Azịza ngwa ngwa
O na-anọchi anya pyrrolysine, akpọchiri Pyl, n'usoro usoro amino acid agbatịkwuru nke na-amata ihe fọdụrụ na mkpụrụ ndụ ihe nketa. It is distinct from the s…
O na Amino acid notation - Pyrrolysine, Ọdịnihu na Mgbanwe Ọdịdị
Tripeptide-1 N'ogbe Peptide megide protein O na-anọchi anya pyrrolysine, akpọchiri Pyl, n'usoro usoro amino acid agbatịkwuru nke na-amata ihe fọdụrụ na mkpụrụ ndụ ihe nketa. Ọ dị iche na koodu lysine ọkọlọtọ K. Tupu ịkọwa O na ndekọ, gosi na ederede bụ usoro peptide site na iji mgbakọ ahụ: na usoro ọgwụ, O na-egosi oxygen, na akara mpaghara enweghị nkọwa chọrọ nkọwa karịa ọrụ amino acid akpaka.
Ụdị mgbanwe atọ na-enyere aka ịhazi nkọwa: usoro ndetu, njirimara e kenyere ndị fọdụrụnụ, na ọnọdụ nke fọdụrụ na yinye. Ịgbanwe nke ọ bụla nwere ike imetụta nkwubi okwu dị iche. Ihe atụ ndị dị n'okpuru na-akụzi echiche n'echiche ma ekwuputala ọrụ a tụrụ atụ, nkwụsi ike, ma ọ bụ synthesis ekwe omume.
Malite na isi iyi nke akara ahụ
Nke RESID nchekwa data FAQ na-akọwapụta O/Pyl dị ka pyrrolysine ma detu aha dị iche iche na ụfọdụ ọdụ data na mmemme.. Ihe dị iche iche bụ ihe mere ị ga-eji nyochaa mgbakọ ndekọ, enyeghị ikike iji lysine dochie Pyl chemically. Chekwaa usoro izizi na nkọwa ya mgbe ị na-ebufe ebumnuche.
Hao na ndị ọrụ ibe' 2002 akwụkwọ nhazi methyltransferase na-akọ otu ihe fọdụrụ n'ime koodu UAG na methanogen wee tụpụta L-pyrrolysine.. N'ụzọ dị iche, nke Tebụlụ koodu mkpụrụ ndụ ihe nketa NCBI na-akara akara ụdị DNA codeon TAG kwekọrọ dị ka nkwụsị; NCBI na-akọwa ojiji nke T na tebụl ndị ahụ maka RNA U. Ọnọdụ ndu dị mkpa, Ya mere, ihe omume UAG aka ike agaghị eme ka ọ bụrụ Pyl.
Ntugharị usoro Amino acid na ntụgharị nucleotide bụ ọrụ dị iche iche. Ịgụ O n'akwụkwọ ndekọ aha protein anaghị achọ ime ka à ga-asị na O bụ nucleotide. Ịsụgharị usoro nucleic-acid chọrọ koodu mkpụrụ ndụ ihe nketa kwesịrị ekwesị na ọnọdụ ndu, kama iji amino acid pụrụ iche dochie nkwụsị ọ bụla pụtara ìhè.
Mgbanwe otu: gbanwee ọnọdụ ndetu mgbe ị na-edobe agwa
Otu agwa ebipụtara nwere ike isonye n'asụsụ dị iche iche. Na mpaghara usoro nwere mgbakọ O/Pyl doro anya, ọ na-egosi ihe fọdụrụ. Na usoro ihe omimi, ọ na-agụta ikuku oxygen. N'ihe oyiyi nke ndekọ ochie, ọ nwedịrị ike ịdị mkpa ka ọ dị iche na ọnụọgụ ọnụọgụgụ. Ọdịnihu na-agbanwe nkọwa ya na-agbanweghị ọdịdị nke agwa.
