Azịza ngwa ngwa
Onye mmekọ na-eziga usoro nwere B, J, ma ọ bụ X wee rịọ ụlọ nyocha ọzọ ka o megharịa nyocha ahụ. Ọnwụnwa ozugbo bụ iji dochie anya amachaghị…
Ndebiri Amino Acid - Chekwaa koodu na-enweghị isi na enweghị ọkọlọtọ
Blog Njikọ nke Peptides Onye mmekọ na-eziga usoro nwere B, J, ma ọ bụ X wee rịọ ụlọ nyocha ọzọ ka o megharịa nyocha ahụ. Ọnwụnwa dị ugbu a bụ iji ihe ndị a maara nke ọma dochie mkpụrụedemede ndị na-amaghị ama. Nke ahụ nwere ike jiri nwayọ gbanwee nleba anya na-ejighị n'aka ka ọ bụrụ usoro ziri ezi. Chaatị mbelata amino acid bara uru kwesịrị ịkọwa ihe akara na-enye gị ohere ikwubi, ihe na-anọgide na-edozibeghị, na nke usoro ndetu na-enye ya ihe ọ pụtara.
Ntuziaka a na-elekwasị anya na ndenye na-enweghị isi na nke na-adịghị mma kama ikwughachi amino acid iri abụọ niile. Ihe atụ nfefe a na-atụ anya ya bụ omume nkuzi, ebipụtaghị ọrụ usoro. Ebumnobi a bụ idobe ozi zuru oke maka ụlọ nyocha ọzọ iji wughachi nkọwa ahụ wee maa ngbanwe ọ bụla na-akwadoghị.
Malite na ihe dị iche: koodu na-edoghị anya na-akọwa ihe ọmụma ezughị ezu ma ọ bụ usoro ọzọ akọwapụtara; ihe fọdụrụ na-abụghị ọkọlọtọ nwere ike ịkọwa otu ụdị kemịkalụ na-abụghị nke mkpụrụedemede iri abụọ na nke fọdụrụ. Ọnọdụ ndị a chọrọ ndekọ dị iche iche. A naghị edozi nke ọ bụla n'enweghị nsogbu site na ịkọ nkọ site na leta kacha nso.
Gụọ akara a na usoro nrịbama
Nke RESID ọkwa FAQ depụtara akara mgbagwoju anya gụnyere B maka Asp/Asn, J maka Leu/Ile na Z maka Glu/Gln. Gụọ akara ọ bụla n'ime mgbakọ aha ya. Ihe agwa pụtara na nchekwa data ihe ndụ anaghị ewepụta ihe ụdị usoro ga-anabata ma ọ bụ ka ọ ga-esi sụgharịa agwa ahụ..
| Akara ma ọ bụ akara ngosi | Pụtara ikwado | Ihe ga-anọgide na-edoghị anya |
|---|---|---|
| B / Asx | Aspartic acid ma ọ bụ asparagine ambiguity, D ma ọ bụ N | Kedu ihe akaebe na-ahapụ ọnọdụ ahụ edozighi ya; ahọpụtala onye na-enweghị ihe ziri ezi |
| Z / Glx | Glutamic acid ma ọ bụ glutamine ambiguity, E ma ọ bụ Q | Ma nke a bụ ọrụ edozibeghị ma ọ bụ usoro ọzọ akọwapụtara nke ọma |
| J | Leucine ma ọ bụ isoleucine ambiguity na mgbakọ na-eji ya | Nkwekọrịta ọdabara na nkwado ngwaọrụ nnata |
| X | Fọdụrụ amaghị ama ma ọ bụ akọwapụtaghị ya n'okpuru mgbakọ ekwuputara | Mmachibido ọ bụla na ohere; echela mgbama nkwụsị ma ọ bụ otu oke |
| U / Nkeji | Selenocysteine dị ọcha | Nkwado na ngwanrọ nyocha yana mgbanwe kemịkalụ ọ bụla akọwapụtara |
| O / Pyl | Pyrrolysine | Ihe njirimara fọdụrụ n'ezie na ọgwụgwọ ya n'usoro na ngwanrọ nhazi |
| D / Asp megide D nhazi | Akwụkwọ ozi D na-achọpụta aspartic acid; onye nkọwa stereochemical D nwere ọrụ ọzọ | Kewapụ njirimara fọdụrụ na nhazi ya na akụkọ nrịbama doro anya |
Nke Akwụkwọ ntinye usoro-NCBI na-egosi ihe mere mkpụrụ akwụkwọ ji dị mkpa: ọ na-amata ọdịiche dị n'akụkụ mpụta, oghere na nkwụsị ntinye, na ntinye koodu ime. Ikpe, akara edemede na akara akwadoghị chọrọ ọgwụgwọ doro anya n'oge mbufe. Akwụkwọ ozi obere agaghị abụ naanị ntuziaka maka nhazi D naanị n'ihi na otu mpempe akwụkwọ mpaghara na-eji mgbakọ ahụ.
