Site na usoro gaa na nchekwa: Nchọpụta nguzobe n'ime Peptide

Ọrụ Membrane bụ ihe onwunwe nke Usoro

Malite na akụkụ nke na-adịghị arụrịta ụka. A naghị akọwapụta peptides na-arụ ọrụ membrane site na ebumnuche nkekọrịta. Nyocha nke ubi ugboro ugboro na-achọpụta na peptides ndị a dịgasị iche iche n'ogologo, usoro, na ụgwọ net, na na ihe ha na-ekerịta kama bụ usoro nhazi na nhazi.

Ihe kacha agbanwe agbanwe n'ime njirimara ndị ahụ bụ ụgwọ dị mma net, hydrophobic ọdịnaya, amphipathicity - nkewa nke oghere nke polar na ihe ndị na-abụghị polar - na ọchịchọ iji nweta ngbanwe nke helical na kọntaktị na akpụkpọ ahụ.. A 2019 Nyochaa site na Guha, Gmirire, Wu na Wimley, Ọdịdị nhazi nke Membrane-Permeabilizing Peptides (Nyocha Chemical), na-enyocha ụdị dị iche iche a n'ofe isi mmalite na nhazi, na foto nke na-apụta bụ ihe mgbakwunye kama ịbụ otu: ọ dịghị otu ihe onwunwe na-ekpebi ọrụ, ọ dịghịkwa otu ọnụ ụzọ na-ebu amụma ya.

Ngwongwo ọ bụla na-ebu ọnọdụ ọdịda nke ya mgbe a na-akwali ya.

Ihe nrụpụta ahụ pụtara n'ụzọ kwụ ọtọ ọbụlagodi na physics dị n'okpuru abụghị. Ihe mejupụtara-larịị parameters - mkpokọta ụgwọ, akụkụ nke hydrophobic, oge hydrophobic - bụ njirisi nyocha bara uru yana njirisi nnabata adịghị mma. Ha na-agwa gị ma usoro ọ dị na klaasị ndị a ga-anwale. Ha anaghị agwa gị ma ọ ga-emebi akpụkpọ ahụ dị n'ihu gị.

Maka usoro ndị na-anọdụ ala na ngalaba siri ike ịmekọrịta, nke a dị mkpa ugboro abụọ. Ịbawanye ụgwọ ma ọ bụ ọdịnaya hydrophobic ịchụ ọrụ na-achọkwa ịbawanye mkpokọta, mgbanwe solubility, na mgbagwoju anya ọcha. Mgbanwe imewe nke emere maka ihe eji arụ ọrụ na-aghọ nsogbu njikọ, na a na-emekarị mkpebi abụọ ahụ n'otu mkparịta ụka. Ndị otu na-edobe imewe na njikọ n'okpuru otu ụlọ ọrụ teknụzụ na-enwetakarị ndakpọ ahụ na mbụ - nke bụ ụdị ọrụ n'azụ njikọta. Omenala peptide njikọ na njirimara arụ ọrụ karịa usoro enyere n'ofe oke ịzụrụ.

Ihe Modelsdị Pore na-ebu amụma n'ezie

Ụdị oge gboo nke peptide na-akpata permeabilisation kwesịrị ikwughachi nke ọma, n'ihi na esemokwu dị n'etiti ha na-emepụta iwu nhazi dị iche iche na n'ihi na ubi ahụ ekpebibeghị nke ọma nke na-emetụta n'ọnọdụ ọ bụla.

Akwụkwọ melittin na-egosi ihe mere ókè ndị ahụ ji agbaji. A 2024 mụọ na Nkwukọrịta okike, Melittin nwere ike mebie membranes site na nnukwu pores na-agafe agafe, kọrọ na nke a canonical cationic amphipathic peptide permeabilises membranes site na nnukwu pores na-agafe agafe kama site na ụlọ anụ ụlọ., ọwa akọwapụtara nke ọma. A na-eji otu peptide ahụ eme ihe kemgbe ọtụtụ iri afọ dị ka ihe atụ akwụkwọ ọgụgụ nke otu ụkpụrụ ụlọ na omume, n'okpuru ọnọdụ ndị ahụ, dị ka ntụpọ na-agafe agafe mbụ.

