Azịza ngwa ngwa
Enwere ike iṅomi usoro n'ụzọ ziri ezi mgbe oke agbakọrọ ya adịghị mma. Ozi efu na-abụkarị na njedebe: otu amino efu ma ọ bụ nitrog acetylated…
Amino Acid Molecular arọ - emekọrịta Termini, Mgbanwe na Mgbakọ Mass
Argireline Peptide ozugbo Enwere ike iṅomi usoro n'ụzọ ziri ezi mgbe oke agbakọrọ ya adịghị mma. Ozi efu na-abụkarị na njedebe: otu amino efu ma ọ bụ nitrogen acetylated, otu carboxyl efu ma ọ bụ amide ọnụ. Maka nwa akwụkwọ na-atụnyere nsonaazụ mgbako na asambodo ndị na-ebubata ya, ndị a bụ ndịiche nhazi nke a ga-edozirịrị tupu ha ekpee mgbakọ na mwepụ. Tebụl dị arọ nke amino acid naanị anaghị akọwapụta peptide zuru oke.
Nkuzi a na-atụnyere ụzọ ndekọ ego abụọ maka otu nnọpụiche, peptide linear. Ha abụọ na-ewere njikọ peptide nkịtị, free amino na carboxyl termini, na enweghị mgbanwe ọzọ ọ gwụla ma akọwapụtara ya. Ihe atụ nkuzi bụ H-Gly-Ala-Lys-OH, akpọchiri H-GAK-OH, nwere nhazi L na ebe amino acid chiral ya. Glycine bụ achiral. H na OH ebe a na-akọwa otu ọnụ; ha abụghị extra histidine ma ọ bụ usoro residues.
Ihe si na ya pụta bụ oke mkpụrụ ndụ ihe omimi, ọ bụghị nha nke ihe dị na vial. Mgbochi, mmiri, ihe mgbaze fọdụrụnụ, adịghị ọcha, na mgbasa na-ezughị ezu chọrọ nlebara anya dị iche iche mgbe ị na-akwadebe ntinye uche. Ngụkọta ziri ezi na-aza ajụjụ dị warara: ihe uka kwekọrọ na nke a kpọmkwem mejupụtara molekul?
Họrọ nkọwa oke tupu ị họrọ mgbakọ
Monoisotopic mass na-eji isotopes akọwapụtara, N'ụzọ bụ isi, isotope kachasị ukwuu nke mmewere ọ bụla maka ihe mejupụtara peptide ndị a. Nkezi uka na-eji nnukwu atomiki dị arọ nke isotope. Mgbakọ ndị a na-ewepụta ọnụọgụ dị iche iche maka otu molekul. Ọ dịghịkwa abụ nke ziri ezi naanị n'ihi na mpempe akwụkwọ na-egosiputa ebe ọnụọgụgụ karịa.
Mass na dalton na-akọwa otu molekul. Molar Mass na gram kwa mole na-akọwa ọnụọgụ nke ihe ma nwee n'ezie otu uru ọnụọgụ na nkenke ejiri mee ebe a.. Kpamkpam, ikwu molekul uka bụ dimensionless, ọ bụ ezie na a na-ejikarị "arọ molekụla" eme ihe n'usoro maka ọnụọgụ ndị a metụtara ya. Kwupụta nke ọnụọgụ na nkwekọrịta ọnụọgụ na-anọchi anya ya.
Ntinye nke fọdụrụ n'okpuru na-abịa site na ExPASy FindMod tebụl uka. Jiri ndenye fọdụrụnụ maka G, A na K, karịa ọtụtụ ndị e depụtaghachiri site na akara reagent free-amino-acid. Debe okwu mmiri site na otu tebụl. Mpempe akwụkwọ na-ejikọta ụkpụrụ-amino-acid n'efu yana usoro nchịkọta nke fọdụrụ ga-agụta atọm ugboro abụọ ọbụlagodi mgbe mgbakwunye ọ bụla ziri ezi na ọnụọgụgụ..
