Azịza ngwa ngwa
Ngwakọta glycopeptide omenala chọrọ nkọwa nke ma peptide na mgbanwe carbohydrate ya. Ngwakọta glycan, usoro peptide, na ex…
Omenala Glycopeptide Synthesis - Ezipụta na Nyochaa Ọdịdị Ọdịdị
Ngwakọta glycopeptide omenala chọrọ nkọwa nke ma peptide na mgbanwe carbohydrate ya. Ngwakọta glycan, usoro peptide, na mkpokọta a na-atụ anya ka nwere ike ịhapụ saịtị mgbakwunye ahụ, njikọ, ma ọ bụ nkesa isomer edozibeghị. Ekwesịrị ịhọrọ atụmatụ nyocha dabere n'ime ụdị ndị ahụ nnwale ahụ kwesịrị iguzobe.
Maka ebumnuche akọwapụtara, ezipụta usoro peptide, njedebe, nhazi ebe ọ dị mkpa, ihe fọdụrụ ma ọ bụ ihe fọdụrụ gbanwetụrụ, na nhazi glycan ezubere na saịtị ọ bụla. Ọ bụrụ na ihe ahụ na-ama ụma bụrụ ngwakọta, kọwapụta ngwakọta e bu n'obi kama ịkpọ ya otu glycopeptide otu.
Glycan heterogeneity nwere ike ịgụnye ọnụnọ dị iche iche, ụdị carbohydrate dị iche iche, ihe owuwu dị iche iche nwere otu ihe mejupụtara, ma ọ bụ saịtị mgbakwunye dị iche iche na peptide. Ndị a bụ nsogbu ndị metụtara ya, mana ha niile anaghị aza otu nha. Arịrịọ bara uru kpọrọ aha ejighị n'aka kama ịrịọ naanị maka “dị ọcha glycopeptide”.
Nke ibe ọkọlọtọ ProForma depụtara ikpeazụ version 2.1 maka nkọwapụta nke ụdị peptide. Usoro glycopeptide nwekwara ike ịchọ nkọwa nhazi nke glycan karịa nhazi. Debe saịtị ndị akọwapụtara, njirimara glycan na ezigbo nhazi a na-edozibeghị nke ọma karịa ikwe ka eriri mara mma kwupụta ihe akaebe ahụ..
Kedu ihe kpatara oke nha nhata ezughi oke maka nzọrọ ngwaahịa otu?
Ndị isomer dị iche iche nwere ike ịkekọrịta otu ihe mejupụtara ya. Otu uka dabara na peptide gbakwunyere glycan a chọrọ n'onwe ya anaghị ewepụta saịtị njikọ ma ọ bụ mgbakwunye ọ bụla.. Otu njirimara chromatographic anaghị egosikwa na ekewapụla isomers niile dị mkpa.
N'aka nke ọzọ, ọtụtụ atụmatụ anaghị apụta ozugbo ọtụtụ ihe mejupụtara glycan. Nlebanya chọrọ nkọwa site na iji nkewa n'ezie, ụdịdị dị iche iche, na ihe atụ akụkọ ihe mere eme. Zenarị ịkpọ aha otu ihe kpatara ya site na ọnụ ọgụgụ kacha elu naanị.
Kisspeptine Chọpụta ihe dị iche na nhazi mpaghara. Iberibe nke metụtara glycan nwere ike inye aka gosi na mgbaàmà metụtara carbohydrate dị, ebe ọrụ saịtị chọrọ ihe akaebe na-ejikọta mgbanwe na ọnọdụ peptide. Ekwesịrị inyocha nkọwa ngwanrọ maka ihe akaebe na-akwado ọdịiche ahụ.
Were otu ụzọ rụọ ọrụ tupu ịhọrọ usoro
Otu ụzọ ebumnuche ebumnuche. Tụlee H-ASATK-OH linear na otu glycan O-njikọ akọwapụtara ma na Ser2 ma ọ bụ na Thr4, kemistri ndị ọzọ niile Njikọ Peptide dakọtara. Nhọrọ abụọ a nwere otu glycan na otu peptide. Ya mere, egwuregwu mejupụtara precursor na-ahapụ ajụjụ saịtị ahụ oghe.
Akụkụ azụ azụ N-terminal ASA gụnyere Ser2 mana ewepu Thr4. Akụkụ C-terminal TK gụnyere Thr4 mana ewepu Ser2. Ọ bụrụ na iberi ekenye nke ọma, chekwaa glycan dị mkpa ma ọ bụ ihe fọdụrụ na saịtị na-enye ihe ọmụma ziri ezi, ha nwere ike ịmata ọdịiche ndị ọzọ. Naanị ion nke glycan enwetara anaghị ejikọta akara carbohydrate ahụ na otu n'ime ọnọdụ peptide ndị ahụ. Iberibe ọkpụkpụ azụ nke tụfuru mgbanwe dị mkpa nwere ike ghara ịkọwapụta ya.
