पेप्टाइड संशोधन

स्टेपल पेप्टाइड्स

ऑल-कार्बन मचान में पॉलीपेप्टाइड की α-पेचदार संरचना होती है, और ऑल-कार्बन मचान α-पेचदार संरचना को स्थिर करता है और पॉलीपेप्टाइड अणु और प्रोटीन के बीच बातचीत को बढ़ाता है.

स्टेपल पेप्टाइड्स क्या है??

अध्ययनों से पता चला है कि α-पेचदार संरचना और धनात्मक आवेश से भरपूर पेप्टाइड्स कोशिका झिल्ली को पार कर सकते हैं. तथापि, एक बार मूल शरीर से अलग हो गया, पेप्टाइड अपनी मूल माध्यमिक संरचना को बनाए नहीं रख सकता, और गठन संबंधी अस्थिरता प्रोटीन के साथ इसके बंधन को कमजोर कर देती है, जबकि साधारण रैखिक पेप्टाइड्स कोशिका झिल्ली को पार नहीं कर सकते हैं और आसानी से हाइड्रोलाइज्ड हो जाते हैं. लगातार कोशिशों के बाद, वर्डीन एट अल. पेप्टाइड की एक नई संरचना विकसित की, इस पेप्टाइड को स्टेपल पेप्टाइड कहा जाता है, यह α-पेचदार संरचना वाला एक पूर्ण-कार्बन मचान है, ऑल-कार्बन मचान α-पेचदार संरचना को स्थिर करता है, जो पेप्टाइड अणुओं और प्रोटीन के बीच परस्पर क्रिया को मजबूत करता है, और स्टेपल पेप्टाइड कोशिका झिल्ली को पार कर सकता है और इसे हाइड्रोलाइज करना आसान नहीं है, जिसमें पिछली छोटी-अणु दवाओं और प्रोटीन-आधारित दवाओं की तुलना में अधिक औषधीय गतिविधि है. पिछली छोटी अणु दवाओं और प्रोटीन दवाओं की तुलना में उच्च औषधीय गतिविधि.

स्टेपल पेप्टाइड्स विज्ञान

स्टेपल पेप्टाइड और साधारण पेप्टाइड संश्लेषण के संश्लेषण के बीच अंतर पेप्टाइड श्रृंखला के ठोस-चरण संश्लेषण के दौरान α-मिथाइल और α-अल्केनाइल समूहों वाले दो गैर-प्राकृतिक अमीनो एसिड की शुरूआत में निहित है।, और फिर ओलेफिनिक जटिल अपघटन प्रतिक्रिया दो गैर-प्राकृतिक अमीनो एसिड के बीच स्थिर α-पेचदार संरचना के साथ एक पूर्ण-कार्बन मचान बनाने के लिए होती है, और फिर स्टेपल पेप्टाइड को संश्लेषित करें.

स्टेपल पेप्टाइड रसायन विज्ञान

पहली पीढ़ी का ग्रब्स उत्प्रेरक (बाएं) ट्राइसाइक्लोहेक्सिलफॉस्फ़ीन के साथ (PCy3) लिगेंड्स और एपिकल पोजिशन्ड कार्बाइन कार्बन एक अपेक्षाकृत स्थिर रूथेनियम कॉम्प्लेक्स है जिसका उपयोग पेप्टाइड्स में ओलेफिन मेटाथिसिस के लिए किया जाता है।. बाद की जांच से अधिक तापीय रूप से स्थिर ग्रब्स दूसरी पीढ़ी के उत्प्रेरक का डिज़ाइन तैयार हुआ (मध्य). तीसरी पीढ़ी का उत्प्रेरक, इसे होवेयडा-ग्रब्स उत्प्रेरक के रूप में भी जाना जाता है (सही), बेंज़िलिडीन लिगैंड के लिए एन-हेटरोसाइक्लिक कार्बाइन लिगैंड को प्रतिस्थापित करता है जिसमें बेंजीन रिंग से जुड़ा एक चेलेटिंग ऑर्थो-आइसोप्रोपॉक्सी समूह होता है.

