タンパク質チロシンホスファターゼYopHのN末端ドメインを標的とした環状ペプチドの設計とNMR研究

我々は、エルシニア産プロテインチロシンホスファターゼYopHのN末端ドメインを標的とした新規環状ペプチドの設計と評価について報告する。. 環状ペプチドは、タンパク質 SKAP-HOM の短い配列に基づいて設計されています。 [の(年)DDPF (pY = ホスホチロシン)], そしてそれらはすべてDEZXDPfKというモチーフを含んでいます (ここで、Z はホスホチロシンまたは非加水分解性ホスホチロシン模倣物です。, X はアスパラギン酸またはロイシン、f は d-フェニルアラニンです。). これらのペプチドは「頭から尾まで」の構造を示します, 最初のアスパラギン酸の側鎖とリジン残基の間にアミド結合を形成することで環化が可能になります。. YopH の N 末端ドメインへのこれらのペプチドの結合を監視するために、化学シフト摂動研究が実施されました。. ホスホチロシン部分を含むペプチドは、低マイクロモル範囲の結合親和性を示します。; ホスホチロシンをその非加水分解性誘導体のいずれかで置換すると、結合親和性が劇的に低下します。. これらの予備研究は、エルシニア感染症を阻害する能力についてさらに研究できる、YopH N末端ドメインのより強力で選択的なペプチドベースのリガンドの発見への道を開く可能性がある。.