Nke a bụ maapụ ozi achọrọ, Ọ bụghị ụdịdị dị iche iche buru amụma ma ọ bụ nyocha akwadoro maka ASATK. Usoro ahọpụtara ga-ewepụtarịrị nleba anya ihe ọmụma na ịkpa oke zuru oke yana nkọwa kwesịrị ekwesị. Akara ngwanrọ ma ọ bụ saịtị njikọ ebumnuche enweghị ike mejupụta mmekọrịta na-efu n'etiti glycan na ọnọdụ peptide.
Otu ịkpachara anya na-emetụta ọnụọgụgụ. Mgbama ike ma ọ bụ mpaghara chromatographic abụghị na akpaghị aka nha molar nke glycoform ọ bụla. Ọdịiche nzaghachi na ụdị nha chọrọ nyocha tupu ekenye ego ole sitere na ngwakọta edozibeghị.
A iche iche echiche ngwakọta ngụkọta oge. Ka e were ya na glycoforms abụọ dị na 50 nmol nke ọ bụla. Ọ bụrụ na ọnụọgụ nzaghachi nke nchọpụta ha n'okpuru otu ụdị linear e chere bụ otu mpaghara na abụọ n'otu nmol, ha na-emepụta ebe nke 50 na 100. Nhazi mpaghara na-akọ otu ụzọ n'ụzọ atọ na ụzọ abụọ n'ụzọ atọ, n'agbanyeghị nha nha molar nha. Ọnụọgụ ndị echepụtara echepụta na-egosi ihe atụ nha; A naghị atụ ha ihe nzaghachi maka otu ụzọ glycan.
Nkewa na-eme ka ihe mejupụtara ya dị mfe ịhụ mana ọ bụghị n'onwe ya na-ewepụta nzaghachi nha anya. Mkpesa ego chọrọ nhazigharị kwesịrị ekwesị ma ọ bụ ọrụ ọzọ ziri ezi, gụnyere mgbake dị mkpa na ejighị n'aka. Kwuo oke mpaghara dịka oke mpaghara mgbe nke ahụ bụ nsonaazụ akwadoro, kama ịtụgharị ya na nzuzo ka ọ bụrụ ebe glycoform ma ọ bụ ịdị ọcha.
Myristoyl Pentapeptide 4 Ndụmọdụ Hoofnagle na ndị ọrụ ibe maka nyocha peptide na-ejikọta njirimara molekụla, quantification, na njikwa. Maka glycopeptide omenala, nkuzi n'ozuzu bụ idekọ kpọmkwem ụdị akọwapụtara na ọnụọgụ na-akwado nnwale ahụ, kama ibufe uru ịdị ọcha peptide zuru oke na nkwubi okwu glycoform ọ bụla.
Kedu ka esi ahọrọ ụzọ nkewa na nkewa?
Malite na ajụjụ a: mkpokọta mejupụtara, peptide usoro, saịtị glycosylation, glycan mma Ọdịdị, ma ọ bụ nkesa ndị ọzọ. Jụọ ajụjụ ndị nwere ike ịmata ọdịiche dị n'etiti ndị chọrọ n'okpuru ihe nlele na ọnọdụ akụrụngwa.
Riley na ndị ọrụ ibe atụnyere atụmatụ nkewa maka emebibeghị N- na O-glycopeptides, ịchọta ihe dị mkpa dị iche iche na njirimara na arụmọrụ ebe-ebe saịtị. Ọrụ ha na-akwado ịkwado usoro ahụ na nyocha na ajụjụ. Ọ naghị ekwe nkwa nhazi glycan zuru oke ma ọ bụ mpụta nke ọma maka ebumnuche omenala ọ bụla.
Ụzọ dabere na ndakọrịta nwere ike inye ozi metụtara glycan na peptide bara uru, mana nkwụsị nke mgbanwe ahụ n'oge nkewa nwere ike ime ka otu saịtị dị mgbagwoju anya. Usoro dabere na elektrọn ma ọ bụ jikọtara ọnụ nwere ike inye nkwado nkwado. Ma aha usoro ma ọ bụ ngwá ọrụ dị elu na-ekwe nkwa nhazi zuru oke maka onye nyocha ọ bụla.
Campbell na ndị ọrụ ibe jiri agagharị dị iche iche na tandem mass spectrometry iji mata ọdịiche dị iche iche MUC5AC ọnọdụ isomers nwere GalNAc na Thr3 ma ọ bụ Thr13.. Nke a bụ ngosipụta pụtara ìhè maka ụzọ abụọ ahụ, karịa mkpebi zuru ụwa ọnụ nke ngwakọta glycopeptide ọ bụla.