⚠️ Ịdọ aka ná ntị: Ihe agụpụta nhụsianya na-agwa gị na ọdịnaya gbanarị vesicle. Ọ gwaghị gị onye n'ime ahịrị anọ dị n'elu mere ka mgbapụ ahụ pụta. Ịgwọ usoro mgbapụ dị ka ihe akaebe na-arụ ọrụ bụ otu n'ime njehie nkọwa a na-ahụkarị na akwụkwọ a.

Nke ahụ bụ ọnọdụ n'eziokwu nke ubi. Wimley na Hristova haziri ya ozugbo na a 2019 nyochaa na Akwụkwọ akụkọ Australia nke Chemistry, Usoro nke Membrane Permeabilization site na Peptides: Ka bụ Enigma, nke na-akọwapụta permeabilisation nke sịntetik lipid vesicles site na peptides dị ka ihe a na-ahụkarị nke usoro ya ka edozibeghị.. Iwu imewe ewepụtara n'akwụkwọ a bụ nke puru omume. Ha na-ebuli ihe isi ike. Ha anaghị ekpebi ihe ga-esi na ya pụta, na mmemme nke na-emeso ha dị ka deterministic ga-atụkwasị obi n'elu amụma ya.

Kedu otu ihe fọdụrụ otu otu si edegharị ọrụ mkpụrụ ndụ

Nchọpụta kacha baa uru n'oge na-adịbeghị anya maka ọrụ imewe bụ na ntinye ihe fọdụrụ na-ebu ozi na-enweghị ihe mejupụtara ya. peptides abụọ nwere ụgwọ net dabara na ọdịnaya hydrophobic dabara na ya nwere ike mepụta ọrụ akpụkpọ ahụ dị iche iche mgbe usoro ihe fọdụrụnụ gbanwere..

Ọrụ melittin bụ ihe atụ kachasị ọcha. Ịbugharị ihe fọdụrụ ebubo na ihu na-abụghị polar kwụsịrị mmalite nke oghere toroid.. Nsonaazụ ahụ agaghị ekwe omume ma ọ bụrụ na ị gụọ ihe mkpofu ebubo dị ka naanị ihe solubility na njide. Na toroid architecture, ihe fọdụrụ ebubo ịnọdụ ala n'ime ihu na-abụghị ntụpọ abụghị ntụpọ - ọ dị ka ọ na-enyere aka ịdọba ndị isi lipid n'ime oghere pore. Dochie ya na ihe fọdụrụ nke hydrophobic na pore na-akwụsị ịmalite, n'agbanyeghị na peptide bụ, site mejupụtara, amphipathic karịa ka ọ dị na mbụ.

Ihe atọ bara uru na-esote.

Ndochi anya na-emegharị ike, ọ bụghị naanị ọkwa ọrụ. Ọrụ imebe na ọba akwụkwọ peptide linear egosila na ngbanwe amino acid ahọpụtara nwere ike ịgbanwe mgbanwe nguzobe n'ime oghere nje., nke pụtara usoro ngbanwe bụ ngwá ọrụ ziri ezi maka ịgbanwe ngwa ngwa pore na-etolite na ogologo oge ọ na-adị - ọ bụghị naanị ngbanwe n'etiti arụ ọrụ na adịghị arụ ọrụ..

Mkpokọta interhelical bụ mgbanwe imewe. Ọrụ ịgbakọ na ngwugwu transmembrane a haziri achọpụtala na ihe fọdụrụ na polar na ihu ndị na-abụghị polar na-agbanwe nkwụsi ike ngwugwu site na ọdịiche dị na mbukota n'akụkụ n'etiti helices.. Ọ bụrụ na ị na-emepụta pore nke na-agbakọta onwe gị, ihe fọdụrụ na kọntaktị helix-helix kwesịrị otu nlebara anya ị na-enye ihe fọdụrụ na-eche ihu lipid..

Mgbanwe nke njedebe na ọkpụkpụ azụ na-agbanwekwa omume akpụkpọ ahụ. Nkwudo okwu, ịgba ígwè, na mgbanwe agbụ akụkụ na-agbanwe nkesa ụgwọ yana mmasị conformational, nke bụ kpomkwem nhazi nke akụrụngwa na-achịkwa mmekọrịta akpụkpọ anụ. A Ọrụ mgbanwe C-terminal dị maka nkwụsi ike na ọkara ndụ ihe kpatara ya, ma otu mgbanwe ahụ nwere ike ịgbanwe otú peptide partitions na interface, na nsonaazụ ahụ bara uru ịkọ tupu ịme usoro maka nhazi.

