किसी भी डॉकिंग रन से पहले पेप्टाइड-प्रोटीन इंटरैक्शन वर्कफ़्लो को क्या तय करना होगा
पेप्टाइड ऑर्डर आपूर्तिकर्ता जियो पेप्टाइड्स वर्कफ़्लो का नियामक नियम यह है कि एक चरण केवल वही आगे बढ़ सकता है जिसे अगला चरण ग़लत साबित कर सकता है. इस लेख में बाकी सब कुछ वह नियम है जो चार बार लागू किया गया है.
हैंडऑफ़ जाँच प्रयोगों से पहले गायब साक्ष्य को उजागर कर सकती है, लेकिन यह लेख अभियान विफलताओं के वितरण को नहीं मापता है. क्रम असाइनमेंट की समीक्षा करें, खोज सेटिंग्स, धारणाएँ बनाएँ, भौतिक पहचान और परख नियंत्रण एक साथ.
टूल का प्रश्न दूसरे स्थान पर आता है, और यह सटीकता के बजाय पूर्व ज्ञान का प्रश्न है. पेप्टाइड डॉकिंग का मूल्यांकन सबसे पहले CAPRI में राउंड में किया गया था 28 और 29, और उसके बाद हुए मूल्यांकन में तर्क दिया गया कि मौजूदा मानदंडों को बेहतर चयन नियमों की आवश्यकता है, विशेष रूप से जहां बाइंडिंग साइट अज्ञात है (CAPRI पेप्टाइड राउंड). यह क्षेत्र की ईमानदार स्थिति है: तरीकों को बेंचमार्क किया गया है, मानदंड विवादित हैं, और कोई भी पेपर किसी दिए गए उपयोग के मामले के लिए डिफ़ॉल्ट विधि की अनुशंसा नहीं करता है. तो डॉकिंग से पहले आप वास्तव में जो निर्णय लेते हैं वह यह है कि आपके अभियान को किस हैंड-ऑफ मानदंड की आवश्यकता है.
कुंजी ले जाएं: एक चरण केवल वही आगे बढ़ सकता है जिसे अगला चरण ग़लत साबित कर सकता है.
कदम 1: विविधता नमूने द्वारा पुस्तकालय को परिभाषित करें, गिनती से नहीं
इनपुट: जैविक प्रश्न, यह उस तुलना के रूप में बताया गया है जिसे आप करना चाहते हैं. कार्रवाई: लंबाई ठीक करें, अवशेष वर्णमाला, ऑफसेट और नियंत्रण. उत्पादन: एक डिज़ाइन रिकॉर्ड जिसे एक संश्लेषण टीम आपसे कुछ भी पूछे बिना बना सकती है. कब किया डिज़ाइन रिकॉर्ड बताता है कि यह लाइब्रेरी इस प्रश्न का उत्तर क्यों देती है और यह जानबूझकर क्या कवर नहीं करती है.
संपूर्ण कवरेज उपलब्ध नहीं है, और अनुक्रम-स्थान अंकगणित तर्क को शीघ्रता से सुलझा देता है. 7-मेर स्थान में 1.28×10⁹ अनुक्रम होते हैं, एक 10-मेर 1.024×10¹³, और एक 15-मेर 3.2768×10¹⁹, लगभग 10⁹ सदस्यों की एक व्यावहारिक प्रदर्शन-पुस्तकालय छत के विरुद्ध (अनुक्रम-स्थान अंकगणित). वह छत परिमाण के क्रम की परिपाटी है, कोई मापी गई सीमा नहीं, लेकिन निष्कर्ष किसी भी प्रशंसनीय मूल्य पर है: पिछले लगभग छह या सात अवशेषों का आप नमूना ले रहे हैं, गिनती नहीं कर रहा.