Mpempe akwụkwọ ozi atọ nwere ike imeziwanye ọgụgụ na-edozighị kemistri. Mbibiri dị ka “Lys emezigharịrị” ka chọrọ mgbanwe akọwapụtara na Ụlọ ọrụ saịtị. Aha dị mkpụmkpụ akọwapụtara nke ndị na-ebubata chọrọ njirimara kemịkalụ zuru oke ma ọ bụ ntụaka nhazi enweghị mgbagha, gụnyere nhazi ebe ọ dị mkpa.
Debe ejighị n'aka iche na ngwakọta anụ ahụ
Tụlee usoro echiche AGXK. Ụlọ nyocha na-anata maara na enyeghị ọnọdụ nke atọ. Ọ maghị na ihe a na-enye bụ ngwakọta nke ihe fọdụrụnụ nke atọ nwere ike ime. Ihe na-ejighị n'aka na ndekọ na heterogeneity dị na nlele ahụ bụ nkwupụta dị iche iche na-achọ ihe akaebe dị iche iche.
Ọ bụrụ na nyocha emechara ebelata X ka leucine ma ọ bụ isoleucine, dekọọ ihe ndị ọzọ akwadoro na njedebe nke usoro ahụ. Ihe fọdụrụ abụọ ahụ na-ekekọrịta ihe mejupụtara elementrị, ya mere mass na-adịghị emebi emebi anaghị ahọrọ n'etiti ha. Ndekọ edegharịrị kwesịrị ịkọwa ihe emelitere yana ihe a na-edozibeghị; o kwesịghị ịkpọsa usoro achọpụtara kpamkpam.
Ọrụ echiche dị iche iche kpachapụrụ anya jiri AGIK tụnyere AGLK. Ndị a bụ ebumnuche abụọ akọwapụtara, onye ọ bụla nwere njirimara nke ya, ihe atụ akụkọ ihe mere eme, na nyocha Peptides akpọrọ ndekọ. Ide ha abụọ dị ka AGJK nwere ike ịdị mma maka ịkparịta ụka ezinụlọ, mana ọ na-efunahụ ihe dị mkpa maka iwu dị iche iche ma ọ bụ nsonaazụ nsonaazụ.
Maka B na Z, Nhọrọ ndị a na-eme ntuli aka anaghị ekere otu ihe mejupụtara. Ngụkọta ọnụ ọgụgụ mmadụ kwesịrị ikwupụta njirimara onye ndoro-ndoro anya ma ọ bụ kọwapụta usoro ndị ọzọ agbakọtara iche n'okpuru usoro akọwapụtara. Ịnye nkezi na-edeghị akwụkwọ n'ọnọdụ enweghị mgbagwoju anya nwere ike ịmepụta ọnụọgụ na-akọwaghị nke ọ bụla n'ime mkpụrụ ndụ echere.. amụma nzuzo
Mmega-nhazi nke onye ndoro-ndoro ochichi. Ka e were ya na ndekọ echiche ABBA nyere ikike D ma ọ bụ N n'onwe ya na B nke ọ bụla. Usoro ntuli aka anọ ya bụ ADDA, DNA, GỊ na ANNA. Ọ bụrụ na ihe akaebe nnwale na-enye naanị ụzọ DD ma ọ bụ NN ejikọtara ọnụ, Ntọala ekwenyere nwere usoro abụọ. Ide BB naanị enweghị ike ichekwa njikọ ahụ. Tinye ihe mgbochi ma ọ bụ depụta aha ndị anabatara kama ịmebe ngwakọta ọ bụla ozugbo.