Maka ndụmọdụ: Mgbe ị na-eme usoro nnọchi, gbanwee otu akụrụngwa n'otu oge wee chọpụta na nsonaazụ njikọ ahụ nwere ike ịtụrụ n'ofe dị iche iche. Ngbanwe nke na-agbanwe mkpokọta ma ọ bụ omume mkpọpu na-emepụta ụdị dị iche iche n'ịdị mma ihe yana n'usoro., na arụ ọrụ pụta ga-conflate abụọ.

Nnwale ịdị ọcha oge niile bụ onye nnọchi anya, Ọ bụghị ihe akaebe

Nke a bụ ebe arụmụka ahụ na-atụgharị na ihe ahụ n'onwe ya, na ọ bara uru ịkọwa kpọmkwem ihe ngwugwu njirimara ọkọlọtọ na-ewepụta.

Ihe abụọ na-esite na tebụl ahụ, na ha abụọ dị mfe ịnweta ihe na-ezighị ezi n'akụkụ nke ọzọ.

Nke mbụ bụ na ịdị ọcha na njirimara bụ ezigbo ihe achọrọ. Nnwale na-arụ ọrụ na-agba ọsọ n'ihe mejupụtara ihe a na-amaghị ama na-ewepụta ọnụọgụ ị na-enweghị ike ikwu na usoro. Nke a abụghị usoro iwu: truncations, nhichapụ, na ngalaba-eluting congeners na-emekarị ezuru na-arụ ọrụ peptide na 2024 ikpo okwu nyocha igwe-amụ a kọrọ na Chemistry Physical Physics, Igwe ihe nchọta mmụta igwe na-arụ ọrụ maka peptides na-emebi akpụkpọ ahụ na na-akpụ pore, na-emeso nkwenye mass-spectrometric dị ka ihe nzacha achọrọ tupu anabata ihe ọ bụla buru amụma. Mkpesa ọkwa ọkwa usoro chọrọ ntụkwasị obi ihe onwunwe nke usoro-ọkwa.

Nke abụọ bụ na ihe achọrọ abụghị ihe dochie anya. Asambodo ịdị ọcha enweghị ike ịgwa gị na peptide gị na-arụ ọrụ, ma ọ nweghị ike ịgwa gị ihe kpatara otu ọrụ ji pụọ n'etiti nza abụọ nke ha abụọ gafere nkọwapụta. Ụdị mgbagha bụ ezigbo ihe atụ. Trifluoroacetate bụ ndabara nkịtị, na ịgbanwe ya maka acetate ma ọ bụ chloride na-agbanwe ihe mgbochi nke nkwadebe - mgbanwe nke na-egosi na akwụkwọ ahụ ma ọ bụghị na uru dị ọcha., na otu nke nwere ike ịdị mkpa na ọrụ dabeere na cell ebe counterion n'onwe ya na-emekọ ihe na usoro.

Nke a bụ ihe mere e ji ede akwụkwọ njikọ peptide omenala na ike mgbanwe bara uru ịtụle na obosara nke menu ule ya karịa na isi okwu ịdị ọcha. Nkọwapụta nke na-akọ naanị pasentị ịdị ọcha yana otu uka dị gịrịgịrị. Otu na-akọkwa ọdịnaya peptide, ọdịnaya counterion, ihe fọdụrụ metal, mmiri mmiri, na ebe endotoxin na bioburden dị mkpa na-enye onye na-agụ ala ala ozi zuru oke iji kpebie ma nsonaazụ ọrụ dị ịtụnanya sitere na peptide ma ọ bụ site na ihe ahụ..

Rịba ama na ihe ọ bụla dị na listi ahụ na-ajụ ihe nlele ahụ, ọ bụghị bilayer. Omume akpụkpọ ahụ na-arụ ọrụ na-anọdụ n'èzí nke njikọ na akwụkwọ QC site na nkọwa. Ọ bụ nke oyi akwa nyocha, na oyi akwa kwesịrị ka emebere ya dị ka ụma dị ka usoro.