एकल स्टेपल पेप्टाइड प्रतिक्रिया

एकल स्टेपल पेप्टाइड प्रतिक्रिया. दो अल्फा-4-एन-पेंटेनिलैलैनिन का समावेश (S5) पेप्टाइड स्ट्रैंड में अवशेष रिंग-क्लोजर मेटाथिसिस को सक्षम बनाता है (यानी, ग्रब्स प्रतिक्रिया) एकल स्टेपल पेप्टाइड बनाने के लिए. जब एन = 3 (यानी. साथ 3 S5 अवशेषों के बीच अमीनो एसिड) स्टेपल प्रकार को i के रूप में जाना जाता है, मैं + 4.

एकल स्टेपल विन्यास

"क्लिक" प्रतिक्रिया की उच्च दक्षता और हल्की स्थितियाँ (कॉपर-उत्प्रेरित ह्यूजेन 1,3-द्विध्रुवीय साइक्लोडडिशन प्रतिक्रिया) आवश्यक अप्राकृतिक अमीनो एसिड के संश्लेषण में आसानी के साथ संयुक्त, ट्राईज़ोल-स्टेपल्ड पेप्टाइड्स के आसान संश्लेषण की अनुमति देता है. उदाहरण के लिए, एल का एक संयोजन- कर सकना (εN3) और डी-प्रा (डी-प्रोपरगाइलैनिन) i और i+4 पदों पर प्रतिस्थापित का उपयोग एकल ट्राईज़ोल-स्टेपल्ड पेप्टाइड्स की पीढ़ी के लिए किया जा सकता है.

विशेष उद्धरण

विवो गतिविधि में स्टेपल किए गए पेप्टाइड्स के लिए डिज़ाइन-नियम और एमडीएम2/एक्स प्रतिपक्षी के लिए उनका अनुप्रयोग.

हालांकि स्टेपल किए गए α-हेलिकल पेप्टाइड्स चुनौतीपूर्ण लक्ष्यों को संबोधित कर सकते हैं, लक्ष्य से परे विषाक्तता से बचते हुए उन्हें कोशिका पारगम्य बनाने की खराब समझ के कारण उनकी प्रगति बाधित होती है. संश्लेषण करके >350 अणुओं, हम एमडीएम2 के विरुद्ध स्टेपल पेप्टाइड्स की पहचान के लिए वर्कफ़्लो प्रस्तुत करते हैं(एक्स) विवो गतिविधि के साथ और कोई ऑफ-टारगेट प्रभाव नहीं. मुख्य अंतर्दृष्टि में लिपोफिलिसिटी और पारगम्यता के बीच एक स्पष्ट संबंध शामिल है, ऑफ-टारगेट विषाक्तता से बचने के लिए सकारात्मक चार्ज को हटाना, घुलनशीलता/व्यवहार को बढ़ाने के लिए विवेकपूर्ण आयनिक अवशेष प्लेसमेंट, क्षमता बढ़ाने के लिए सी-टर्मिनल लंबाई/हेलिसिटी का अनुकूलन, और पॉलीफार्माकोलॉजी से बचने के लिए स्टेपल प्रकार/संख्या का अनुकूलन. वर्कफ़्लो एप्लिकेशन पेप्टाइड्स देता है >292x बेहतर कोशिका प्रसार क्षमता और कोई ऑफ-टारगेट कोशिका प्रसार प्रभाव नहीं ( > 3800x ऑन-टारगेट इंडेक्स). एक विशिष्ट MDM2 पर इन 'डिज़ाइन नियमों' का अनुप्रयोग(एक्स) पेप्टाइड श्रृंखला में सुधार होता है ( > 150x) सेलुलर क्षमताएं और लक्ष्य से दूर विषाक्तता को दूर करता है. उल्लिखित वर्कफ़्लो को चिकित्सीय प्रभावों को सुविधाजनक बनाना चाहिए, विशेषकर MDM2 जैसे लक्ष्यों के लिए(एक्स) जिसमें हाइड्रोफोबिक इंटरफेस है और एक पेचदार आकृति के साथ लक्षित किया जा सकता है.

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