Likhutšoane tsa Amino Acid - Boloka Likhoutu tse sa hlakang le tse sa Lekanyetsoang
Blog Synthesis Peptides Mothusi o romela tatelano e nang le B, J, kapa X ebe o kopa laboratori e 'ngoe ho etsa tlhahlobo hape. Teko ea hang-hang ke ho tlosa litlhaku tse sa tloaelehang sebakeng sa mesaletsa e tloaelehileng. Seo se ka fetola pono e sa tsitsang ka khutso hore e be sebopeho se nepahetseng ka phoso. Chate e sebetsang ea likhutsufatso tsa amino acid e lokela ho hlalosa hore na letšoao le u lumella ho etsa qeto efe, se dutseng se eso ho rarolloe, le hore na ke tsamaiso efe ea notation e fanang ka moelelo oo.
Tataiso ena e tsepamisitse maikutlo linthong tse sa hlakang le tse sa tloaelehang ho e-na le ho pheta-pheta li-amino acid tse mashome a mabeli tse tloaelehileng. Mehlala ea eona ea boikaketsi ea phepelo ke lithupelo tsa ho ruta, ha ho phatlalatsoe likabelo tsa tatellano. Sepheo ke ho boloka tlhahisoleseding e lekaneng bakeng sa laboratori e 'ngoe ho tsosolosa tlhaloso le ho phephetsa phetoho leha e le efe e sa tšehetsoeng.
Qala ka ho khetholla: khoutu e sa hlakang e hlalosa tsebo e sa fellang kapa sehlopha se hlalosoang sa mekhoa e meng; masalla a sa tloaelehang a ka hlalosa sebopeho se itseng sa lik'hemik'hale ka ntle ho alfabeta e tloaelehileng ea masalla a mashome a mabeli. Maemo ana a hloka lirekoto tse fapaneng. Hape ha e rarolloe ka mokhoa o sireletsehileng ka ho hakanya lengolo le haufi le tloaelehileng.
Bala lets'oao mmoho le sistimi ea notation
The RESID notation FAQ e thathamisa matshwao a sa hlakang ho kenyeletswa B bakeng sa Asp/Asn, J bakeng sa Leu/Ile le Z bakeng sa Glu/Gln. Bala letšoao le leng le le leng ka har'a kopano e boletsoeng. Moelelo oa mophetwa polokelongtshedimosetso ya baeloji ha o hlahise hore na foromo ya taelo e tla amohela eng kapa hore e tla fetolela mophetwa eo jwang.
| Letshwao kapa mongolo | Ho bolelang ho tiisa | Se tlamehang ho lula se hlakile |
|---|---|---|
| B / Asx | Aspartic acid kapa asparagine ambiguity, D kapa N | Ke bopaki bofe bo sieang boemo bo sa rarolloa; o seke wa kgetha e le nngwe ntle le tokafatso |
| Z / Glx | Glutamic acid kapa glutamine ambiguity, E kapa Q | Hore na ena ke mosebetsi o sa rarolloang kapa mofuta o mong o hlalositsoeng ka boomo |
| J | Leucine kapa isoleucine ambiguity litumellanong tse e sebelisang | Kopano e sebetsang le tšehetso ea sesebelisoa sa ho amohela |
| X | Masala a sa tsejoeng kapa a sa hlalosoang tlas'a kopano e boletsoeng | Lithibelo leha e le life mabapi le menyetla; u se ke ua nka letšoao la ho emisa kapa boima bo le bong bo tsitsitseng |
| U / Karolo | Selenocysteine | Tšehetso ho software ea tlhahlobo le liphetoho leha e le life tse boletsoeng tsa lik'hemik'hale |
| O / Pyl | Pyrrolysine | Boitsebahatso ba 'nete ba masalla le kalafo ea eona ka tatellano le software ea sebopeho |
| D / Sebopeho sa Asp khahlano le D | Lengolo la D le khetholla asiti ea aspartic; tlhaloso ea stereochemical D e na le karolo e 'ngoe | Arola boitsebahatso ba masalla ho litlhophiso ka leano le hlakileng la lintlha |
The Litokomane tsa tatellano-encoding tsa NCBI e bontša hore na ke hobane'ng ha alfabeta e le ea bohlokoa: e khetholla matšoao a masala a kantle, lekhalo le lipehelo tsa ho felisoa, le li-encodings tsa ka hare. Nyeoe, matšoao le matšoao a sa tšehetsoeng a hloka phekolo e hlakileng nakong ea ho fetisetsa. Lengolo le nang le litlhaku tse nyane ha lea lokela ho fetoha taelo ka khutso bakeng sa tlhophiso ea D hobane feela sephutheloana se le seng sa lehae se sebelisa kopano eo..