Iwuli Layer Assay na-arụ ọrụ

Ọ bụrụ na ule ịdị ọcha zaa "Gịnị dị na vial a", oyi akwa na-arụ ọrụ na-aza “kedu ihe ọ na-eme akpụkpọ ahụ, na olee ụzọ”. Ajụjụ nke abụọ chọrọ ihe karịrị otu nyocha, n'ihi na usoro ọ bụla a na-ejikarị eme ihe bụ ihe kpuru ìsì.

Nhazi nke panel ahụ na-esote site na akwụkwọ usoro kama site na mgbakọ. Nnwale mkpofu na-akọ ma ọdịnaya agbanarị; ha enweghị ike ịchọpụta ụlọ ọrụ mere mgbapụ ahụ, mmachi mere nke ọma na 2017 nyochaa Peptides Antimicrobial Membrane na-arụ ọrụ: Ịsụgharị Nghọta Mechanistic maka imepụta. Ntụle omume na ndị na-eme atụmatụ atụmatụ bụ usoro nke na-edozi usoro dị iche iche na nhọrọ ion, n'ihi ya, ha na-anọgide na-abụ usoro ntụnye aka maka ezigbo nkwupụta pore.

Ekwesịrị nlebara anya isi ihe ụzọ abụọ n'ihi na ha na-agbanwe nkwubi okwu kama imechi ha ọnụ.

Ngwakọta lipid bụ nnwale nhọrọ. Ngwakọta lipid Anionic na-eme ka ụgwọ na-adịghị mma nke akpụkpọ ahụ nje bacteria dị; Ngwakọta zwitterionic dị nso na-anọpụ iche nke akpụkpọ anụ mammalian. Na-agba ọsọ ma n'otu usoro na-atụgharị nhọrọ site na nkwupụta n'ime oke nha. Ọ bụ naanị ụzọ ịgbachitere ọnụ iji kwurịta ndepụta ọgwụgwọ na usoro ihe atụ, na ọ bụkwa ebe mmemme na-achọpụtakarị na uru ọrụ bịara na ọnụ ahịa nhọrọ nke ọ nwere na mbụ. Nyocha nke akwụkwọ na-ekwekọghị n'okike-amino-acid na-akọ ụkpụrụ metụtara ya: peptides nwere ike pụrụ iche anaghị ekere òkè motif ma ọ bụ uru ụgwọ, mana ụyọkọ gburugburu akụkụ ihe mejupụtara ya na atụmatụ nhazi gụnyere isi hydrophobicity - nke bụ ụdị ihe onwunwe na-ebugharị ụdị akpụkpọ ahụ abụọ n'otu oge..

Njikwa artefact abụghị nhọrọ. Peptide autofluorescence, njikọ fluorophore ozugbo, na nchịkọta vesicle niile na-emepụta mgbaàmà dị mma ụgha. Ịkpọ aha covalent bụ ihe mgbagwoju anya ọzọ: ijikọ fluorophore na-agbanwe njirimara physicochemical nke molekul a na-atụ, gụnyere hydrophobicity ya n'ozuzu ya na njikọ ya maka bilayers lipid. Ihe peptide akpọrọ bụ peptide dị iche, na mmemme atụnyere na ụdị akpọrọ anaghị ebufe nke ọma na nke enweghị akara.

Mmepe nyocha ọhụrụ na-aza kpọmkwem nsogbu ndị a. Nke 2024 akuko na ACS Omega, Mbufe cytosolic nke ibu bioactive cyclic peptide sitere na peptide membrane na-ebugharị ozugbo., na-akọwa usoro nyocha emere iji nyochaa ike nke pores peptide na mkpokọta peptide dị obere., nnọgidesi ike nke pores mgbe nhazi, na mgbanwe nke components n'etiti bilayers. Ajụjụ atọ ahụ bụ nke otu nlegharị anya njedebe na-enweghị ike iru, na eziokwu ahụ bụ na usoro a raara onwe ya nye dị mkpa iji zaa ha bụ ihe ngosi ziri ezi nke ozi ole usoro mgbapu mmiri na-ahapụ na tebụl..

Site na data nyocha gaa na mkpebi chepụta

Na-adọta nke a ọnụ, Ọdịdị arụ ọrụ maka mmemme peptide na-arụ ọrụ akpụkpọ ahụ nwere ọkwa atọ, na ịtụ abụghị aka ike.

