多肽修饰

环肽

肽环化可增强肽的构象稳定性(相对于其线性类似物而言),是肽开发中的一种常见策略。

什么是环肽?

肽环化形成环肽或环化肽是一种常用的策略,用于开发构象稳定性比线性类似物更强的肽。事实证明,环肽可用于多种应用,包括模仿蛋白质二级结构(如蛋白质环),以及优化肽配体,以提高结合效力、选择性和蛋白酶稳定性。

环化配置

合成内酰胺环肽的主要连接方法有头对尾、侧链对侧链、头对侧链和侧链对尾,具体取决于功能基团在肽序列中的位置。

从头到尾

-出现在 N 端到 C 端之间。
-通过酰胺键形成(内酰胺化)。
-最常用的环化方式,具有更高的稳定性。

侧链至头部

出现在 N 端和内部 COOH 之间
(例如 Asp 的 ß-COOH 基团或 Glu 的 γ-COOH 基团)。

侧链至尾部

出现在内部 NH2 与 C 端之间
(例如 Lys 的 ε-NH2 基团)。

侧链到侧链

出现在赖氨酸侧链(赖氨酸的 ε-NH2 基团)与天冬氨酸或谷氨酸侧链(γ-COOH 基团)之间。 到天冬氨酸或谷氨酸(γ-COOH-基团)之间。

特色引文

针对蛋白酪氨酸磷酸酶 YopH N 端域的环肽的设计和核磁共振研究

我们报告了针对耶尔森氏菌蛋白酪氨酸磷酸酶 YopH N 端结构域的新型环肽的设计和评估。环肽是根据蛋白质 SKAP-HOM [DE(pY)DDPF (pY = 磷酸酪氨酸)] 的短序列设计的,它们都包含图案 DEZXDPfK(其中 Z 是磷酸酪氨酸或不可水解的磷酸酪氨酸模拟物,X 是天冬氨酸或亮氨酸,f 是 d-苯丙氨酸)。这些肽具有 "从头到尾 "的结构,可以通过在第一个天冬氨酸和赖氨酸残基的侧链之间形成酰胺键实现环化。为了监测这些肽与 YopH N 端结构域的结合情况,我们进行了化学位移扰动研究。含有磷酸酪氨酸分子的多肽显示出低微摩尔范围的结合亲和力;用磷酸酪氨酸的一种非水解衍生物取代磷酸酪氨酸会显著降低结合亲和力。这些初步研究可能为发现 YopH N 端结构域的更强效、更具选择性的多肽配体铺平了道路,这些配体可进一步研究其抑制耶尔森氏菌感染的能力。

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