Дизайн и ЯМР-исследования циклических пептидов, направленных на N-концевой домен протеин-тирозинфосфатазы YopH

Мы сообщаем о разработке и оценке новых циклических пептидов, нацеленных на N-концевой домен протеинтирозинфосфатазы YopH из Yersinia.. Циклические пептиды были разработаны на основе короткой последовательности белка SKAP-HOM. [ИЗ(пЯ)ДДПФ (pY = фосфотирозин)], и все они содержат мотив DEZXDPfK. (где Z представляет собой фосфотирозин или негидролизуемый миметик фосфотирозина., X представляет собой аспарагиновую кислоту или лейцин, а f представляет собой d-фенилаланин.). Эти пептиды представляют собой архитектуру «от головы к хвосту»., обеспечение циклизации за счет образования амидной связи между боковыми цепями первой аспарагиновой кислоты и остатками лизина. Исследования возмущений химического сдвига были проведены для мониторинга связывания этих пептидов с N-концевым доменом YopH.. Пептиды, содержащие фрагмент фосфотирозина, проявляют сродство связывания в низкомикромолярном диапазоне.; замена фосфотирозина одним из его негидролизуемых производных резко снижает аффинность связывания.. Эти предварительные исследования могут проложить путь к открытию более мощных и селективных пептидных лигандов N-концевого домена YopH, которые можно будет дополнительно исследовать на предмет их способности ингибировать инфекции Yersiniae..