यहीं पर विविधता-नमूना पेप्टिडोमिक्स अपनी जगह अर्जित करता है. आप एक ऐसा पैनल चुनते हैं जो प्रति ज्ञात विशेषता एक पेप्टाइड के बजाय स्रोत पेप्टाइड्स की रासायनिक और संरचनात्मक विविधता को फैलाता है, और आप डिज़ाइन रिकॉर्ड में ऐसा कहते हैं. हमारे स्वयं के सेवा दस्तावेज़ में बताया गया एक लाइब्रेरी-डिज़ाइन सिद्धांत विफलता मोड को स्पष्ट रूप से रखता है: एक पेप्टाइड लाइब्रेरी संश्लेषण से बहुत पहले विफल हो सकती है जियोपेप्टाइड्स चक्रीय पेप्टाइड आपूर्तिकर्ता यदि डिज़ाइन जैविक प्रश्न से मेल नहीं खाता है तो प्रारंभ होता है. लंबाई, ओवरलैप, अवशेष वर्णमाला और उत्परिवर्तन का दायरा सभी पेप्टाइड गिनती को बढ़ाता है, संश्लेषण जटिलता और परख थ्रूपुट, यही कारण है कि पेप्टाइड लाइब्रेरी डिज़ाइन अनुक्रम चयन पर नहीं रुकना चाहिए. नियंत्रण एक ही रिकॉर्ड में हैं: एक ज्ञात बाइंडर, एक तले हुए संस्करण, और एक पेप्टाइड जिसके विफल होने की आप आशा करते हैं.
कदम 2: विश्लेषणात्मक स्क्रीनिंग चलाएँ और उत्पत्ति के साथ एक पेप्टाइड तालिका सौंपें
इनपुट: कच्ची एलसी-एमएस/एमएस फ़ाइलें और नमूना-हैंडलिंग रिकॉर्ड. कार्रवाई: एंजाइम विशिष्टता के बिना खोजें, विस्तारित परिवर्तनीय संशोधनों और लक्ष्य-डिकॉय एफडीआर नियंत्रण के साथ. उत्पादन: एक पेप्टाइड तालिका जिसका अपना उद्गम है. कब किया एक डॉकिंग टीम फ़िल्टर कर सकती है, एक भी कच्ची फ़ाइल खोले बिना सूची को पुनः रैंक करें और उसका बचाव करें. चक्रीय पेप्टाइड फैक्टरी
वास्तविक पेप्टिडोमिक्स वर्कफ़्लो के लिए गलत-खोज नियंत्रण सेट करें और उसका आकलन करें. पेप्टाइड और प्रोटीन फिल्टर का एक अध्ययन-विशिष्ट संयोजन इससे कम की गारंटी नहीं दे सकता 1% दूसरे डेटासेट में पेप्टाइड एफडीआर, विशेष रूप से एंजाइम विशिष्टता के बिना या विस्तारित संशोधनों वाली खोजों में. परवलयिक पेप्टाइड्स
रिपोर्टिंग टेम्प्लेट पहले से मौजूद है. MIAIPE रिपोर्टिंग चेकलिस्ट, इम्यूनोपेप्टिडोमिक्स के लिए एचयूपीओ के तहत विकसित किया गया, यह बताने की आवश्यकता है कि पहचान अनुक्रम-आधारित थी या नए सिरे से, शिखर-सूची उपकरण और उसके पैरामीटर, खोज इंजन सेटिंग्स, और प्रत्येक फ़िल्टर लागू किया गया (MIAIPE रिपोर्टिंग चेकलिस्ट). गैर-प्रतिरक्षाविज्ञानी नमूने के लिए भी इसकी संरचना उधार लें. एक और क्षेत्र को भूलना आसान है: जेनेरिक पेप्टिडोमिक्स विश्लेषणात्मक वर्कफ़्लो नमूना पूर्व-उपचार से लेकर निष्कर्षण तक चलता है, विभाजन, एमएस विश्लेषण और पहचान, और चल रहे एंजाइमेटिक क्षरण से बचने के लिए निष्कर्षण काफी तेज होना चाहिए. नमूने में मौजूद पेप्टाइड्स एक हैंडलिंग इतिहास वाला माप है, तो इसे रिकॉर्ड करें.