Iji ụkpụrụ fọdụrụnụ monoisotopic dị na Tebụl uka ExPASy, dochie N site D na-agbanwe onye ndoro-ndoro site na 115.02694 - 114.04293 = 0.98401 Da na-eji ihe ntinye okirikiri. ADNA na ANDA nke ọ bụla nwere otu D na otu N, ya mere mkpokọta ha na-adaba adaba n'agbanyeghị usoro fọdụrụnụ dị iche iche. Ọbụna mkpokọta mkpokọta kwekọrọ na ihe mejupụtara ahụ agaghị ekpebi ọkwa nke na-ebu D. Ya mere mbelata nke dabere na oke ga-ejigide nghọtahie ọnọdụ.
Ọnụọgụ onye ndoro-ndoro ochichi abụghị nkesa puru omume. Usoro anọ anabatara anaghị enwe ozugbo 25% ohere nke ọ bụla, na akara nchekwa data ambiguity adịghị akọwapụta ngwakọta nhata maka ịzụrụ. Ihe puru omume ga-achọ ihe nlere anya ọnụ ọgụgụ ekwuputara yana nkwado; nha ngwakọta ga-achọ nkwadebe anụ ahụ ma ọ bụ nha. Debe ha abụọ iche na usoro ohere dị mfe.
Ọdịiche a dị mkpa na nyocha deamidation. Ịchọta oke na otu D agbakwunyere na mpaghara D/N na-edoghị anya egosighi n'onwe ya na nchekwa ahụ gbanwere N mbụ ka ọ bụrụ D.. Edobebeghị ọrụ usoro mmalite, na ọnọdụ dị iche iche nwere ike ịkekọrịta mkpokọta ahụ. Mkpesa nbibi chọrọ ihe akaebe gbasara steeti mmalite na mgbanwe n'oge, kama emeso otu nkọwa anabatara dị ka ntọala edere ede.
Ọ bụrụ na ngwa nchọta enweghị ike ichekwa mmachi nkwonkwo, jigide ndepụta ndị ndoro-ndoro ochichi zuru oke na mpụga ngwá ọrụ ahụ wee kpọọ nso nsonye ebubatara. Ọdịmma ọchụchọ nwere ike gbasaa ma ọ bụ mebie ohere ahụ. Kpesa akụkọ na-adaba adaba n'ezie ekwenyere tupu ịme nkwubi okwu usoro-usoro.
Enwere ike idozi usoro n'ụzọ zuru ezu mgbe saịtị ngbanwe na-anọgide na-ejighị n'aka. Debe ihe ndị ahụ ejighị n'aka iche: otu na-eche nke fọdụrụ dị ugbu a, ọzọ gbasara nke njikọ ma ọ bụ atọm na-ebu mgbanwe ahụ. Ihe ndetu nwere usoro ejighi n'aka doro anya nwere ike ichekwa ihe akaebe; ịhọrọ saịtị ziri ezi naanị iji meju ebe nchekwa data achọrọ na-agbakwunye ozi anaghị akwado.
