Stabiele isotopenlabeling is een chemisch reagens waarin de moleculen van een verbinding een of meer stabiele isotoopatomen bevatten en worden geanalyseerd en bepaald met behulp van hun unieke tracereigenschappen.

Stabiele isotooplabelingstechnieken zijn gebaseerd op het principe van het labelen van een reactant door specifieke atomen te vervangen door een isotoop, wat er vervolgens voor zorgt dat de reactant een reactie ondergaat en de atomen detecteert met een verandering in het neutronengetal, die kunnen worden gevolgd door reacties, metabolische routes of cellen. Stabiele isotoop (13C, 15N, 13C15N) gelabelde peptiden worden vaak gebruikt als ‘chemische tags’ in kwantitatieve proteomics voor de detectie en tracering van biologische monsters. Kwantitatieve proteomics-methoden maken voornamelijk gebruik van massaspectrometrie met hoge resolutie om isotoop-gelabelde en niet-gelabelde peptide-ionen of peptide-ionen te scheiden, en gebruik de intensiteitswaarden van hun gedetecteerde signalen voor kwantitatieve berekeningen.

Stabiele isotopenlabelingstechnologie heeft de voordelen van hoge gevoeligheid, eenvoudige positionering en nauwkeurige kwantificering, waardoor isotopenmodificatie steeds meer aandacht krijgt op het gebied van de geneeskunde en biochemie.