कदम 3: डॉकिंग को प्राथमिकता दें, और स्कोर को एफ़िनिटी के बजाय रैंक के रूप में पढ़ें
इनपुट: पेप्टाइड तालिका. कार्रवाई: पेप्टाइड लंबाई के आधार पर एक प्रोटोकॉल चुनें, रिसेप्टर स्थिति और क्या आपके पास साइट की पूर्व जानकारी है. उत्पादन: रिकॉर्ड किए गए प्रोटोकॉल और मानदंड के साथ एक रैंक पोज़ तालिका. कब किया प्रत्येक पंक्ति बताती है कि किस प्रोटोकॉल ने इसे निर्मित किया और कौन सा सफलता मानदंड लागू किया गया.
प्रकाशित सफलता दरें असहमत हैं, और असहमति जानकारीपूर्ण है. हैडॉक का पेप्टाइड प्रोटोकॉल, तीन-संरूपण समूह से शुरुआत, पहुँच गया 79.4% अनबाउंड पेप्टाइड के विरुद्ध बाउंड रिसेप्टर के लिए स्वीकार्य मॉडल और 69.4% अनबाउंड/अनबाउंड के लिए (हैडॉक का पेप्टाइड प्रोटोकॉल). HPEPDOCK की ब्लाइंड-मोड बेंचमार्क रिपोर्ट 33.3% टॉप-10 में सफलता 57 अनबाउंड मामले, की ओर बढ़ रहा है 72.6% जब बाइंडिंग साइट की आपूर्ति की जाती है (HPEPDOCK का ब्लाइंड-मोड बेंचमार्क). पेप्टाइड डॉकिंग विधियों का पुन: बेंचमार्क सीएबीएस-डॉक पर रखता है 53.0% बाध्य और 37.0% पेप्टीडीबी पर अनबाउंड, और ऑटोडॉक क्रैंकपेप पर 85.7% स्थानीय मोड में सख्त आरएमएसडी कटऑफ के तहत लीड्स-पीईपी पर (पेप्टाइड डॉकिंग विधियों का पुनः बेंचमार्क). AlphaFold2 के पेप्टाइड परिणाम चलते हैं 75% अंदर 1.5 Å जब एक बंधनकारी रूपांकन ज्ञात हो और 36% अंदर 2.5 Å जब यह नहीं है (अल्फ़ाफोल्ड2 के पेप्टाइड परिणाम).
वे संख्याएँ लीग तालिका नहीं हैं. वे डेटासेट में भिन्न हैं, पेप्टाइड लंबाई और सफलता मानदंड, और प्रसार मानदंडों के साथ-साथ तरीकों को भी दर्शाता है. स्थानांतरण का तात्पर्य प्रभावों की दिशा से है. साइट-निर्देशित डॉकिंग की तुलना में ब्लाइंड डॉकिंग एक कठिन प्रश्न है, यही कारण है कि हैडॉक सूचना-संचालित डॉकिंग है: अस्पष्ट अंतःक्रिया उत्परिवर्तन से रोकती है, एमएस, एनएमआर या संरक्षण उसे कूटबद्ध करता है जो आप पहले से जानते हैं (हैडॉक सूचना-संचालित डॉकिंग है). सीएबीएस-डॉक अंधाधुंध चलता है, पेप्टाइड को पूरी तरह से लचीला बनाना और एक रैंक वाली मुद्रा के बजाय प्रक्षेपवक्र को क्लस्टर में वापस करना (सीएबीएस-डॉक अंधाधुंध चलता है). अल्फाफोल्ड 3 का अपना मूल्यांकन प्रोटीन और एंटीबॉडी इंटरफेस की रिपोर्ट करता है और बताता है कि यह स्थिर संरचनाओं की भविष्यवाणी करता है, समूह नहीं (अल्फाफोल्ड 3 का अपना मूल्यांकन). वह प्रोटोकॉल चुनें जो आपके पूर्व ज्ञान से मेल खाता हो, फिर आउटपुट को रैंक के रूप में पढ़ें.