Ọnụ ego nke Peptides src = "https://molchanges.com/wp-content/uploads/2026/11/pub_20261110_110948_512_bc93331741f34970a1bcc34ce7bd40a1.png">
| Akụkụ | Monoisotopic uka, Na | Nkezi oke, Na |
|---|---|---|
| Ihe fọdụrụnụ, G | 57.02146 | 57.0519 |
| Ala foduru, A | 71.03711 | 71.0788 |
| Ihe fọdụrụ, K | 128.09496 | 128.1741 |
| Okwu ego mmiri | 18.01056 | 18.01524 |
Ihe ndị a bụ ntinye agbakwunyere okirikiri. Ọnụọgụ agbakwunyere echekwabara n'okpuru na-eme ka mgbakọ ahụ nwee ike imepụtagharị; ha anaghị emepụta nkenke anụ ahụ ọzọ. Jiri otu tebụl na mgbakọ na-agbanwe agbanwe n'oge niile, karịsịa mgbe ị na-atụnyere ihe mgbako ochie nke nwere ike iji ihe ngbanwe atọm dị iche iche.
Ụzọ abụọ ga-ekwenyerịrị maka otu peptide na-efu efu
Usoro nke mbụ: nchikota residue uka ma tinye otu mmiri. Maka molekul H-GAK-OH a na-eche n'echiche, ngụkọta monoisotopic bụ 57.02146 + 71.03711 + 128.09496 + 18.01056 = 274.16409 Na. Mmiri ikpeazụ na-akwụ ụgwọ maka atom dị mkpa iji mechaa njedebe abụọ n'efu nke yinye ahịrị a.
Nkezi ngụkọta oge bụ 57.0519 + 71.0788 + 128.1741 + 18.01524 = 274.32004 Na. Nkezi nha nha nha nha nha nha bụ Palmitoyl Tripeptide 1 ihe dị ka 274.32004 g/mol na-eji ntinye ndị a. Ịtinye mmiri maka ihe fọrọ nke nta ka ọ bụrụ ọ bụla ga-agụta ọnụọgụ ọnụọgụ ugboro ugboro.
Usoro nke abụọ: nchikota amino acid n'efu ma wepu mmiri nkekọ. Nweta uka amino acid nke ọ bụla n'efu site n'otu tebụl fọdụrụnụ site na ịgbakwunye otu mmiri. Ya mere, ụkpụrụ monoisotopic bụ 75.03202, 89.04767, na 146.10552 Na. Amino acid atọ efu na-etolite njikọ peptide abụọ, inye 310.18521 - 2 × 18.01056 = 274.16409 Na.
Nkezi ibe bụ 75.06714 + 89.09404 + 146.18934 - 2 × 18.01524 = 274.32004 Na. Nke a bụ idebe akwụkwọ nhazi, Ọ bụghị nkwupụta na otu mmeghachi omume sịntetik na-ahapụ mmiri efu n'ụzọ nkịtị na usoro njikọ ọ bụla. Ihe mgbochi ụlọ echedoro na ndị etiti na-arụ ọrụ nwere kemistri mmeghachi omume dị iche iche.
