Peptide-modificaties
FRET-peptide
Wat is FRET-peptide?
FRET-peptidelabeling heeft een donormolecuul en een acceptor (barstend middel) molecuul. In de meeste gevallen, de donor- en acceptorparen zijn twee verschillende kleurstoffen. Als de acceptor een niet-fluorescerende kleurstof is (barstend middel), de overgedragen energie van de fluorescerende donor wordt omgezet in moleculaire trillingen. Wanneer FRET wordt beëindigd (door donor en acceptor van elkaar te scheiden), er kan een toename in donorfluorescentie worden gedetecteerd. Wanneer zowel donor- als acceptorkleurstoffen fluorescerend zijn, de overgedragen energie wordt uitgezonden als licht met een langere golflengte, waardoor veranderingen in de fluorescentie-intensiteitsverhouding van donor en acceptor kunnen worden gemeten. Voor efficiënt FRET-bursting, de fluorofoor- en barstmiddelmoleculen moeten zich dicht bij elkaar bevinden (~10-100 A) en het absorptiespectrum van het barstmiddel moet overlappen met het emissiespectrum van de fluorofoor. Een zorgvuldige vergelijking van het fluorescentiespectrum van de donor en het absorptiespectrum van het bursting-agent is vereist bij het ontwerpen van FRET-systemen voor donor-bursting-agent.
FRET-peptidenwetenschap
Belangrijkste voordelen van FRET-peptiden:
· Real-time monitoring van enzymatische reacties en eiwitactiviteit.
· Extreem hoge detectiegevoeligheid dankzij unieke, op nabijheid gebaseerde energieoverdracht.
·Veelzijdigheid voor in vitro en in vivo toepassingen, inzicht geven in complexe biologische processen.
|
Fluorofoor
|
Dover
|
Voormalig donor
|
|---|---|---|
|
Abz |
Dnp 2,4-dinitrofenyl |
320 nm/420 nm |
|
Abz |
Dnp 2,4-dinitrofenyl |
320 nm/420 nm |
|
Mca |
Dnp 2,4-dinitrofenyl |
325 nm/392 nm |
|
Trp |
Dnp 2,4-dinitrofenyl |
280 nm/360 nm |
|
FAM |
Dabcyl4-([4'-Dimethylamino)fenyl]kan)benzoyl |
492 nm/517 nm |
|
Lucifer Geel |
Dabsyl4(Dimethylamino)azobenzeen-4'-sulfonyl |
430nm/520nm |
Uitgelichte citaten
Ultragevoelige tumor-penetrerende nanosensoren van proteaseactiviteit
Het vermogen om kankerlaesies te identificeren met endogene biomarkers is momenteel beperkt tot tumoren met een diameter van ongeveer 1 cm. We hebben onlangs een exogeen toegediende tumor-penetrerende nanosensor gerapporteerd die werpt, als reactie op tumorspecifieke proteasen, peptidefragmenten die vervolgens in de urine kunnen worden gedetecteerd. Hier, wij rapporteren de optimalisatie, geïnformeerd door een farmacokinetisch wiskundig model, van de oppervlaktepresentatie van de peptidesubstraten om zowel de splitsing van protease op het doel te verbeteren als de splitsing buiten het doel te minimaliseren, en van de functionaliteit van de nanosensoren met tumor-penetrerende liganden die actieve transportroutes inschakelen om de activering in de micro-omgeving van de tumor te vergroten. De resulterende nanosensor onderscheidde laesies van minder dan 5 mm in menselijke epitheeltumoren en detecteerde knobbeltjes met een gemiddelde diameter kleiner dan 2 mm in een orthotopisch model van eierstokkanker. We demonstreren ook verbeterde receptor-afhankelijke specificiteit van signaalgeneratie in de urine in een immunocompetent model van colorectale levermetastasen, en in situ activering van de nanosensoren in microarrays van menselijke tumoren wanneer ze opnieuw worden ontworpen als fluorogene zymografiesondes.
Gerelateerde diensten voor peptidemodificatie
peptide glycosylatie
peptide glycosylatie
Peptideglycosylatie is een covalente modificatie die mogelijk de fysisch-chemische eigenschappen van peptiden kan verbeteren
Lees meerpeptide Fosforylatie
peptide Fosforylatie
Fosforalatie kan optreden op Serine (S, Zijn), Threonine (T, Thr) en Tyrosine (Y, Tyr) zijketens door vorming van fosfo-esterbindingen
Lees meerGeniete peptiden
Geniete peptiden
Introductie van twee onnatuurlijke aminozuren die α-methyl bevatten, a-alkenylgroepen tijdens vaste-fasesynthese van peptideketens.
Lees meerCyclisch peptide
Cyclisch peptide
Peptidecyclisatie verbetert de conformationele stabiliteit van peptiden (ten opzichte van hun lineaire analogen) en is een gebruikelijke strategie bij de ontwikkeling van peptiden.
Lees meerpeptide modificatie
Uitgebreide ervaring met peptidemodificatie, het bieden van meerdere haalbare wegen voor peptideonderzoek.