कदम 4: गुणवत्तापूर्ण कक्षाओं के साथ मुद्रा का मूल्यांकन करें, फिर तय करें कि संश्लेषण के योग्य क्या है
DockQ एक संदर्भ संरचना के विरुद्ध एक पूर्वानुमानित परिसर का मूल्यांकन करता है और पूर्वव्यापी बेंचमार्किंग के लिए उपयोगी है. यह ऐसे नवीन परिसर के लिए मापित गुणवत्ता बैंड की आपूर्ति नहीं कर सकता जिसका संदर्भ अज्ञात है. संभावित चयन के लिए, कैलिब्रेटेड आत्मविश्वास साक्ष्य का उपयोग करें, विविधता, व्यवहार्यता और एक पूर्वनिर्धारित प्रयोगात्मक सत्यापन योजना. डॉकक्यू विधि.
<चित्र वर्ग="ब्लॉग-चार्ट" शैली="अधिकतम-चौड़ाई:640पिक्सल;अंतर:1.5रेम ऑटो;फ़ॉन्ट आकार:12पिक्सल;ऊंची लाईन:1.3;रंग:इनहेरिट"> <एसवीजी व्यूबॉक्स ="0 0 560 380" शैली="अधिकतम-चौड़ाई: 100%; ऊंचाई: ऑटो; फुहारा परिवार: 'इंटर', सिस्टम-यूआई, सान्स सेरिफ़; रंग: #1e293b; --चार्ट-म्यूट किया गया: #64748बी;" भूमिका="आईएमजी" aria-labelledby="डॉकक्यू-क्लास-कटऑफ-ऑन-ए-0-1-स्केल-शीर्षक डॉकक्यू-क्लास-कटऑफ-ऑन-ए-0-1-स्केल-desc"> <शैली> /* रेंडरर चार्ट को एक आईफ्रेम में रखता है जिसका तत्व पृष्ठभूमि काला है, और आईफ्रेम चार्ट से भिन्न आकार का है, इसलिए लेटरबॉक्स बैंड इसके चारों ओर काले फ्रेम के रूप में दिखाई दिए (ठेस 09-22). आईफ़्रेम के अंदर दस्तावेज़ डिफ़ॉल्ट रूप से पारदर्शी है; इसे यहां चित्रित करने से तत्व पृष्ठभूमि शामिल हो जाती है, और जब इसके बजाय चार्ट इनलाइन किया जाता है तो यह किसी भी चीज़ से मेल नहीं खाता है. एंगल ब्रैकेट को इस ब्लॉक से बाहर रखें: एसवीजी के अंदर एक शैली तत्व को विदेशी सामग्री के रूप में पार्स किया जाता है, इसलिए एक भटका हुआ कोष्ठक इसमें प्रत्येक नियम को त्याग देता है. */ एचटीएमएल, शरीर { पृष्ठभूमि: #उफ़्फ़्फ़्फ़; अंतर: 0; } @मीडिया (पसंद-कम-गति: कम करना) { * { एनिमेशन: कोई नहीं !महत्वपूर्ण; संक्रमण: कोई नहीं !महत्वपूर्ण; } } </शैली> <सही x="0" आप="0" चौड़ाई="560" ऊँचाई="380" आरएक्स="8" भरें="#उफ़्फ़्फ़्फ़" /> <शीर्षक आईडी ="डॉकक्यू-क्लास-कटऑफ-ऑन-ए-0-1-स्केल-शीर्षक">DockQ क्लास कटऑफ पर 0-1 पैमाना</शीर्षक> <विवरण आईडी="डॉकक्यू-क्लास-कटऑफ-ऑन-ए-0-1-स्केल-desc">DockQ क्लास कटऑफ पर - पैमाना: ग़लत के लिए मान, स्वीकार्य, मध्यम, उच्च. DockQ क्लास कटऑफ पर 0-1 पैमाना. लाइन डेटा: ग़लत 0.23; स्वीकार्य 0.49; मध्यम 0.8; उच्च 1.स्रोत: बसु & वालनर, एक और 11(8):e0161879 2016.