| Uru | Mmachi | Ọnọdụ ọdabara | Usoro nkwenye |
|---|---|---|---|
| Nchikota nke fọduru na-enye mkpokọta kọmpat na otu okwu mmiri ọnụ. | Ọ ga-ada ma ọ bụrụ na emehiere ụkpụrụ amino acid efu maka ụkpụrụ fọdụrụnụ ma ọ bụ hapụ kemịlị ọnụ. | Usoro ahịrị akọwapụtara nke ọma nwere mgbanwe ndị ama ama yana mgbakọ nnukwu mmadụ ekwuputara. | Tinyegharịa site na iji amino acid n'efu yana akaụntụ njikọ doro anya; nyochaa mgbanwe ọnụ ọnụ ọ bụla. |
| Nchịkọta amino acid efu na-eme ka ọnụ ọgụgụ condensation dakọtara na-ahụ anya. | Achọrọ ngụkọ njikọ ziri ezi na enweghị ike ịgwọ alaka ma ọ bụ mgbanaka dị ka yinye ahịrị nkịtị na-enweghị mgbanwe. | Otu ebumnobi nwere n'efu na otu ihe nrịbama nke usoro fọdụrụnụ na-eji. | Kwenye nke fọdụrụ atọ, agbụ azụ abụọ, na nkwekọrịta na ngụkọ fọdụrụ. |
Ụzọ abụọ a bụ ego nkwado, ọ bụghị ihe akaebe nnwale nke onwe. Ha nwere ike ikwekọrịta mgbe ha na-ekerịta otu usoro edegharịrị ezighi ezi. Nyochaa nkọwapụta nke molekụla tupu ịme emume ngụkọta dakọtara.
Tinye mgbanwe ọnụ n'ụdị ntụaka ekwuputara
Nke Unimod acetyl ndekọ na-akọwapụta a +42.010565 Na monoisotopic abawanye; ya amidation ndekọ na-akọwapụta -0.984016 Da. Ndị a bụ mgbanwe metụtara usoro mmalite akọwapụtara. N'ebe a, otu acetyl dị na N-terminal nitrogen, na-ahapụ amino acid akụkụ lysine agbanwebeghị, na amidation dochie C-terminal free acid na a carboxamide. Ezipụta saịtị ndị ahụ tupu i jiri mmụba ndị ahụ. Biotinoyl Tripeptide 1
| Ebumnuche ebumnuche | Gbanwee site na H-GAK-OH | Nnukwu monoisotopic na-anọpụ iche, Na |
|---|---|---|
| H-GAK-OH | Enweghị mgbanwe | 274.16409 |
| Ac-GAK-OH | N-terminal acetylation | 316.17466 |
| H-GAK-NH2 | C-terminal amidation | 273.18007 |
| Ac-GAK-NH2 | Ha abụọ a kapịrị ọnụ ọnụ mgbanwe | 315.19064 |
A na-agbakọ nsonaazụ egosipụtara gaa na nkeji iri ise ka agbakwunyere ịrị elu edekọtara. Nkezi ngụkọta ngụkọta chọrọ nkezi mgbakwunye, Ọ bụghị ụkpụrụ monoisotopic ndị a. Mgbakọta mgbakọ agwakọtara anaghị ekwekọ ekwekọ ọbụlagodi na ọ na-eme ka ọ dị ka ọnụ ọgụgụ kacha elu akọpụtara.
Kewapụ ọdịiche okirikiri na ọdịiche nhazi. Ọ bụrụ na enwere nsonaazụ na-anọpụ iche na-eche echiche 274.16500 Na, ihe dị iche na mgbako GAK gbara gburugburu ga-abụ 0.00091 Na, ma ọ bụ gbasara 3.32 akụkụ kwa nde nke ọnụ ahịa agbakọrọ. Mgbakọ ahụ na-akọwa ọdịiche dị n'etiti; ọ bụghị oke nnabata. Ma nsonaazụ ya na-akwado ọrụ dabere na nhazigharị, ejighi n'aka, nhọrọ kacha elu na usoro nyocha.
Ejila ihe fọdụrụ nke ọ bụla gaa na integer tupu nchikota wee chọpụta azịza ikpeazụ n'ebe ọnụọgụgụ ise.. Enweghị ike iweghachi ozi a tụfuru na mbido mbụ site n'ịhazi mkpokọta. N'aka nke ọzọ, nghọtahie dị na mkpụrụọnụọgụ ikpeazụ egosipụtara nwere ike igosipụta ngbanwe dị iche iche echekwabara karịa otu molekul dị iche. Chekwa ụkpụrụ arụ ọrụ na-enweghị okirikiri mgbe ọ dị ma gbaa gburugburu otu ugboro maka akụkọ echere.
