मार्ग डिज़ाइन

रासायनिक संश्लेषण विधि (ठोस चरण संश्लेषण एसपीपीएस, तरल चरण संश्लेषण): लघु पेप्टाइड्स के लिए (आम तौर पर ≤50 अमीनो अम्ल), सुरक्षा समूह रणनीति का चयन करने की आवश्यकता है, युग्मन अभिकर्मक, वगैरह.

जैवसंश्लेषण (पुनः संयोजक डीएनए प्रौद्योगिकी): सूक्ष्मजीवों या कोशिकाओं द्वारा लंबे पेप्टाइड्स या जटिल संशोधित पेप्टाइड्स की अभिव्यक्ति, मेजबान चयन के अनुकूलन की आवश्यकता है (उदाहरण के लिए:. ई. कोलाई, यीस्ट) और संस्कृति की स्थितियाँ।.

प्रक्रिया अनुकूलन

संश्लेषण/अभिव्यक्ति अनुकूलन: उपज बढ़ाओ (उदाहरण के लिए:. तापमान, पीएच, उत्प्रेरक एकाग्रता).

शुद्धिकरण प्रक्रिया: क्रोमैटोग्राफी (उलट-चरण एचपीएलसी, आयन एक्सचेंज) यह कुंजी है, निक्षालन स्थितियों को अनुकूलित करने की आवश्यकता है.

अशुद्धता नियंत्रण: लापता पेप्टाइड्स को हटा दें, बेमेल अनुक्रम, ऑक्सीकरण उत्पाद, वगैरह. शुद्धता सुनिश्चित करने के लिए (आम तौर पर >98%).