Peptide-modificaties
Peptidebiotinylatie
Wat is peptidebiotinylatie?
De detectie van geschikt gelabelde peptiden of gebiotinyleerde peptiden (bijv. met gelabelde antilichamen)De scheiding van gebiotinyleerde peptiden of gelabelde peptiden van niet-gelabelde peptiden (bijv. met gebonden antilichamen)
De tags kunnen kleine organische moleculen zijn, zoals biotine (dat sterk en niet-covalent aan streptavidine bindt) of een korte peptidesequentie. De meest prominente voorbeelden van peptidesequenties die als tags worden gebruikt, zijn epitooptags zoals de Flag-tag, de HA-tag en de Myc-tag. Een recent ontwikkelde tag is de ALFA-peptidetag. Voor alle labels, antilichamen zijn in de handel verkrijgbaar. Zie hieronder voor de respectievelijke reeksen.
MOL Changes synthetiseert routinematig getagde peptiden die verschillende tags dragen. De tags worden gewoonlijk bevestigd aan de N-terminus of de C-terminus (via lysine of cysteïne), maar kan in principe overal geplaatst worden. Alle tags kunnen van het peptide worden gescheiden door een verscheidenheid aan verschillende zogenaamde linkers of spacer-moleculen van verschillende lengte en polariteit. Indien gewenst, linkers kunnen splitsbaar worden gemaakt, bijv. door reductie van gevoelige disulfidebindingen. Bekijk een lijst met beschikbare linkers / afstandhouder / PEGylaties. Hier ziet u een weergave van veelgebruikte tags.
Gebiotinyleerde en getagde peptiden
Hiervoor kunnen affiniteitstags zoals biotine worden gebruikt
·De detectie van op de juiste wijze getagde peptiden of gebiotinyleerde peptiden (bijv. met gelabelde antilichamen)
·De scheiding van gebiotinyleerde peptiden of gelabelde peptiden van niet-gelabelde peptiden (bijv. met gebonden antilichamen)
De tags kunnen kleine organische moleculen zijn, zoals biotine (dat sterk en niet-covalent aan streptavidine bindt) of een korte peptidesequentie. De meest prominente voorbeelden van peptidesequenties die als tags worden gebruikt, zijn epitooptags zoals de Flag-tag, de HA-tag en de Myc-tag. Een recent ontwikkelde tag is de ALFA-peptidetag. Voor alle labels, antilichamen zijn in de handel verkrijgbaar. Zie hieronder voor de respectievelijke reeksen.
MOL Changes synthetiseert routinematig getagde peptiden die verschillende tags dragen. De tags worden gewoonlijk bevestigd aan de N-terminus of de C-terminus (via lysine of cysteïne), maar kan in principe overal geplaatst worden. Alle tags kunnen van het peptide worden gescheiden door een verscheidenheid aan verschillende zogenaamde linkers of spacer-moleculen van verschillende lengte en polariteit. Indien gewenst, linkers kunnen splitsbaar worden gemaakt, bijv. door reductie van gevoelige disulfidebindingen.
|
Affiniteitstag
|
Reeks
|
Opmerking
|
|---|---|---|
|
Vlag-label |
DYKDDDDK |
Anti-vlag-antilichaam |
|
HA-dag |
YPYDVPDYA |
Anti-HA-antilichaam |
|
Veel tijd |
EQKLISEEDL |
Anti-Myc-antilichaam |
|
CPP
|
Reeks
|
Opmerking
|
|---|---|---|
|
Tat (47-57) |
YGRKKRRQRR |
Celdoordringend peptide |
|
Oligo-Arginine |
RRRRRRRRR |
Celdoordringend peptide |
MOL Changes kan u ook voorzien van een breed scala aan reactieve labels die aan peptiden zijn bevestigd. Voorbeelden zijn de introductie van
- Aziden (reactie met alkinen – klikchemie)
- Bij het schilderen (reactie met thiolen, bijv. Cys)
- Thiolen (reactie met maleïmiden)
- Cys(Pys/Npys) (reactie met thiolen om disulfiden te vormen)
Uitgelichte citaten
Myeloïde-specifieke menselijke CD33 is een remmende receptor met een differentiële ITIM-functie bij het rekruteren van de fosfatasen SHP-1 en SHP-2
CD33 is een myeloïde specifiek lid van de siaalzuurbindende receptorfamilie en komt in hoge mate tot expressie op myeloïde voorlopercellen, maar op veel lagere niveaus in gedifferentieerde cellen.. Menselijk CD33 heeft twee tyrosineresiduen in zijn cytoplasmatische domein (Y340 en Y358). Wanneer gefosforyleerd, deze tyrosines zouden kunnen functioneren als aanlegplaatsen voor de fosfatasen, SHP-1 en/of SHP-2, waardoor CD33 kan functioneren als een remmende receptor. Hier demonstreren we dat CD33 tyrosine-gefosforyleerd is in aanwezigheid van de fosfataseremmer, doordringen, en rekruteert SHP-1 en SHP-2. Co-expressiestudies suggereren dat de kinase Lck van de Src-familie effectief is bij het fosforyleren van Y340, maar niet Y358, wat suggereert dat deze residuen kunnen functioneren bij de selectieve rekrutering van adaptermoleculen en verschillende functies hebben. Verdere ondersteuning voor overlapping, maar niet overbodig, De rollen voor Y340 en Y358 komen uit peptidebindingsstudies die de rekrutering van zowel SHP-1 als SHP-2 naar Y340 aan het licht brachten, maar alleen SHP-2 naar Y358. Analyse met behulp van mutanten van SHP-1 toonde aan dat binding van Y340 van CD33 voornamelijk aan het amino Src-homologie-2-domein van SHP-1 plaatsvond.. Het potentieel van CD33 om als remmende receptor te functioneren werd aangetoond door zijn vermogen om door CD64 geïnduceerde calciummobilisatie in U937 neerwaarts te reguleren.. De afhankelijkheid van deze remming van SHP-1 werd aangetoond door het blokkeren van CD33-gemedieerde effecten met dominant negatief SHP-1. Dit resultaat impliceert dat CD33 een remmende receptor is en ook dat SHP-1-fosfatase een belangrijke rol speelt bij het mediëren van de CD33-functie.. Verder onderzoek is essentieel om de receptor te identificeren(S) dat CD33 in vivo en de functie ervan bij de ontwikkeling van myeloïde lijnen remt.
Gerelateerde diensten voor peptidemodificatie
peptide glycosylatie
peptide glycosylatie
Peptideglycosylatie is een covalente modificatie die mogelijk de fysisch-chemische eigenschappen van peptiden kan verbeteren
Lees meerpeptide Fosforylatie
peptide Fosforylatie
Fosforalatie kan optreden op Serine (S, Zijn), Threonine (T, Thr) en Tyrosine (Y, Tyr) zijketens door vorming van fosfo-esterbindingen
Lees meerGeniete peptiden
Geniete peptiden
Introductie van twee onnatuurlijke aminozuren die α-methyl bevatten, a-alkenylgroepen tijdens vaste-fasesynthese van peptideketens.
Lees meerCyclisch peptide
Cyclisch peptide
Peptidecyclisatie verbetert de conformationele stabiliteit van peptiden (ten opzichte van hun lineaire analogen) en is een gebruikelijke strategie bij de ontwikkeling van peptiden.
Lees meerpeptide modificatie
Uitgebreide ervaring met peptidemodificatie, het bieden van meerdere haalbare wegen voor peptideonderzoek.