Ọkwa nke mbụ - nkwenye ihe. Analytical RP-HPLC na mass spectrometry, gbakwunyere nnwale ọ bụla ọzọ ngwa chọrọ: mkpebi nke ọdịnaya, njirimara counterion, ihe ndị fọdụrụnụ ma ọ bụ ọla, mmiri mmiri, na ebe ọrụ mgbada na-adabere na cell ma ọ bụ na vivo, endotoxin na bioburden. Ọkwa a na-eme ka nsonaazụ ọ bụla na-esote bụrụ nkọwa. Ịwụfe ya anaghị echekwa oge; ọ na-ebuga ọdịda ahụ gaa na ọkwa ọzọ dị oke ọnụ.

Tier two — orthogonal permeabilisation. Opekempe abụọ ụdị-membrane formats, ndabere dose na-akọ akụkọ na ọnụego mbụ. The redundancy bụ isi: ihe ọkụkụ na-emepụtagharị n'ofe kemịkalụ nyocha abụọ yana n'ofe abụọ nke lipid mejupụtara bụ ihe ọkụkụ. A hit na-egosi na otu usoro na-abụghị nke ọzọ na-abụkarị ihe artefact, na ịchọta nke ahụ na ọkwa abụọ na-efu otu izu karịa otu ụzọ n'ụzọ anọ.

Tier atọ — ije na selectivity. Nhazi bilayer planar maka ezigbo nkwupụta pore, depolarisation na ọnụ ọgụgụ dị irè maka ọnọdụ cellular, na ntụnyere ahaziri ahazi gafee anionic na zwitterionic lipid sistem maka nhọrọ. Naanị n'ọkwa a ka nkwupụta usoro ga-esi bụrụ nke a na-agaghị agbagha agbagha na mbipụta.

Omume usoro abụọ na-eme ka ọdịiche dị n'etiti mmemme na-eji usoro a na nke nwere nanị nyocha.

Nke mbụ bụ njikwa nsụgharị n'usoro na ihe onwunwe ọnụ. Usoro nnọchi anya na-ewepụta ụdị dị iche iche na usoro na, ọtụtụ mgbe, na synthesis pụta. Ọ bụrụ na variant dị iche na abụọ, A naghị akọwa nsonaazụ arụrụ arụ ọrụ n'agbanyeghị agụgharị ole ị na-agba.

Nke abụọ bụ nyochagharị mgbe isi mmalite ihe gbanwere. Otu peptide nke na-adaba na peptide-to-lipid ratio nke enyere n'otu nza nwere ike ọ gaghị eme ya n'ọtụtụ nke ụzọ dị iche iche ma ọ bụ n'ọtụtụ dị iche., ọbụlagodi mgbe nza abụọ na-ezute otu nkọwapụta ịdị ọcha. Nke a bụ ihe bara uru mere mmemme peptide na-ahọrọ ndị mmekọ na omimi akwụkwọ yana ma ndị ọrụ nka nwere ike ikwurịta usoro karịa naanị usoro - ihe dị iche na edepụtara usoro maka usoro siri ike imepụta mee ka a na-ahụ anya tupu ọrụ amalite.

Ọ bụrụ na nkọwapụta gị ugbu a kwụsịrị na pasentị ịdị ọcha na oke, ajụjụ usoro-larịị dị n'isiokwu a enweghị ebe ọ ga-adaba. Ntụle ohere ọrụ aka maka otu usoro akọwapụtara na-egosipụtakarị nke n'ime ọkwa atọ nke mmemme gị na-efu.

Ajụjụ Ndị Nchọpụta Na-ajụ Banyere Peptides na-arụ ọrụ Membrane

Peptide nwere ike ịbụ akpụkpọ ahụ na-arụ ọrụ na ịdị ọcha dị elu yana adịghị arụ ọrụ na ịdị ọcha dị ala? Ee, na ihe kpatara ya na-abụkarị ihe mejupụtara kama ịbụ ihe ngbanwe. Ụdị counterion dị iche, ọdịnaya dị iche iche nke ụdị isi site na ibu, ma ọ bụ nkesa dị iche iche nke ndị na-emekọ ihe ọnụ nwere ike ịgbanwe ọrụ pụtara ìhè ebe uru ịdị ọcha akọpụtara na-adị otu.. Nke a bụ ya mere ọdịnaya counterion na mkpebi ọdịnaya peptide ji bụrụ nkọwa maka peptide ọ bụla ejiri na nyocha akpụkpọ ahụ na-arụ ọrụ..