| Okwu | Otu esi akọwa O | Ihe ị ga-elele tupu ịga n'ihu |
|---|---|---|
| Usoro peptide ma ọ bụ protein akọwara na-akwado koodu agbatịkwuru | Pyrrolysine fọdụrụnụ, Pyl | Nkọwa isi mmalite, ọnọdụ, na nkọwa ndị dabara adaba |
| Usoro ọgwụ | Oxygen mmewere akara | Formula syntax na atom agụta |
| Mbiri nke ụlọ nyocha mpaghara enweghị nkọwa | Pụtara ka ekwetaghị | Igodo akara ma ọ bụ nkọwa sitere n'aka onye dere ndekọ ahụ |
| Onyonyo ma ọ bụ ederede nwere ederede na-enweghị isi | Nwere ike ịbụ okwu ederede chọrọ nyocha | Ndekọ izizi na ọdịiche dị n'etiti mkpụrụedemede O na efu |
| Usoro Nucleotide ma ọ bụ mmepụta ntụgharị asụsụ | Na-achọ nyocha nke ubi na mgbakọ ntụgharị asụsụ | Ụdị usoro, tebụl koodu, na nkọwa ndu |
Mmetụta a na-atụ anya ya nke ime ka okwu doo anya bụ nkọwa ka mma, ọ bụghị mgbanwe na molekul dị n'okpuru. Imezi ndegharị nwere ike ịgbanwe ebumnuche echere, Otú ọ dị, ọ bụrụ na nkọwa nke mbụ ezighi ezi. Chekwaa ma ndekọ izizi yana ndezi ederede kama ịmegharị ederede ahụ n'ime nkịtị.
Ejikwala K dochie O na-akwadoghị naanị n'ihi na mmemme na-anabata K. Ngbanwe teknụzụ dabara adaba nwere ike ịgbanwe ihe kemịkalụ. Peptides nke Middleman Ọ bụrụ na ngwá ọrụ enweghị ike ịnọchite anya ihe fọdụrụ ezubere, jiri nkọwa kwesịrị ekwesị ma ọ bụ nnochite anya ọzọ nke enwere ike ịchọpụta ihe ọ pụtara.
Mgbanwe abụọ: dochie pyrrolysine na lysine n'otu ọnọdụ
Ịkụzi echiche: ebumnobi fọduru anọ ka edere GOAS, ya na O kọwara nke ọma dị ka Pyl nọ n'ọnọdụ 2. Iji K dochie ihe fọdụrụ ahụ na-enye GKAS. Ọnụọgụ nke fọdụrụ fọdụ anọ, mana njirimara fọdụrụ na ihe mejupụtara kemịkalụ na-agbanwe. Usoro abụọ a kwesịrị inwe nkọwa ebumnuche dị iche iche yana gbakọọ nke ọma.
Mgbanwe ahụ akwadoghị amụma zuru ụwa ọnụ gbasara ụgwọ, solubility, ma ọ bụ ọrụ ndu. Mmekọrịta Pyrrolysine na lysine adịghị eme ka agbụ akụkụ ha gbanwee. Tripeptide 1 Onye nrụpụta Ịkọwa ihe onwunwe nkịtị, tụlee kpọmkwem ihe owuwu, usoro nke ọzọ, njedebe, mgbanwe, na ọnọdụ nke nha.
Ntụnyere bara uru ga-akọwapụta ihe oru ngo a na-achọ ịmụta site na nnọchi ma jide njiri mara ndị ọzọ dabara adaba. O kwesịkwara ịchọpụta arịa ọ bụla a tụlebeghị. Mgbanwe nhazi a gbakọọ dị iche na mgbanwe arụrụ arụ egosipụtara na nnwale.
Maka iwu, Rịọ ndị otu teknụzụ ka ha kwado njirimara kemịkalụ zuru oke karịa naanị akwụkwọ ozi nke ụdị ntinye anabatara. Ọ bụrụ na ndị na-ebubata ihe na-atụ aro nnọchi ma ọ bụ ihe ewepụtara echedoro, chọpụta ma ọ dabara na ebumnuche ikpeazụ echere. Isi iyi nke ngọngọ ụlọ amino acid abụghị ihe akaebe na-egosi na ewepụtala ma mara peptide emechara nke a rịọrọ. Sky Peptide
Mgbanwe atọ: megharịa O ka ị na-edobe ihe ndị fọdụrụnụ
Ugbu a tulee GOAS na GAOS n'okpuru otu njedebe akọwapụtara na echiche mgbanwe. Ha abụọ nwere Gly, Pyl, Ala, na Ser ozugbo, mana Pyl nọ n'ọkwa 2 n'usoro mbụ na ọnọdụ 3 na nke abụọ. Ngwakọta fọdụrụnụ agbanweghị ka usoro na-agbanwe.
