Модификации на пептиди
Цикличен пептид
Што е цикличен пептид?
Цикализацијата на пептидите за да се формираат циклични пептиди или циклизирани пептиди е често користена стратегија за развој на пептиди со зголемена конформациска стабилност во споредба со нивните линеарни аналози. Цикличните пептиди се покажаа како корисни за неколку апликации, вклучувајќи ја и мимиката на протеинските секундарни структури, како што се протеинските јамки, и оптимизација на пептидните лиганди со зголемена моќ на врзување, селективност, и зголемена стабилност на протеазата.
Конфигурации за циклизација
Примарните пристапи за врзување за синтеза на лактамски циклични пептиди се од глава до опашка, страничен синџир на страничен синџир, синџир од глава до страна, и страничен синџир до опашка,во зависност од локацијата на функционалните групи во рамките на пептидната низа.
Упатете се кон опашката
·Се јавува помеѓу N-крајот до C-крајот.
·Преку формирање на амидна врска (лактамизација).
·Најчесто употребуваната циклизација која дава поголема стабилност.
Страничен синџир до глава
Се јавува помеѓу N-крајот и внатрешен COOH
(на пр. ß-COOH-групата на Asp или γ-COOH-групата на Glu).
Страничен синџир до опашка
Се јавува помеѓу внатрешните NH2 и C-крајот
(на пр. ε-NH2-групата на Lys).
Страничен синџир до страничен синџир
Се јавува помеѓу страничниот синџир на лизин (ε-NH2-група на Lys) до Аспарагинска или Глутаминска киселина (γ-COOH-група).
Избрани цитати
Дизајн и NMR студии на циклични пептиди кои го таргетираат N-терминалниот домен на протеинот тирозин фосфатаза YopH
Ние известуваме за дизајнот и евалуацијата на новите циклични пептиди кои го таргетираат N-терминалниот домен на протеинот тирозин фосфатаза YopH од Yersinia. Цикличните пептиди се дизајнирани врз основа на кратка секвенца од протеинот SKAP-HOM [НА(pY)DDPF (pY = фосфотирозин)], а сите го содржат мотивот DEZXDPfK (каде што Z е фосфотирозин или нехидролизиран фосфотирозин миметик, X е аспарагинска киселина или леуцин, а f е д-фенилаланин). Овие пептиди претставуваат архитектура „од глава до опашка“., овозможувајќи цикализација преку формирање на амидна врска помеѓу страничните синџири на првата аспарагинска киселина и остатоците од лизин. Студии за хемиско поместување на пертурбации се спроведени за да се следи врзувањето на овие пептиди за N-терминалниот домен на YopH. Пептидите кои содржат дел од фосфотирозин покажуваат сврзувачки афинитети во низок микромоларен опсег; замената на фосфотирозин со еден од неговите нехидролизирани деривати драматично ги намалува сврзувачките афинитети. Овие прелиминарни студии може да го отворат патот за откривање на помоќни и селективни лиганди базирани на пептиди на YopH N-терминалниот домен кои би можеле дополнително да се истражат за нивната способност да ги инхибираат инфекциите со Yersiniae.
Поврзани услуги за модификација на пептиди
пептидна гликозилација
пептидна гликозилација
Пептидната гликозилација е ковалентна модификација која потенцијално може да ги подобри физичко-хемиските својства на пептидите
Прочитај повеќепептидна фосфорилација
пептидна фосфорилација
Може да дојде до фосфорација на серин (С, Да се биде), Треонин (Т, Тр) и тирозин (Y, Тир) странични синџири со формирање на фосфоестерска врска
Прочитај повеќеСпоени пептиди
Споени пептиди
Воведување на две неприродни амино киселини кои содржат α-метил, α-алкенилни групи за време на синтеза во цврста фаза на пептидни синџири.
Прочитај повеќеЦикличен пептид
Цикличен пептид
Циклизирањето на пептидите ја подобрува конформациската стабилност на пептидите (во однос на нивните линеарни аналози) и е вообичаена стратегија во развојот на пептидите.
Прочитај повеќемодификација на пептиди
Долгогодишно искуство во модификација на пептиди, обезбедување на повеќе остварливи патишта за истражување на пептиди.