단백질 티로신 포스파타제 YopH의 N-말단 도메인을 표적으로 하는 고리형 펩타이드의 설계 및 NMR 연구

우리는 Yersinia의 단백질 티로신 포스파타제 YopH의 N 말단 도메인을 표적으로 하는 새로운 고리형 펩타이드의 설계 및 평가에 대해 보고합니다.. 고리형 펩타이드는 SKAP-HOM 단백질의 짧은 서열을 기반으로 설계되었습니다. [의(PY)DDPF (pY = 포스포티로신)], 모두 DEZXDPfK라는 모티브를 포함하고 있습니다. (여기서 Z는 포스포티로신 또는 비가수분해성 포스포티로신 모방체이다., X는 아스파르트산 또는 류신이고 f는 d-페닐알라닌입니다.). 이 펩타이드는 '머리에서 꼬리까지' 구조를 나타냅니다., 첫 번째 아스파르트산의 측쇄와 라이신 잔기 사이에 아미드 결합을 형성하여 고리화 가능. YopH의 N 말단 도메인에 대한 이들 펩타이드의 결합을 모니터링하기 위해 화학적 이동 섭동 연구가 수행되었습니다.. 포스포티로신 부분을 함유한 펩타이드는 낮은 마이크로몰 범위의 결합 친화도를 나타냅니다.; 포스포티로신을 비가수분해성 유도체 중 하나로 대체하면 결합 친화력이 크게 감소합니다.. 이러한 예비 연구는 예르시니아에 감염을 억제하는 능력에 대해 추가로 조사할 수 있는 YopH N 말단 도메인의 보다 강력하고 선택적인 펩타이드 기반 리간드를 발견할 수 있는 길을 열 수 있습니다..