N'okpuru echiche kemịkal yiri ya, mejupụtara-adabere na-anọpụ iche ọtụtụ bụ otu ihe ahụ. Uka na-adakọghị ọnụ enweghị ike ịmata usoro ọnọdụ ndị ahụ n'onwe ya. Ihe akaebe achọrọ ga-edozirịrị usoro ma ọ bụ ọdịiche saịtị nke metụtara ọrụ ahụ. Uka agbakọrọ nke ọma bara uru, mana ọ bụghị ihe akaebe zuru oke nke njirimara usoro.
Ịbugharị ihe fọdụrụ nwere ike ịgbanwe mmekọrịta mpaghara, mana ọdịghị ntụzịaka zuru ụwa ọnụ ma ọ bụ oke mgbanwe ọrụ na-esite na ọmụmaatụ nkuzi a. Ejila akara otu ụdị kwụsiri ike, ọzọ soluble, ma ọ bụ karịa na-arụsi ọrụ ike na-enweghị ihe akaebe dabara adaba. Amụma qualitative akwadoro ebe a bụ na ihe owuwu ahụ dị iche n'agbanyeghị na-ekekọrịta ihe.
Debe nọmba n'usoro zuru oke yana ntụzịaka ya ekwuputara. Ọ bụrụ na ndekọ gụnyere precursor, mkpado, ma ọ bụ ụdị edozi, dokwuo anya usoro ọnụọgụ ọnụọgụgụ a na-eji. Akara ọkwa na-enweghị ntụaka ahụ nwere ike tụọ aka na ihe fọdụrụ dị iche na akwụkwọ ọzọ.
Kewapụrụ njirimara fọdụrụ site na ọnọdụ nwere ebumnuche ebumnuche anọ
Enwere ike ịhazi mgbanwe nhazi abụọ ahụ dị ka obere matrix ntụnyere. Kọwaa peptides ahịrị hypothetical anọ nwere N na C n'efu, enweghị mgbanwe ọzọ, na nhazi L na chiral ọ bụla fọdụrụnụ. Glycine bụ achiral. O na-egosi n'ụzọ doro anya pyrrolysine ebe a. Emebere ebumnuche nkuzi ndị a, syntheses akọghị, nha ma ọ bụ nsonaazụ ndu. Tripeptide 1 Onye na-ebu ihe
| njirimara fọdụrụ | Ihe fọdụrụ pụrụ iche na ọnọdụ 2 | Ihe fọdụrụ pụrụ iche na ọnọdụ 3 |
|---|---|---|
| Pyrrolysine | H-GOAS-OH | H-GAOS-OH |
| Lysine | H-GKAS-OH | H-GAKS-OH |
Tulee otu axis tupu ịkọwa ha abụọ
GOAS megide GKAS na-agbanwe njirimara na ọnọdụ abụọ ma na-ahapụ ọnọdụ ndị ọzọ. GAOS megide GAKS na-eme mgbanwe njirimara kwekọrọ na ọnọdụ atọ. Ntụnyere abụọ a dochie Pyl na Lys, ya mere ọbụghị nke a na-ekwu na ihe fọdụrụ na-agbanwe agbanwe. Ha na-akọwapụta ọdịiche dị iche iche nke molekụla nke ga-achọ njirimara nke ha na nha dị mkpa.
GOAS na GAOS na-agbanwe ọnọdụ Pyl na Ala ka ọ na-echekwa ihe ndị fọdụrụnụ.. GKAS megide GAKS na-eme mgbanwe yiri nke Lys na Ala. Otu ụzọ mbugharị ọ bụla nwere otu ihe mejupụtara ya n'okpuru echiche ndị ekwuru, n'agbanyeghị na usoro ya dị iche. Ọka emebibeghị nke dabere na mejupụtara enweghị ike ikpebi onye otu n'ime ụzọ mbugharị ọ bụla nọ.
Ntụnyere diagonal, dị ka GOAS megide GAKS, na-agbanwe njirimara na ọnọdụ ọnụ. Ọ nwere ike ịbụ ntụnyere bara uru maka otu oru ngo, mana enweghị ike ịkenye ọdịiche naanị maka nnọchi Pyl ma ọ bụ naanị ịkwaga ebe ọzọ. Matriks ahụ na-eme ka ihe mgbagwoju anya ahụ anya tupu a kọwapụta nha ihe onwunwe.