Litlhaku tse tharo li ka ntlafatsa ho baloa ntle le ho rarolla k'hemistri. Kgutsufatso e kang "modified Lys" e ntse e hloka phetoho e hlalositsoeng le Lisebelisoa sebaka. Lebitso le lekhuts'oane le ikhethileng la mofani oa thepa le hloka boitsebiso bo felletseng ba lik'hemik'hale kapa referense e hlakileng ea sebopeho., ho kenyeletsa tlhophiso moo ho hlokahalang.
Boloka ho hloka botsitso ho arohane le motsoako oa 'mele
Nahana ka tatelano e inahaneloang ea AGXK. Laboratori e amohelang e tseba hore boemo ba boraro ha boa abeloa. Ha e tsebe hore thepa e fanoeng ke motsoako oa masala a boraro a ka khonehang. Ho hloka botsitso ho rekoto le ho fapana ha sampuli ke liqoso tse fapaneng tse hlokang bopaki bo fapaneng.
Haeba tlhahlobo ea morao-rao e fokotsa X ho leucine kapa isoleucine, ngola mekhoa e meng e tšehetsoeng le moeli oa mokhoa. Likarolo tseo tse peli li arolelana sebopeho sa mantlha, kahoo boima ba 'mele bo le bong ha bo khethe pakeng tsa bona. Rekoto e ntlafalitsoeng e lokela ho hlalosa hore na ke eng e ntlafetseng le hore na ke eng e ntseng e e-s'o rarolloe; ha ea lokela ho phatlalatsa tatellano e tsebahalang ka ho felletseng.
Morero o fapaneng oa boikaketsi o bapisa AGIK le AGLK ka boomo. Tsena ke lipehelo tse peli tse boletsoeng, e 'ngoe le e 'ngoe e na le sekhetho sa eona, mohlala oa histori, le tlhahlobo E bitsoa Peptides tlaleho. Ho ngola ka bobeli e le AGJK ho ka ba bonolo bakeng sa ho buisana ka lelapa, empa e lahleheloa ke khetho e hlokahalang bakeng sa litaelo tse arohaneng kapa tlhahiso ea sephetho.
Bakeng sa B le Z, mefuta e meng ea mokhethoa ha e arolelane sebopeho se tšoanang. Ka hona, palo ea batho ba bangata e lokela ho bolela boitsebiso ba mokhethoa kapa ho tlaleha mekhoa e meng e baliloeng ka thoko tlas'a moetso o hlalositsoeng. Ho fana ka karolelano e sa ngolisoang sebakeng se sa hlakang ho ka etsa palo e sa hlaloseng le e 'ngoe ea limolek'hule tse reriloeng.. leano la lekunutu
Boikoetliso bo behiloeng ke mokhethoa. Ha re re rekoto e inahaneloang ea ABBA e lumella D kapa N ka boikemelo sebakeng se seng le se seng sa B. Tatelano ea eona ea bonkgetheng ba bane ke ADDA, DNA, Uena le ANNA. Haeba bopaki ba liteko bo lumella feela mefuta e meng e kopantsoeng ea DD kapa NN, sete e lumelletsoeng e na le tatellano e 'meli. Ho ngola BB feela ho ke ke ha boloka kamano eo. Hokela litšitiso kapa u bale batho ba lumelletsoeng ho e-na le ho iketsetsa motsoako o mong le o mong.