Mkpebi bara uru bụ ịchọ ihe akaebe maka nkwupụta ahụ kpọmkwem. Ọ bụrụ na usoro dị adị na-akwado nhazi mana ọ bụghị saịtị ma ọ bụ njikọ na-ese okwu, kọọ ọkwa akwadoro ma chọpụta ajụjụ agbakwunyere. Atụgharịla ihe omume akụkụ ka ọ bụrụ nhazi akọwapụtara nke ọma n'ihi na arịrịọ njikọ ahụ bu n'uche otu.
Kedu ka ihe atụ echiche atọ si gbanwee mkpebi ahụ?
Ihe atụ nke mbụ: otu saịtị N-glycosylation akọwapụtara na ebumnuche omenala akọwapụtara. Ụlọ nyocha ahụ chọrọ ịkwado ụdị peptide na ọrụ glycan e bu n'obi tupu iji ya dị ka onye nyocha nyocha.. Usoro a na-enye nchịkọta ihe ọmụma na ihe akaebe metụtara saịtị, mana nkwuputa njikọ glycan ka enyochabeghị nke ọma.
Ikpe: ihe akaebe nwere ike ịkwado ihe mejupụtara dị warara na njedebe saịtị ma ọ bụrụ na ọrụ ya zuru oke. E kwesịghị igosi ya Myristoyl Pentapeptide 8 dị ka nkwenye nke ọma glycan zuru oke. Nzọụkwụ nyocha na-esote dabere ma njikọ ahụ edozibeghị ọ dị mkpa maka ọrụ onye comparator.
Ihe atụ nke abụọ: ọtụtụ ndị nyocha serine ma ọ bụ saịtị threonine maka O-glycan. Uka a tụrụ atụ dabara na mgbakwunye glycan, mana iberibe ihe ndị dịnụ anaghị amata saịtị mgbakwunye enwere ike. Ọrụ a na-atụnyere mmetụta glycosylation n'otu ihe fọdụrụnụ.
Ikpe: ihe akaebe n'otu mpaghara na-efu na-egbochi nkwubi okwu saịtị ahụ akọwapụtara. Rịọ usoro na nkọwa nwere ike ịmata ọdịiche dị n'ọkwa onye chọrọ. Pasent dị elu-ọcha mpaghara ma ọ bụ saịtị njikọ ezubere enweghị ike dochie anya ihe akaebe ikpeazụ achọrọ.
Ihe atụ nke atọ: Ngwakọta nke isomers ọnọdụ ewepụtara kpachara anya. Ihe oru ngo a kwesiri inyocha ihe ndi ozo iche iche, mana nha dị ugbu a na-ejikọta akara ha. Ngụkọta ngwakọta nke ngwakọta kwekọrọ na ihe a na-atụ anya ya. Myristoyl Tetrapeptide 12
Ikpe: naanị ihe mejupụtara ezughị oke maka ikenye omume ma ọ bụ oke akụkụ nke ọ bụla. Nyochaa atụmatụ nkewa na njirimara dabara adaba, iji ụkpụrụ dabara adaba ma ọ bụ ihe akaebe ndị ọzọ ebe ọ dị mkpa. Usoro egosiri na ụzọ isomer ọzọ bụ onye ndoro-ndoro anya, ọ bụghị ihe akaebe na ngwakọta a ga-edozi. Baysidepeptides
Ihe atụ atọ a na-akụzi ihe atụ, arụpụtaghị nsonaazụ nchịkọta akọghị. Mkpebi dị iche iche na-esote site na nkwupụta nnwale dị iche iche, ọbụlagodi mgbe dataset ọ bụla nwere oke molekụla nwere ezi uche.
Kedu njikwa na ndekọ na-eme ka ntụnyere glycopeptide tụgharịrị?