</वर्णन> <पाठ x="280.0" आप="29" टेक्स्ट-एंकर="मध्य" फ़ॉन्ट-आकार="18" फ़ॉन्ट-वजन="800" भरें="वर्तमानरंग">DockQ क्लास कटऑफ पर 0-1 पैमाना</मूलपाठ> <पंक्ति x1="70" y1="292.0" x2="500" y2="292.0" आघात="वर्तमानरंग" अपारदर्शिता="0.08" /> <पंक्ति x1="70" y1="239.5" x2="500" y2="239.5" आघात="वर्तमानरंग" अपारदर्शिता="0.08" /> <पंक्ति x1="70" y1="187.0" x2="500" y2="187.0" आघात="वर्तमानरंग" अपारदर्शिता="0.08" /> <पंक्ति x1="70" y1="134.5" x2="500" y2="134.5" आघात="वर्तमानरंग" अपारदर्शिता="0.08" /> <पंक्ति x1="70" y1="82.0" x2="500" y2="82.0" आघात="वर्तमानरंग" अपारदर्शिता="0.08" /> <पाठ x="64" आप="296.0" टेक्स्ट-एंकर="अंत" फ़ॉन्ट-आकार="10" भरें="वर्तमानरंग" अपारदर्शिता="0.7">0</मूलपाठ> <पाठ x="64" आप="243.5" टेक्स्ट-एंकर="अंत" फ़ॉन्ट-आकार="10" भरें="वर्तमानरंग" अपारदर्शिता="0.7">0.25</मूलपाठ> <पाठ x="64" आप="191.0" टेक्स्ट-एंकर="अंत" फ़ॉन्ट-आकार="10" भरें="वर्तमानरंग" अपारदर्शिता="0.7">0.5</मूलपाठ> <पाठ x="64" आप="138.5" टेक्स्ट-एंकर="अंत" फ़ॉन्ट-आकार="10" भरें="वर्तमानरंग" अपारदर्शिता="0.7">0.75</मूलपाठ> <पाठ x="64" आप="86.0" टेक्स्ट-एंकर="अंत" फ़ॉन्ट-आकार="10" भरें="वर्तमानरंग" अपारदर्शिता="0.7">1</मूलपाठ> <पॉलीलाइन पॉइंट="70.0,243.7 213.3,189.1 356.7,124.0 500.0,82.0" भरें="कोई नहीं" आघात="#f97316" स्ट्रोक-चौड़ाई="2.5" स्ट्रोक-लाइनकैप="गोल" स्ट्रोक-लाइनजॉइन ="गोल" /> <वृत्त cx="70.0" साइबर="243.7" आर="4" भरें="#f97316" /> <पाठ x="70.0" आप="234.7" टेक्स्ट-एंकर="मध्य" फ़ॉन्ट-आकार="9" भरें="वर्तमानरंग">0.23</मूलपाठ> <पाठ x="70.0" आप="312.0" टेक्स्ट-एंकर="मध्य" फ़ॉन्ट-आकार="10" भरें="वर्तमानरंग" अपारदर्शिता="0.8"><छोटा चम्मच x="70.0" डाई="0">ग़लत</छोटा चम्मच></मूलपाठ> <वृत्त cx="213.3" साइबर="189.1" आर="4" भरें="#38bdf8" /> <पाठ x="213.3" आप="180.1" टेक्स्ट-एंकर="मध्य" फ़ॉन्ट-आकार="9" भरें="वर्तमानरंग">0.49</मूलपाठ> <पाठ x="213.3" आप="312.0" टेक्स्ट-एंकर="मध्य" फ़ॉन्ट-आकार="10" भरें="वर्तमानरंग" अपारदर्शिता="0.8"><छोटा चम्मच x="213.3" डाई="0">स्वीकार्य</छोटा चम्मच></मूलपाठ> <वृत्त cx="356.7" साइबर="124.0" आर="4" भरें="#a78bfa" /> <पाठ x="356.7" आप="115.0" टेक्स्ट-एंकर="मध्य" फ़ॉन्ट-आकार="9" भरें="वर्तमानरंग">0.8</मूलपाठ> <पाठ x="356.7" आप="312.0" टेक्स्ट-एंकर="मध्य" फ़ॉन्ट-आकार="10" भरें="वर्तमानरंग" अपारदर्शिता="0.8"><छोटा चम्मच x="356.7" डाई="0">मध्यम</छोटा चम्मच></मूलपाठ> <वृत्त cx="500.0" साइबर="82.0" आर="4" भरें="#22c55e" /> <पाठ x="500.0" आप="73.0" टेक्स्ट-एंकर="मध्य" फ़ॉन्ट-आकार="9" भरें="वर्तमानरंग">1</मूलपाठ> <पाठ x="500.0" आप="312.0" टेक्स्ट-एंकर="मध्य" फ़ॉन्ट-आकार="10" भरें="वर्तमानरंग" अपारदर्शिता="0.8"><छोटा चम्मच x="500.0" डाई="0">उच्च</छोटा चम्मच></मूलपाठ> <पाठ x="280.0" आप="366" टेक्स्ट-एंकर="मध्य" फ़ॉन्ट-आकार="10" भरें="हमारा(--चार्ट-म्यूट किया गया, वर्तमानरंग)">स्रोत: बसु & वालनर, एक और 11(8):e0161879 (2016)</मूलपाठ> </एसवीजी> </आकृति>
विशिष्टता वह है जहां कम्प्यूटेशनल और प्रायोगिक टीमें आमतौर पर एक-दूसरे से हार जाती हैं. सटीक अनुक्रम संस्करण का नाम बताएं, संशोधन और उसकी साइट, और प्रतिवाद प्रपत्र, क्योंकि उनमें से किसी में भी बदलाव से आप जो परीक्षण कर रहे हैं वह बदल जाता है. विश्लेषणात्मक-एचपीएलसी शुद्धता के साथ विश्लेषण का प्रमाण पत्र मांगें, मास-स्पेक्ट्रोमेट्री पहचान और शुद्ध पेप्टाइड सामग्री, और जहां परख की आवश्यकता हो वहां एंडोटॉक्सिन परीक्षण या काउंटर-आयन विश्लेषण जोड़ें. एक आपूर्तिकर्ता जैसे एमओएल परिवर्तन पेप्टाइड के साथ उस पैकेज को वितरित कर सकता है, जो ऑर्डर के बाद के बजाय डेटा आवश्यकताओं को ऑर्डर से पहले निपटाने का व्यावहारिक कारण है.
कदम 5: प्रायोगिक तौर पर पुष्टि करें, पूछे गए प्रश्न से परख का मिलान
इनपुट: संश्लेषित पेप्टाइड्स और उनका लॉट डेटा. कार्रवाई: एक परख चलाएं जिसका रीडआउट विशिष्ट प्रश्न का उत्तर देता है. उत्पादन: इसकी माप शर्तों के साथ बाध्यकारी या गैर-बाध्यकारी परिणाम. कब किया परिणाम की तुलना दोनों पक्षों द्वारा स्वीकार की गई शर्तों पर डॉकिंग भविष्यवाणी से की जा सकती है.
दावे के साथ परख का मिलान करें. डॉकिंग पोज़ एक बाइंडिंग साइट और अनुमानित ज्यामिति की भविष्यवाणी करता है; एक प्रतियोगिता परख या एक उत्परिवर्तन श्रृंखला साइट का परीक्षण करती है, जबकि प्रत्यक्ष बंधन माप आत्मीयता का परीक्षण करता है. वे विनिमेय नहीं हैं, और गलत परख से शून्य परिणाम आपको मुद्रा के बारे में कुछ नहीं बताता है. SKEMPI एफ़िनिटी डेटाबेस दिखाता है कि विधि को संख्या के साथ क्यों यात्रा करनी है: इसकी प्रविष्टियाँ माप विधि और तापमान को रिकॉर्ड करती हैं, और सतह प्लास्मोन अनुनाद और प्रतिदीप्ति स्पेक्ट्रोस्कोपी साहित्य पर हावी हैं (SKEMPI एफ़िनिटी डेटाबेस). आप जिस भी "सामान्य केडी" की तुलना उससे करते हैं, उसमें उन दो तरीकों के पूर्वाग्रह विरासत में मिलते हैं, इसलिए अपनी स्वयं की स्थितियों की रिपोर्ट करें और समान की तुलना समान से करें.