Ho sebelisa litekanyetso tsa masala a monoisotopic ho Tafole ea boima ba ExPASy, ho tlosa N ka D ho fetola mokhethoa ka 115.02694 − 114.04293 = 0.98401 Da ho sebelisa lintho tse kenang tse pota-potiloeng. ADNA le ANDA e 'ngoe le e 'ngoe e na le D le N e le 'ngoe, kahoo kakaretso ea liqapi tsa bona li lumellana ho sa tsotellehe tatellano e fapaneng ea masalla. Esita le kakaretso e nepahetseng e lumellanang le sebopeho seo e ke ke ea tseba hore na ke boemo bofe bo nang le D. Ka hona, ho nyenyefatsa ho ipapisitse le bongata ho tlameha ho boloka ho se hlaka ha maemo.
Palo ea bakhethoa ha se monyetla oa ho ajoa. Tatelano tse nne tse dumelletsweng ha di na a 25% monyetla ka mong, mme letshwao le sa hlakang la database ha le hlalose motswako o lekanang bakeng sa ho rekwa. Menyetla e ka hloka mohlala oa lipalo-palo o boletsoeng le litlhaloso tse tšehetsang; litekanyo tsa motsoako li ka hloka ho lokisoa kapa ho metha. Boloka bobeli bo arohane le sete e bonolo ea menyetla.
Phapang ena e bohlokoa phuputsong ea ho bolaea batho. Ho fumana boima bo lumellanang le D e le 'ngoe sebakeng se sa hlakang sa D/N ha ho bontše hore polokelo e fetotse N ea pele ho D.. Mosebetsi oa tatellano ea ho qala o ne o se o ntse o sa rarolloa, le maemo a fapaneng a ka arolelana kakaretso eo. Kopo ea ho nyenyefatsa e hloka bopaki mabapi le boemo ba ho qala le phetoho ea nako, ho e-na le ho nka tlhaloso e le 'ngoe e lumelletsoeng e le motheo o ngotsoeng.
Haeba sesebelisoa sa ho batla se sa khone ho boloka lithibelo tse kopaneng, boloka lenane le felletseng la bonkgetheng kantle ho sesebediswa mme o ngole kakanyo e rekilweng kantle. Mokhoa oa ho batla o ka holisa kapa oa putlatsa menyetla. Tlaleho e otla khahlano le sete ea 'nete e lumelletsoeng pele u etsa qeto ea boemo ba tatellano.
Tatelano e ka rarolloa ka botlalo ha sebaka sa phetoho se ntse se sa tsitsa. Boloka lipelaelo tseo li arohane: e 'ngoe e amehang hore na masalla a teng, e 'ngoe e ameha ka hore na bond kapa athomo e na le phetoho. Mongolo o nang le mokhoa o hlakileng oa ho hloka botsitso o ka boloka bopaki; ho khetha sebaka se nepahetseng bakeng sa ho khotsofatsa sebaka se hlokahalang sa database ho eketsa tlhahisoleseling e sa tšehetsoeng.
Rekote e fokolang e hloka laboratori e 'ngoe
Boloka rekoto e amohetsoeng e le mohloli o sa fetoheng 'me u thehe mofuta o fapaneng o tolokiloeng. Bakeng sa ABBA, boloka maemo a mabeli a sa hlakang, mefuta e meng e lumelletsoeng ho e 'ngoe le e 'ngoe, le lithibelo life kapa life tse kopanetsoeng. Sena se lumella mohlahlobi oa morao-rao ho khetholla bopaki bo bocha ba liteko ho khetho ea baruti e entsoeng ho fetisa morekisi.
| Sebaka se hlokahalang | Mohlala oa lintlha tse sebetsang | Sephetho haeba se le sieo |
|---|---|---|
| Tatelano pronance | Mohloli oa tlaleho, tlhabollo, sekhetho sa mohlala, le letsatsi la tlhaloso | Tatelano e tolokilweng e ke ke ya amahanngwa ka nepo le taba ya pele |
| Alfabeta le tataiso | Kopano ea lintlha tse reheletsoeng; tatellano e ngotsoeng N ho C | Moelelo oa matšoao le tatellano ea masalla e kanna ea baloa hampe |
| 'Mapa oa linomoro | Hore na maemo a bua ka selelekela, ketane e hodileng, kapa sekotoana sa maiketsetso | Phetoho e ka abeloa mesaletsa e fosahetseng ea 'mele |
| Maemo a sa rarolloang | Boemo, mekhoa e meng e lumelletsoeng, bopaki, le potso e sa rarolloang | Sebopeho se ikhethileng kapa boima bo ikhethang ba theory bo kanna ba se be le mabaka |
| Khemistri e felletseng ea sepheo | Termini, tlhophiso, mabitso a isotope, lihokelo tsa ketane ka mahlakoreng, le liphetoho | Litlhaku tse tsamaisanang li ke ke tsa theha limolek'hule tse tšoanang |
| Boemo ba tlhahlobo | Mokhoa, ho lokisetsa mohlala, litekanyetso tsa kabelo, le data e tala e amehang | Moamoheli a ke ke a lekola hore na phapang e boletsoeng e ne e ka lekanyetsoa |
| Histori ea tlhaloso | Ea ileng a fetola kabelo, hobaneng, le hore na ke lifaele life tse ka tlase ho tlase tse ntlafalitsoeng | Litlhaloso tsa khale le tse ncha li ka kopanngoa tlhahlobisong e le 'ngoe |
Bakeng sa masala a sa tloaelehang, eketsa tlhahisoleseding e lekaneng ea sebopeho ho khetholla masala a kenyelletsoeng ho e-na le mohaho oa mohaho oa mahala feela. Lihlopha tse sireletsang tse teng nakong ea synthesis ha se karolo ea peptide ea ho qetela ka bo eona. Ka ho tšoanang, mofuta oa letsoai oa amino acid e rekiloeng ka boeona ha e hlalose sebopeho sa ho qetela sa peptide. Aminopeptide
Tlhophiso e lokeloa ke sebaka sa eona. Litlhaloso tsa L/D ha li tšoane le tataiso ea ho potoloha ha mahlo, mme ha di a lokela ho ferekanngwa le dikhoutu tsa masalla tsa tlhaku e le nngwe. Moo sebopeho se nang le li-stereocenters tse eketsehileng, li hlalose ho e-na le ho nka hore tlhaloso ea alpha-carbon e rarolla mesaletsa eohle.
Lekola phetiso ntle le ho hlakola lintlha tse sa rarolloang
Ea pele, bapisa tatelano e hlaloswang le mohlodi wa mophetwa ka mophetwa, ho kenyeletsa le litlhaloso. Ea bobeli, atolosa matshwao a sa tlwaelehang ka ho sebedisa kopano e boletsweng. Ea boraro, 'mapa boemo bo bong le bo bong ho latela mokhoa o reriloeng oa ho ngola linomoro. Ea bone, netefatsa hore li-termini le liphetoho li emetsoe ka ntle ho mangolo a tloaelehileng a masalla moo ho hlokahalang.
Ebe u hlahloba tseko e 'ngoe le e' ngoe ea tlhahlobo khahlanong le mokhoa. Botsa hore na bopaki bo khetholla sebopeho, taelo ea masalla, sebaka sa phetoho, le tlhophiso. Tsena ke lipotso tse fapaneng. Mokhoa o tiisang o mong o ka siea o mong o sa rarolloe. Ngola moeli o haufi le tleleime ho e-na le ho e pata ka boits'oaro bo akaretsang.