Tebụl enweghị nkwekọrịta nwere ike depụta echiche dị iche iche n'akụkụ mmetụta ha buru amụma: otu njedebe na-ezighi ezi, ngwakọta uka agwakọta, ụgwọ ion dị iche iche, ma ọ bụ usoro na-ezughị ezu. Wepu ha site na iji nkọwapụta na metadata ụdịdị, kama ịgbanwe ugboro ugboro ndabara mgbako ruo mgbe otu nọmba mere dakọtara. Egwuregwu ọnụọgụgụ enwetara site na ntule na-ezighi ezi na-ahapụ ajụjụ njirimara mbụ ahụ edozibeghị. Ndị na-emepụta Peptide Usa
Acetylation na lysine n'akụkụ yinye kama N terminus ga-enye otu ihe mgbakwunye maka otu acetyl.. Ọka na-adịghị mma naanị enweghị ike iguzobe ọnọdụ ya. N'otu aka ahụ, ịgbanwe ihe fọdụrụ L na ibe ya adịghị agbanwe nhazi elementrị. Ngwakọta ọnụ enweghị ike ịmepụta njirimara stereochemical.
Maka peptide cyclic ma ọ bụ alaka, wughachi ihe ndekọ ego gburugburu ezigbo agbụ na ọnụ ọnụ. Adịnyela usoro n'efu wee tinye akara "cyclic" na-abụghị nke nkịtị. Nkọwapụta nhazi ga-achọpụta ihe ejikọrọ na ihe, gụnyere ma ịgba ígwè na-eri ọnụ ma ọ bụ na-agụnye agbụ akụkụ.
Kpebie esemokwu tupu i jiri nọmba ahụ
Ntụle nghọtahie bara uru na-amalite site na ọnụọgụ a kọrọ. bụ akwụkwọ na-edepụta oke monoisotopic na-anọpụ iche, nkezi molekụla uka, ma ọ bụ otu ion? Tụnyere nkezi uru nnọpụiche ozugbo na ọnụ ọgụgụ dịpụrụ adịpụ monoisotopic mass-to-charge na-ewebata ọdịiche abụọ ozugbo.. Kpebie nkwekọrịta na ọrụ ion tupu ịkọwa ihe dị iche dị ka adịghị ọcha kemịkal.
Ntụnyere ion arụ ọrụ. Were ya, naanị maka mgbakọ na mwepụ, na H-GAK-OH na-emepụta ion protonated ugboro abụọ na-enweghị ntinye ndị ọzọ. Site na proton mass nke ExPASy gbara okirikiri 1.00728 Na, oke ibu ga-ebu amụma bụ (274.16409 + 2 × 1.00728) / 2 = 138.089325. Otu uzo protonated bụ 275.17137. Ọ pụtaghị na peptide na-anọpụ iche nwetara ihe fọdụrụnụ; proton agbakwunyere na nkewa site na ụgwọ na-akọwa ihe dị iche.
Maka amide protonated ugboro abụọ kwekọrọ, amụma na-aghọ (273.180074 + 2 × 1.00728) / 2 = 137.597317. Ya mere, nkewa nke acid-to-amide bụ ihe dị ka 0.492008 n'ọnụọgụ ndị na-ebu ibu na-akwụ ụgwọ abụọ, kama 0.984016. Onye nleba anya nke na-etinye mgbakwunye nnọpụiche ozugbo na ọnụ ọgụgụ ọ bụla akwụ ụgwọ nwere ike jụ usoro ziri ezi. Ọmụmaatụ a na-ewere otu ụgwọ na ụdị nkwado maka ọrụ abụọ a; Enweghị ike idozi ụgwọ amaghi ama site na ịkọ ngbanwe.