| Ebumnuche nnwale | Nhọrọ mgbanwe | Njikwa ma ọ bụ comparators | Ngụpụta nyocha na oke |
|---|---|---|---|
| Nyochaa mmetụta nke glycan akọwapụtara | Nhazi akọwapụtara na saịtị peptide akọwapụtara | Comparator na-enweghị glycosylated kwesịrị ekwesị yana njikwa nyocha | Nkwenye ihe owuwu gbakwunyere ngụpụta arụrụ arụrụ onwe ya; enweghị ntụzịaka nke mmetụta |
| Tulee saịtị mgbakwunye | Otu glycan e bu n'obi na ọnọdụ akọwapụtara iche | Ndị na-atụnyere ọnọdụ egosipụtara na ntọala ego dakọtara | Ihe akaebe na-ahụ maka ebe saịtị na ntụnyere ọrụ n'ime ọnọdụ nwalere |
| Mara ngwakọta isomer | Ụdị ọkwa ọkwa akọwapụtara nke ọma ma ọ bụ oke ngwakọta | Ihe akaebe dị mkpa na njikwa nkewa | Ekpeziri ma ọ bụ nke ọzọ nwere ike iche ọrụ; enweghị mgbanwe mpaghara-na-mole akpaka |
| Jiri fluorescent glycopeptide nyocha | Akọwapụtara glycan yana fluorophore dị n'ụzọ doro anya | Njikwa ndị metụtara enweghị akara na akara dị mkpa | Mgbama na akaebe ọrụ onwe; fluorescence naanị adịghị emepụta njikọ |
Glycosylation nwere ike ịgbanwe ihe ndị metụtara solubility, mmekọrịta, na nnabata, mana ntụzịaka maka ebumnuche ọhụrụ ga-enyocharịrị. Onye comparator enweghị glycosylated na-aza ntụnyere nhazi akọwapụtara; ọ bụghị na-akpaghị aka na-adịghị mma akara. Akara akara agbakwunyere na-ewebata mgbanwe ọzọ kwesịrị ịkọwapụta yana nyochaa iche.
Debe nkọwa nhazi anabatara, otutu nkewa, mkpa raw spectra, chromatographic ma ọ bụ ozi ngagharị, ntọala usoro, ihe omume, na nkọwa ndị ọzọ ọnụ. Dekọọ ndabere nke ọnụọgụ, nkwadebe sample, na njikwa akụkọ ihe mere eme na-ejikọta njirimara na nnwale na-arụ ọrụ.
Debe ihe ndị ọzọ a tụlere n'oge ọrụ. Akụkọ nwere ike ịkwado otu ihe mejupụtara glycan yana saịtị mpaghara ebe ọ na-ahapụ njikọ ma ọ bụ nhazi anomeric na-edozibeghị. Onye ọzọ nwere ike ịkwado ngwakọta agwakọta na-edozighị ihe mejupụtara ya. Debe ọkwa ndị a ka ọ dị iche mgbe ọmụmụ ihe emechara atụnyere njirimara ma ọ bụ ọrụ, Ya mere, a naghị eji ọrụ nhazi akụkụ dị ka ihe akaebe zuru oke.
Arịrịọ teknụzụ lekwasịrị anya bụ: “Biko chọpụta ihe akaebe na-akwado njirimara peptide, glycan mejupụtara, saịtị mgbakwunye, na njikọ glycan ọ bụla akọwapụtara. Kwupụta ebe usoro dị ugbu a na-enweghị ike ịmata ọdịiche dị iche iche na ọrụ mgbakwunye a ga-achọ maka ntụnyere anyị bu n'obi."
Maka ntụnyere atụnyere, chọpụta ma ihe a na-achọsi ike bụ saịtị, glycan mma Ọdịdị, akụkụ akụkụ ma ọ bụ àgwà ọzọ. Họrọ ọrụ na-esote maka oghere ahụ. Nsonaazụ-naanị ihe mejupụtara nwere ike ịnọgide na-aba uru mgbe akpọrọ ya nke ọma, ebe nnwale pụrụ iche saịtị chọrọ ihe akaebe na-egosi ọdịiche dị na saịtị ndị ndoro-ndoro anya.
Ajụjụ a na-ajụkarị
Otu glycopeptide uka pụtara otu glycoform? Mba. Isomers nwere ike kesaa ihe mejupụtara na oke. Kpebie ụzọ ọzọ nkewa dị na ihe akaebe nhazi nwere ike ịmata.
Ọ bụ otu n'ime ụzọ kachasị mma maka glycopeptide ọ bụla? Mba. Nhọrọ usoro dabere na nyocha, ụdị mgbakwunye, ebubo na omume nkewa, na ajụjụ nhazi. Nyochaa ihe akaebe maka ebumnuche n'ezie.
chromatogram dị ọcha nwere ike guzobe saịtị glycosylation? Ọ bụghị n'onwe ya. Mkpesa akọwapụtara saịtị ahụ chọrọ ihe akaebe nhazi dabara adaba, karịsịa mgbe ọtụtụ ọnọdụ nwere ezi uche.
Mgbe nyocha ọzọ dị mkpa? Mgbe saịtị na-edozibeghị, njikọ, ngwakọta akụrụngwa, ma ọ bụ nkọwa ọnụọgụgụ dị mkpa na nkwubi okwu a zubere. Kọwaa ọdịiche ahụ nke ọma ka usoro na-esote zaa ajụjụ ziri ezi.