Bakeng sa phano ea AGXK e inahaneloang, qeto e molemo ke: “Masala a boraro ha a rarolloe; ha ho sebopeho se ikhethileng se rometsoeng bakeng sa motsoako; tlhahlobo ea mokhethoa e bolokiloe ka thoko. ” Haeba morero o khetha motho a le mong ka boomo bakeng sa teko ea tlhahlobo, tšoaea boitsebiso boo e le mokhethoa ea hlophisitsoeng, eseng joalo ka tatelano ea mantlha e netefalitsoeng.
Ha teko e hloka bonkgetheng ba itseng, theha lirekoto tsa moralo tse arohaneng ho e-na le ho hlakola motsoali ea sa rarolloang. Ka mohlala, ADNA le ANDA li ka fumana li-identifiers tse fapaneng tsa litaelo ha ka bobeli li ntse li hokahane le rekoto ea bopaki ba ABBA. Liphetho ho motho a le mong ebe li leka molek'hule e entsoeng; ha ba retroactively theha boitsebiso ba sampole ea pele. Haeba ha ho mokhethoa ea laetsoeng, ho boloka sete e sa rarolloa e ntse e le sephetho se nepahetseng le se molemo.
Khetha setšoantšo bakeng sa mosebetsi. Patlisiso ea lelapa e ka amohela mofuta o mong o hlalositsoeng; taelo ea lik'hemik'hale e hloka sepheo se rarollotsoeng kapa motsoako o hlalositsoeng ka ho hlaka; tlaleho ea theory-mass e ka hloka kakaretso ea bonkgetheng ba 'maloa. Ngola khetho eo haufi le tatellano e le hore tlhahiso e loketseng ea ho batla e se ke ea fosahala e le taelo ea tlhahiso..
Tlhahlobo e potlakileng ea phetisetso ke ho kopa mohlahlobi hore a thathamise bakhethoa ba lumelletsoeng ho tsoa rekotong feela. Haeba mohlahlobi a qapa motsoako, hloloheloa tšitiso e hokahantsoeng kapa a khetha masalla a le mong ntle le bopaki, ntlafatsa rekoto pele o e tlisa sebakeng se seng. Sepheo ke ho se tiisehe ho ka reproducible, ho e-na le khoele e hlakileng ea maiketsetso.
Lipotso tse botsoang khafetsa
Na X e bolela hore peptide e na le "stop codon".? Eseng ka tlhaloso e akaretsang ea tatellano ea amino acid. X hangata e tšoaea masalla a sa tsejoeng kapa a sa hlalosoang. Noto ea pheliso ea phetolelo le litumellano tsa faele tsa lehae li tlameha ho hlahlojoa ka thoko.
A na nka nkela J sebaka sa leucine ho etsa hore software e amohele tatellano? Feela joalo ka sekala kapa mokhethoa ea ngotsoeng ka ho hlaka, ka ho se hlaka hoa pele ho bolokiloeng. Ho amoheloa ke software ha ho fane ka bopaki ba hore leucine ke masala a nepahetseng.
Na U le O ke liphoso tsa typographical? Che. Li sebelisoa bakeng sa selenocysteine le pyrrolysine ka alphabets e atolositsoeng ea amino acid. Netefatsa kopano ea mohloli le tšehetso ea lisebelisoa pele u li fetola.
Ke tlatsetso efe ea bohlokoa ka ho fetisisa ho chate ea khutsufatso? Notation legend e hokahantsoeng le rekoto ea tatellano ea 'nete, ho kenyelletsa le maemo a sa rarolloang le bopaki ba bona. Chate e hlalosa matšoao; tlaleho e hlalosa hore na ke hobane'ng ha matšoao ao a sebelisitsoe bakeng sa sampole eo.
