肽修饰
环肽
什么是环肽?
肽环化形成环肽或环化肽是开发与其线性类似物相比具有增强构象稳定性的肽的常用策略. 环肽已被证明可用于多种应用, 包括模拟蛋白质二级结构, 例如蛋白质环, 以及具有增强结合效力的肽配体的优化, 选择性, 和增强的蛋白酶稳定性.
环化构型
合成内酰胺环肽的主要连接方法是头尾连接, 侧链到侧链, 头到侧链, 和侧链到尾部,取决于肽序列中官能团的位置.
从头到尾
·发生在N-末端到C-末端之间.
·通过酰胺键形成 (内酰胺化).
·最常用的环化赋予更高的稳定性.
侧链到头部
发生在 N 末端和内部 COOH 之间
(例如. Asp 的 ß-COOH-基团或 Glu 的 γ-COOH-基团).
侧链至尾部
发生在内部 NH2 和 C 末端之间
(例如. 赖氨酸的ε-NH2-基团).
侧链到侧链
发生在赖氨酸侧链之间 (ε-NH2-赖氨酸基团) 天冬氨酸或谷氨酸 (γ-COOH基团).
精选引文
靶向蛋白质酪氨酸磷酸酶 YopH 的 N 端结构域的环肽的设计和 NMR 研究
我们报告了针对耶尔森氏菌蛋白酪氨酸磷酸酶 YopH 的 N 末端结构域的新型环肽的设计和评估. 环肽是根据蛋白质 SKAP-HOM 的短序列设计的 [的(y)DDPF (pY = 磷酸酪氨酸)], 它们都包含 DEZXDPfK 主题 (其中 Z 是磷酸酪氨酸或不可水解的磷酸酪氨酸模拟物, X是天冬氨酸或亮氨酸并且f是d-苯丙氨酸). 这些肽呈现出“头到尾”的结构, 通过在第一个天冬氨酸和赖氨酸残基的侧链之间形成酰胺键来实现环化. 已经进行了化学位移扰动研究来监测这些肽与 YopH N 末端结构域的结合. 含有磷酸酪氨酸部分的肽在低微摩尔范围内表现出结合亲和力; 用其不可水解衍生物之一取代磷酸酪氨酸会显着降低结合亲和力. 这些初步研究可能为发现更有效和选择性的 YopH N 末端结构域肽基配体铺平道路，这些配体可以进一步研究其抑制耶尔森氏菌感染的能力.
肽修饰
丰富的多肽修饰经验, 为肽研究提供多种可行的途径.