Mgbe ekenyechara ion, tulee ihe owuwu edere. Maka tripeptide a, nyochaa nke fọdụrụ atọ, abụọ ọnụ ọnụ otu, na ma lysine agbanweela. Ọdịiche a na-akọwaghị nke dị nso na mmụba a ma ama bụ nkọwa onye ndoro-ndoro anya, ọ bụghị ọrụ saịtị. Acetyl isomer nọ n'ọnọdụ nwere ike ịnwe otu mkpokọta mkpokọta mgbe ọ na-etinye otu ahụ na nitrogen dị iche.
Iji mechie ọdịiche ahụ, kwupụta nkọwa nke enyochara na nke ndekọ. Nkọwa ọnụ ọnụ emegharịrị na-edozi nsogbu dị iche site na ọrụ ion emeziri. Chekwaa nsonaazụ mbụ na ihe kpatara mgbazi ka onye nleba anya mechara soro mkpebi ahụ.
Enwere mperi dị iche mgbe ọnụọgụ molekụla gbakọrọ dị mma mana mkpokọta ngwaahịa adịghị mma. Ka e were ya na ntụ ntụ ntụ ntụ nwere njikọ na mmiri nke ekenyebeghị oke ya. Ịbanye oke nnọpụiche ziri ezi na mgbako ịta ahụhụ anaghị ewepụ onyinye ha na ntụ ntụ a tụrụ atụ. N'aka nke ọzọ, ịlele ọdịnaya peptide anaghị edozi nhazi njedebe enweghị nkọwapụta. Ngụkọta na ihe omume ego ọrụ chọrọ akaebe dị iche iche.
Debe mpempe akwụkwọ enweghị nkwekọrịta kọmpat: nhazi ọkwa, mgbakọ ukwu, na-anọpụ iche pụta, Atụmatụ ion usoro, hụrụ uru, na fọdụrụ iche. Dekọọ nọmba etiti tupu ịmechie ngosi ikpeazụ. Onye nyocha ọzọ nwere ike megharịa ntụnyere ahụ wee hụ ma okwu a na-edozibeghị gbasara mgbakọ na mwepụ, ọrụ ion, ma ọ bụ kemistri.
Ajụjụ a na-ajụkarị
Kedu ihe kpatara m ji agbakwunye mmiri mgbe ị na-agbakọ peptide sitere na ihe ndị fọdụrụ? Ọtụtụ ndị fọdụrụ na-ahapụ atom ndị achọrọ iji mechaa njedebe abụọ efu nke peptide linear.. Otu mmiri na-eweghachi ihe mejupụtara ahụ. Ọnụ ọnụ ọnụ ma ọ bụ kemistri mgbanaka dị iche iche chọrọ usoro edoziziri nke ọma.
C-terminal amidation ọ na-abawanye oke peptide? N'ihe metụtara ọdụ ụgbọ ala carboxyl efu kwekọrọ, Amidation nkịtị na-ebelata oke monoisotopic site na mkpokọta 0.984016 Na. Usoro ntụaka dị mkpa; "ịgbakwunye amide" abụghị ntụziaka ngụkọ zuru oke.
Nwere ike abụọ peptides gbanwetụrụ dị iche iche nwere otu uka? Ee. Otu acetyl dị na saịtị dị iche iche tozuru oke nwere ike iwepụta isomers ọnọdụ nwere ihe mejupụtara ya. Usoro isomers na stereoisomers nwekwara ike ịkekọrịta oke. Achọkwu ihe akaebe nhazi.
Kedu uru m ga-ezigara ndị otu teknụzụ? Zipu nkọwa ebumnuche zuru oke yana nnukwu monoisotopic na-anọpụ iche ma ọ bụ nkezi molar mass, dị ka o kwesịrị. Rịọ ndị otu ahụ ka ha kwado otu ọnụ ọnụ na ntụnyere nha kama izipu nọmba enweghị nkọwa.