Opekempe ndekọ mkpa ụlọ nyocha ọzọ
Jikwaa ndekọ enwetara dị ka isi mmalite na-enweghị mgbanwe wee mepụta ụdị atụgharịrị dị iche. Maka ABBA, chekwaa ọnọdụ abụọ ahụ na-enweghị isi, ihe ndị ọzọ ekwenyere na nke ọ bụla, na mgbochi nkwonkwo ọ bụla. Nke a na-eme ka onye nyocha mechara mata ọdịiche ọhụụ nnwale sitere na nhọrọ ndị ụkọchukwu emere ka ọ gafee onye mbubata.
| Mpaghara achọrọ | Ihe atụ nke nkọwa bara uru | Nsonaazụ ma ọ bụrụ na-anọghị |
|---|---|---|
| Nkọwa nke usoro | Ndekọ isi mmalite, ntughari, ihe nlele nlele, na ụbọchị nkọwa | Enweghị ike ijikọ usoro atụgharịrị na ihe izizi |
| Alphabet na ntụzịaka | Mgbakọ ọkwa aha; usoro edere N ruo C | Enwere ike ịgụhie ihe akara ngosi na usoro fọdụrụnụ |
| Maapụ nọmba | Ma ọnọdụ na-ezo aka na mbido, tozuru okè yinye, ma ọ bụ iberibe sịntetik | Enwere ike ịnye mgbanwe maka ihe fọdụrụ anụ ahụ na-ezighi ezi |
| Ọkwa edozibeghị | Ọnọdụ, ekwere ọzọ, ihe akaebe, na ajụjụ a na-edozibeghị | Nhazi pụrụ iche ma ọ bụ usoro ihe ọmụma pụrụ iche nwere ike bụrụ nke na-ezighi ezi |
| Chemistry ebumnuche zuru ezu | Termini, nhazi, isotope aha, njikọ n'akụkụ, na mgbanwe | Akwụkwọ ozi dakọtara enweghị ike ịmepụta mkpụrụ ndụ dakọtara |
| Ọnọdụ nyocha | Usoro, nkwadebe sample, njirisi ọrụ, na mkpa raw data | Onye nnata ahụ enweghị ike ịchọpụta ma ọpụrụiche a na-ekwu ọ̀ bụ ihe atụ |
| Akụkọ nkọwa | Onye gbanwere ọrụ, ihe kpatara ya, na faịlụ ndị dị n'okpuru ka emelitere | Enwere ike ịgwakọta nkọwa ochie na nke ọhụrụ n'otu nyocha |
Maka ihe fọdụrụ na-enweghị ọkọlọtọ, tinye ozi nhazi zuru oke iji chọpụta ihe fọdụrụ agbakwunyere karịa naanị ngọngọ ụlọ n'efu. Otu nchekwa dị n'oge njikọta abụghị akụkụ nke peptide ikpeazụ. N'otu aka ahụ, Ụdị nnu nke amino acid azụrụ adịghị n'onwe ya na-akọwapụta ihe mgbochi peptide ikpeazụ. Aminopeptide
Nhazi kwesịrị ubi nke ya. Nkọwa L/D abụghị otu na ntụzịaka ntụgharị anya, na ha ekwesịghị inwe mgbagwoju anya na koodu fọdụrụ nke otu mkpụrụedemede. Ebe ihe owuwu ahụ nwere stereocenters ndị ọzọ, kọwapụta ha kama iche na nkọwapụta alfa-carbon na-edozi ihe niile fọdụrụnụ.
Nyochaa ntinye aka na-ehichapụghị ozi edozibeghị
Mbụ, tulee usoro atụgharịrị ya na njirimara isi mmalite site na agwa, gụnyere nkọwa. Nke abụọ, gbasaa akara ndị na-amaghị ama site na iji mgbakọ ahụ ekwuputara. Nke atọ, mapụ ọnọdụ ọ bụla n'usoro ọnụọgụ ọnụọgụgụ. Nke anọ, nyochaa na njedebe na mgbanwe na-anọchi anya n'èzí mkpụrụedemede fọdụrụnụ nkịtị ebe ọ dị mkpa.
Wee nyochaa nzọrọ nyocha ọ bụla megide usoro a. Jụọ ma ihe akaebe na-egosi ọdịiche dị n'ihe mejupụtara ya, fọduru iji, saịtị mgbanwe, na nhazi. Ndị a bụ ajụjụ dị iche iche. Usoro nke na-eguzobe otu nwere ike ime ka onye ọzọ ghara idozi ya. Dekọọ mmachi na-esote nkwuputa a kama ili ya na nkwupụta izugbe.