Nọmba ọnọdụ na-achọpụta ihe fọdụrụ, ọ bụghị gburugburu ebe obibi zuru oke
Ịbugharị ihe fọdụrụ pụrụ iche site na ọnọdụ abụọ gaa n'ọkwa atọ na-agbanwe ndị agbata obi ya n'usoro: ọ dị n'etiti Gly na Ala na nhazi mbụ yana n'etiti Ala na Ser na nke abụọ. Ọdụ ụgbọ elu e bu n'obi ka dị otu, mana ogologo usoro ha na nke fọdụrụ dịkwa iche. Ndị a bụ nlebanya nhazi, ọ bụghị amụma nke otu mgbanwe na-elekọta, nkwekọrịta, solubility ma ọ bụ ọrụ.
Ọ bụrụ na nnwale emechara chọpụta ihe dị iche, kọwapụta ya dịka nsonaazụ maka ụzọ abụọ akọwapụtara n'okpuru ọnọdụ atụpụtara ya. Achịkọtala ya na peptide ọ bụla nwere Pyl. Nsonaazụ nwere ike ịdabere na usoro gbara ya gburugburu na ihe onwunwe a na-atụ. Nhazi nke ebumnuche anọ na-eme ka ndabere ndị ahụ bụrụ ndị a ga-atụle n'ebughị ụzọ mepụta ntụzịaka ma ọ bụ ịdị ukwuu.
Jiri nha anọ ahụ jụọ ajụjụ nwere ọnọdụ
Ka e were ya na, chere echiche, na a tụrụ ebe njedebe kwesịrị ekwesị maka ebumnuche anọ niile ejiri mara n'okpuru ọnọdụ atụnyere. Tulee ọdịiche mbugharị maka ụzọ abụọ Pyl yana ọdịiche mbugharị maka ụzọ Lys. Ọ bụrụ na enwere ike ịmata ọdịiche ndị ahụ n'ihi ejighị n'aka nha, mmetụta ọnọdụ abụghị otu maka njirimara abụọ fọdụrụ na usoro a.
Nke a bụ atụmatụ nyocha, ọ bụghị nkwuputa na mmekọrịta dị. Enweghị ụkpụrụ njedebe ka ekenyela ebe a. Nkwekọrịta ga-achọkwa nkọwa nke ọma: usoro enweghị mmetụta ma ọ bụ nsonaazụ na-ezighi ezi nwere ike izochi ọdịiche. Họrọ ihe onwunwe na ntụnyere ziri ezi tupu ịnakọta ụkpụrụ kama ilele ọnụọgụ anọ ọ bụla dị ka nkọwa molekụla zuru oke.
Họrọ ihe akaebe nhazi tupu ịkọwa ihe onwunwe ahụ
Ọka na-adịghị agbanwe agbanwe na GOAS nwere ike inye aka ịmata ọdịiche dị iche iche na-agbanwe agbanwe, gụnyere nnọchi Lys kwekọrọ, mana ọ nweghị ike iguzobe usoro GOAS-versus-GAOS naanị. Ihe akaebe nke njirimara kwesịrị ịkọwa ọdịiche dị na ụzọ abụọ ọ bụla. Ọdịiche ihe onwunwe siri ike ịkọwa ma ọ bụrụ na edozighi usoro nkwadebe ma ọ bụ ihe fọdụrụ n'ime ya..
Debekwa ihe ndabere nke nha nha na ụdị kemịkalụ ikpeazụ na-agbanwe agbanwe maka njedebe njedebe. Ọ bụrụ na a na-atụle otu nkwadebe na nnukwu ntụ ntụ na nke ọzọ na ego e kenyere, ihe dị iche iche pụtara nwere ike ịgụnye ọdịiche-ekenye ego. Ọ bụrụ na njedebe ma ọ bụ otu ndị ọzọ dị iche, detuo mgbanwe ndị ahụ kama ịkenye ihe niile na axes matrix abụọ ahụ.
Nkwubi okwu bara uru bụ ọdịiche dị oke ọnụ: nke njirimara molekụla gbanwere, nke njirimara nọgidere na-edozi, kedu ihe akaebe na-eguzobe ebumnuche ndị atụnyere, na ihe njedebe a họọrọ nwere ike igosi. Nke a na-atụgharị ihe O pụtara ka ọ bụrụ ajụjụ kemịkal akọwapụtara ebe ọ na-ahapụ omume na-enweghị atụ na-amaghị nke ọma.