Nnwale ntapu ezuola iji kwuo na e guzobere pore? Mba. Nnwale nlegharị anya na-akọ na ọdịnaya kpuchiri ekpuchi gbanarị vesicle ahụ. Ha anaghị akọ akụkọ ihe owuwu ụlọ mere mgbapụ ahụ, na mwepu oge na-adịru nwa oge bụ ihe edekọtara nke ọma karịa oghere kwụsiri ike. Mkpesa pore chọrọ njikwa bilayer planar, ma ọ bụ arụmụka arụrụ arụ arụrụ arụ arụrụ site na otutu ụzọ orthogonal.

Kedu ihe kpatara peptides abụọ nwere otu ụgwọ na hydrophobicity na-akpa àgwà dị iche iche? N'ihi na ihe fọdụrụnụ na-ebu ozi na-adịghị mejupụtara. Ịgbanwe usoro na ụgwọ oge niile yana ọdịnaya hydrophobic na-arụpụta ọrụ dị iche iche, na ọnọdụ ndị a kapịrị ọnụ - ọkachasị n'ihu ihu na-abụghị polar - nwere ike ikpebi ma ụkpụrụ ụlọ enyere na-etolite ma ọlị. Charge na hydrophobicity bụ ihe nyocha, ọ bụghị determinants. Mmepụta Peptide

Ịgbakwunye akara fluorescent na peptide m na-agbanwe ọrụ akpụkpọ ahụ ya? Ọ nwere ike, na-emekarị. Njikọta fluorophore na-agbanwe mkpokọta hydrophobicity, omume mmekọrịta intermolecular, na njikọ nke lipid bilayer. Ebe iche iche akpọrọ dị mkpa maka ọrụ nhazi mpaghara, tụọ mmemme na usoro enweghị akara wee jiri ụdị akpọrọ naanị maka eserese.

Kwesịrị ịnwale ọzọ ọrụ akpụkpọ ahụ mgbe ebe nrụpụta dị iche rutere? Ee. Njirimara na ịdị ọcha anaghị ewepụta nha nhata. Nyochaa opekata mpe otu agba abụọ n'ihe gbasara ụzọ ọhụrụ ma ọ bụ ọkwa ọhụrụ adịghị ọnụ ma e jiri ya tụnyere ịchọpụta ọdịiche dị n'etiti ọmụmụ ihe..

Kedu ka m ga-esi atụnyere omume megide nje bacteria na akpụkpọ anụ mammalian na-eṅomi? Gbaa otu usoro nyocha megide anionic na zwitterionic lipid mejupụtara wee kọọ oke, ọ bụghị ụkpụrụ abụọ ahụ iche. Oke bụ nkwupụta nhọrọ, na ọ bụ naanị ụdị nke na-ekwu na usoro ihe nlereanya nwere ike ịkwado.

Ọ bụrụ na mmemme peptide nke na-arụ ọrụ akpụkpọ ahụ dị n'ebe a na-eme mkpebi usoro - ma ọ bụ ebe nsonaazụ ọrụ a na-atụghị anya ya na-eme ka ị jụọ ma ihe ahụ ma ọ bụ molekul bụ mgbanwe - mkparịta ụka teknụzụ gbadoro ụkwụ n'usoro., njikọ, na njirimara bụ nzọụkwụ ọzọ bara uru.

MOL Mgbanwe na-enye agbakwunyere njikọ peptide na oke ọrụ mgbanwe site na nhazi usoro site na nchacha, mgbanwe, na akwụkwọ a kapịrị ọnụ, ekpuchi HPLC ịdị ọcha, nkwenye uka, yana menu ule agbatịkwuru dabara adaba na cell dabere na iji ala ala. Ntụle nke ike nhazi maka usoro dị iche iche, gụnyere hydrophobic siri ike, amphipathic, ma ọ bụ ndị na-aga ịnya ogologo ogologo, dị na arịrịọ.