Maka nfefe AGXK a na-atụ anya ya, mkpebi bara uru bụ: “Ihe fọdụrụ nke atọ emebeghị; enweghị ihe owuwu pụrụ iche nyefere maka njikọ; A na-edobe nyocha nke ndị ndoro-ndoro iche iche." Ọ bụrụ na oru ngo kpachara anya họrọ otu onye ga-eme nnwale nyocha, kpọọ ihe ahụ dị ka onye akwadoro emebere, ọ bụghị dị ka usoro izizi pụtara.
Mgbe nnwale na-achọ ndị ga-aga n'ihu, mepụta ndekọ imewe dị iche iche karịa ịdegharị nne na nna na-edozibeghị. Ọmụmaatụ, ADNA na ANDA nwere ike ịnweta ihe nchọpụta usoro dị iche iche ebe ha abụọ ka nwere njikọ na ndekọ akaebe ABBA. Nsonaazụ n'aka otu onye nyocha wee nwalee molekul ahụ emebere; ha anaghị eweghachite njirimara nke nlele mbụ. Ọ bụrụ na enyeghị onye anamachọihe iwu, ichekwa ihe edozighị edozi ka bụ nsonaazụ bara uru.
Họrọ ihe nnọchianya maka ọrụ ahụ. Ọchịchọ ezinụlọ nwere ike ịnakwere usoro ọzọ akọwapụtara; Usoro kemịkalụ chọrọ ngwakọta edoziziri ma ọ bụ ngwakọta akọwapụtara nke ọma; a theoretical-mass report nwere ike ịchọ ọtụtụ ngụkọta ndị ndoro-ndoro ochichi. Detuo nhọrọ ahụ n'akụkụ usoro nke mere na ihe nchọta dị mma agaghị emecha chegharịa dị ka ntụziaka nrụpụta.
Nlebanye aka ngwa ngwa bụ ịrịọ onye nyocha ka o depụta ndị anabatara site na ndekọ naanị. Ọ bụrụ na onye nleba anya chepụtara ngwakọta, na-atụfu mmachi ejikọtara ma ọ bụ họrọ otu ihe fọdụrụ na-enweghị ihe akaebe, melite ndekọ tupu ibubata ya ebe ọzọ. Ebumnobi bụ reproducible ejighị n'aka, karia eriri ejiri mara mma.
Ajụjụ a na-ajụkarị
X ọ pụtara na peptide nwere codon nkwụsị? Ọ bụghị na nkọwa usoro amino acid izugbe. X na-egosipụtakarị ihe fọdụrụ amabeghị ma ọ bụ nke akọwapụtaghị ya. Ekwesịrị ịlele ọkwa nkwụsị ntụgharị na mgbakọ faịlụ mpaghara iche iche.
Enwere m ike dochie J na leucine iji mee ka ngwanrọ nabata usoro? Naanị dị ka onye ndoro-ndoro anya ma ọ bụ onye akpọrọ n'ụzọ doro anya, na mbụ edobere ambiguity. Nnabata site na ngwanrọ anaghị enye ihe akaebe na leucine bụ ihe fọdụrụ nke ọma.
U na O bụchaghị mperi ederede? Mba. A na-eji ha eme ihe maka selenocysteine na pyrrolysine na mkpụrụedemede amino acid agbatị. Kwado mgbakọ isi mmalite yana nkwado ngwaọrụ tupu ịgbanwe ha.
Kedu ihe mgbakwunye kachasị mkpa na chaatị mbelata? Akụkọ ndekọ aha jikọtara ya na ndekọ usoro n'ezie, gụnyere ọnọdụ ndị a na-edozighị na ihe akaebe ha. Chaatị ahụ na-akọwa akara; ihe ndekọ ahụ kọwara ihe mere e ji jiri akara ndị ahụ mee ihe atụ ahụ.