Debe ọnụ ọgụgụ ndị mmadụ na oke akaebe doro anya
Pyrrolysine efu na ihe fọdụrụ pyrrolysine etinyere n'ime peptide bụ ihe dị iche iche na-agbakọ usoro.. Maka yinye linear anaghị agbanwe agbanwe nwere N n'efu- na C-termini, Mgbakọ dabere na ihe fọdụrụ na-achịkọta onyinye fọdụrụnụ ma gbakwunye otu molekul mmiri maka yinye ahụ. Nkwụsị agbanwe agbanwe, cross-njikọ, na mgbanwe kemịkalụ ndị ọzọ na-achọ ndekọ nke onwe ha.
Kọwaa ma ngụkọ na-eji uka monoisotopic ma ọ bụ nkezi molar mass, ma jiri nkeji kwesịrị ekwesị. Kwupụta ihe mejupụtara isotope e zubere wee kewaa oke na-anọpụ iche site na nha nha nha-na-charge ion tụrụ atụ. Edemede a anaghị ekenye ọnụọgụgụ ọnụọgụ na ebumnuche ebumnuche n'ihi na nkọwa kemịkalụ ha zuru oke ga-ebu ụzọ chọọ nkwenye..
| Mgbanwe agbanwe agbanwe | Akwadoro mmetụta qualitative | Akwadoghi mmechi na-akpaghị aka | Achọrọ nkwenye |
|---|---|---|---|
| Ọnọdụ ndetu | Na-agbanwe ka esi akọwapụta agwa | Achọpụtaghị ihe nlele anụ ahụ nwere ihe fọdụrụ | Mgbakọ isi mmalite, ụdị ubi, na nkowa nke ambiguity |
| K/Lys nọchiri O/Pyl | Na-agbanwe njirimara fọdụrụ na nhazi mgbe ị na-echekwa ogologo yinye | A naghị ewepụta ụgwọ ma ọ bụ mgbanwe ọrụ zuru ụwa ọnụ | Nhazi na nha zuru oke dabara na ntụnyere ezubere |
| O kwagara n'ime otu ihe mejupụtara | Na-agbanwe usoro usoro mgbe ị na-ahapụ uka dabere na ihe mejupụtara agbanweghị n'okpuru echiche dabara adaba | Ọ naghị ewepụta nha nha ọrụ | Ihe akaebe njirimara ọnọdụ-mmara na ntule ọrụ ọ bụla dị mkpa |
Dochie Pyl na Lys na ịkwaga Pyl n'ọnọdụ ọzọ bụ mgbanwe nhazi dị iche iche. Nke mbụ na-agbanwe njirimara fọdụrụ na nhazi; nke abụọ na-agbanwe n'usoro mgbe ị na-echekwa ihe mejupụtara n'okpuru echiche kemịkal dabara adaba. Chekwaa ndịiche ndị ahụ mgbe ị na-ahọpụta ihe akaebe na ịkọwa ntụnyere.
Tupu iji ndekọ ahụ, kwado nkwekọrịta koodu, usoro zuru oke, N-ruo-C ntụziaka, ọnọdụ, stereochemistry, njedebe, na mgbanwe. Jikọọ ihe akaebe nyocha ọ bụla na nlele n'ezie. Kanye akara n'ụzọ doro anya na ozi a na-edozibeghị kama imeju ya na amino acid amara nke ọma kacha nso.
Ajụjụ a na-ajụkarị
Ọ na-emegharị Pyl site na ọnọdụ abụọ ruo atọ na-agbanwe nhazi? Ọ bụghị maka ụzọ GOAS/GAOS n'okpuru otu ọnụ na echiche mgbanwe. Mgbanwe ịtụ ahịa, ya mere mejupụtara emebibeghị naanị ya enweghị ike ịmata ụzọ abụọ ahụ.
Ntụle GOAS-to-GAKS nwere ike kewapụ mmetụta nnọchi Pyl-to-Lys? Mba. Ọ na-agbanwe njirimara fọdụrụ na ọnọdụ ọnụ. Jiri ọdịiche na-echekwa njirimara a na-edozi.
Matriks a ọ na-ebu amụma nke ebumnobi na-arụ ọrụ karịa ma ọ bụ sobere ya? Mba. Ọ na-akọwa atụnyere nhazi ihe atụ. Nkwubi okwu ihe onwunwe chọrọ nha kwesịrị ekwesị na nkwadebe mara mma.