एक पुष्टिकृत बाइंडर, बाइंडिंग परिकल्पना का समर्थन करता है, लेकिन पूर्वानुमानित मुद्रा को साबित नहीं करता है या संपूर्ण डॉकिंग प्रोटोकॉल को मान्य नहीं करता है. संवेदनशीलता परख करते समय गैर-बाध्यकारी और कमजोर-बाध्यकारी परिणाम दोनों जानकारीपूर्ण होते हैं, सामग्री की गुणवत्ता और शर्तों को समझा जाता है.
सामान्य विफलता बिंदु और उन्हें तुरंत कैसे पकड़ें
तालिका के पीछे पैटर्न यह है कि प्रत्येक विफलता को अपस्ट्रीम में पकड़ना सस्ता है और डाउनस्ट्रीम में महंगा है. एफडीआर सेटिंग्स के बिना एक पेप्टाइड तालिका को दोबारा फ़िल्टर नहीं किया जा सकता है, इसलिए डॉकिंग टीम या तो उस पर भरोसा करती है या उसका पुनर्निर्माण करती है. किसी रैंक वाली सूची की उसके प्रोटोकॉल के बिना व्याख्या नहीं की जा सकती, इसलिए एक अच्छा पोज़ और एक लकी पोज़ एक जैसा दिखता है. एक विनिर्देश में काउंटरियन फॉर्म का अभाव एक पेप्टाइड उत्पन्न करता है जो मॉडल किए गए से भिन्न व्यवहार कर सकता है.
निष्कर्ष
यह नियम आपको यह भी बताता है कि किसी अभियान का दायरा कैसे बढ़ाया जाए या किसी अभियान की पेशकश करने वाले भागीदार का मूल्यांकन कैसे किया जाए. पूछें कि कौन सा चरण किस कलाकृति का निर्माण करता है, क्या डॉकिंग प्रोटोकॉल को उपलब्ध पूर्व ज्ञान से मेल खाने के लिए चुना गया था, और क्या संश्लेषण अनुरोध का अपना स्वीकृति मानदंड है. एक भागीदार जो उन तीन प्रश्नों का उत्तर दे सकता है उसके पास एक वर्कफ़्लो है. जो साथी स्कोर के साथ आगे बढ़ता है उसकी रैंकिंग होती है.
जहां दस्तावेज़ ख़त्म हो जाते हैं, कलाकृति पर निर्णय लें. यदि कोई पेप्टाइड तालिका खोज पैरामीटर के बिना आती है, डॉकिंग से पहले उनसे पूछें. यदि कोई पोज़ टेबल बिना उसकी कसौटी के आती है, पूछें कि कौन सा लागू किया गया था. यदि कोई विनिर्देश अनुक्रम संस्करण के बिना आता है, पूछें कि आपसे किस अणु का परीक्षण करने के लिए कहा जा रहा है. उन प्रश्नों का कोई मूल्य नहीं है और अधिकांश तर्क सुलझ जाते हैं.
एमओएल परिवर्तन उन बिंदुओं पर इस वर्कफ़्लो का समर्थन करता है जहां कलाकृतियों का उत्पादन किया जाता है: परिभाषित लंबाई के साथ पेप्टाइड लाइब्रेरी डिज़ाइन, ओफ़्सेट, उत्परिवर्तन और नियंत्रण तर्क, और एचपीएलसी शुद्धता को कवर करने वाले विश्लेषण प्रमाणपत्र के साथ कस्टम संश्लेषण, एमएस पहचान और पेप्टाइड सामग्री. यदि आप किसी अभियान का दायरा बढ़ा रहे हैं, हमें अपना लक्ष्य भेजें, पेप्टाइड लंबाई और परख योजना, और हम आपके साथ व्यवहार्यता की समीक्षा करेंगे.
प्रकाशक प्रकटीकरण: एमओएल चेंजेस पेप्टाइड सेवाओं की आपूर्ति करता है और इस विषय में उसकी व्यावसायिक रुचि है. सेवा श्रेणियाँ और क्षमता विवरण आपूर्तिकर्ता के दावे हैं; किसी विशिष्ट निर्माण के लिए उपलब्धता और प्रदर्शन के लिए परियोजना-विशिष्ट साक्ष्य की आवश्यकता होती है.
