ne on suunniteltu uudelleen fluorogeenisiksi tsymografiakoettimiksi.
Aiheeseen liittyvät peptidien muokkauspalvelut
peptidiglykosylaatio
peptidiglykosylaatio
Peptidiglykosylaatio on kovalenttinen modifikaatio, joka voi mahdollisesti parantaa peptidien fysikaalis-kemiallisia ominaisuuksia
Lue lisääpeptidin fosforylaatio
peptidin fosforylaatio
Serinillä saattaa esiintyä fosforalaatiota (S, olla), Treoniini (T, Thr) ja tyrosiini (Y, Tyr) sivuketjut fosfoesterisidoksen muodostumisen kautta
Lue lisääNidotut peptidit
Nidotut peptidit
Kahden ei-luonnollisen aminohapon, jotka sisältävät α-metyyliä, lisääminen, α-alkenyyliryhmät peptidiketjujen kiinteän faasin synteesin aikana.
Lue lisääSyklinen peptidi
Syklinen peptidi
Peptidien syklisaatio lisää peptidien konformaatiostabiilisuutta (suhteessa niiden lineaarisiin analogeihin) ja se on yleinen strategia peptidien kehittämisessä.
Lue lisääpeptidimuunnos
Laaja kokemus peptidien modifioinnista, tarjoaa useita käyttökelpoisia mahdollisuuksia peptiditutkimukselle.