Thiết kế tuyến đường
Phương pháp tổng hợp hóa học (SPPS tổng hợp pha rắn, tổng hợp pha lỏng): đối với peptide ngắn (thường xuyên ≤50 axit amin), cần lựa chọn chiến lược nhóm bảo vệ, thuốc thử ghép, vân vân.
Sinh tổng hợp (công nghệ ADN tái tổ hợp): biểu hiện các peptide dài hoặc các peptide biến đổi phức tạp bởi vi sinh vật hoặc tế bào, yêu cầu tối ưu hóa việc lựa chọn máy chủ (ví dụ. E. coli, men) và điều kiện văn hóa..
Tối ưu hóa quy trình
Tối ưu hóa tổng hợp/biểu thức: tăng năng suất (ví dụ. nhiệt độ, pH, nồng độ chất xúc tác).
Quá trình thanh lọc: sắc ký (HPLC pha đảo, trao đổi ion) là chìa khóa, cần tối ưu hóa điều kiện rửa giải.
Kiểm soát tạp chất: loại bỏ các peptide bị thiếu, trình tự không khớp, sản phẩm oxy hóa, vân vân. để đảm bảo độ tinh khiết (thường xuyên >98%).