प्रोटीन टायरोसिन फॉस्फेटस YopH के एन-टर्मिनल डोमेन को लक्षित करने वाले चक्रीय पेप्टाइड्स का डिजाइन और एनएमआर अध्ययन

हम येर्सिनिया से प्रोटीन टायरोसिन फॉस्फेटस YopH के एन-टर्मिनल डोमेन को लक्षित करने वाले उपन्यास चक्रीय पेप्टाइड्स के डिजाइन और मूल्यांकन पर रिपोर्ट करते हैं।. चक्रीय पेप्टाइड्स को SKAP-HOM प्रोटीन के संक्षिप्त अनुक्रम के आधार पर डिज़ाइन किया गया है [का(पीवाई)डीडीपीएफ (पीवाई = फॉस्फोटायरोसिन)], और उन सभी में मूल भाव DEZXDPfK शामिल है (जहां Z एक फॉस्फोटायरोसिन या एक गैर-हाइड्रोलाइजेबल फॉस्फोटायरोसिन मिमेटिक है, एक्स एक एस्पार्टिक एसिड या ल्यूसीन है और एफ एक डी-फेनिलएलनिन है). ये पेप्टाइड्स 'सिर से पूंछ तक' वास्तुकला प्रस्तुत करते हैं, पहले एस्पार्टिक एसिड और लाइसिन अवशेषों की साइड चेन के बीच एक एमाइड बॉन्ड के गठन के माध्यम से चक्रीकरण को सक्षम करना. YopH के एन-टर्मिनल डोमेन में इन पेप्टाइड्स के बंधन की निगरानी के लिए रासायनिक बदलाव गड़बड़ी अध्ययन किए गए हैं. फॉस्फोटायरोसिन की मात्रा वाले पेप्टाइड्स कम माइक्रोमोलर रेंज में बाध्यकारी समानताएं प्रदर्शित करते हैं; इसके गैर-हाइड्रोलाइजेबल डेरिवेटिव में से एक के साथ फॉस्फोटायरोसिन का प्रतिस्थापन नाटकीय रूप से बाध्यकारी समानता को कम कर देता है. ये प्रारंभिक अध्ययन योपएच एन-टर्मिनल डोमेन के अधिक शक्तिशाली और चयनात्मक पेप्टाइड आधारित लिगैंड की खोज का मार्ग प्रशस्त कर सकते हैं, जिनकी येर्सिनिया संक्रमण को रोकने की उनकी क्षमता के लिए आगे की जांच की जा सकती है।.