Seo Peptide Folding Models le Aggregation e hlileng e se bolelang esale pele
Moetso oa ho mena ke bolepi ba leholimo ba sebaka, eseng tekanyo ea seterata sa hau. Phapang eo e etsa qeto ea hore na meeli efe kapa efe ea peptide aggregation e hlileng e leng eona, 'me ke habohlokoa ho bolela pele papiso ea pele e sebetsa.
Peptide Synthesis Mantsoe a mararo a tsamaisana le karolo e setseng ea sengoloa sena. A lebala la matla ke sete ea li-equations le liparamente tse abelang matla ho athomo e 'ngoe le e 'ngoe kapa sefaha tsamaisong. A mohlala o mahoashe e nkela lihlopha tsa liathomo sebaka ka libaka tse le 'ngoe tsa tšebelisano, lintlha tsa khoebo tsa lik'hemik'hale bakeng sa linako tse fihlellehang. A conformational ensemble ke pokello ea meaho eo peptide e e etelang, boima ka monyetla oa bona, ho ena le sebopeho se le seng se hlolang.
Mefuta e nolofalitsoeng le e mahoashe e araba lipotso tsa boemo bo kopaneng hantle. Ba beha maemo a ho kopanya, latela mekhoa ea mahala ea matla, arola β-e ruileng ho linaha tse sirelelitsoeng, bala hydrophobic patterning, le ho hakanya kotsi ea ho ikamahanya le batho ba bang. Ha ba tšepahale kapa ba khutsitse mabapi le sebopeho sa sebopeho: kabo ea boholo ba oligomer hantle, morphology ea protofibril khahlano le amorphous, 'me polymorphism ea tatelano e itseng e oela ka ntle ho seo mekhoa ena e se rarollang. Boitšoaro bo tlalehiloeng ka kakaretso bo boetse bo itšetlehile ka matla, le masimo a fapaneng a matla a ka khutlisa liphetho tse hanyetsanang bakeng sa sistimi e tšoanang ea peptide, joalo ka ha ho ngotsoe ho a 2025 tataiso ho sebopeho sa sebopeho sa li-protein aggregates le tlhahlobo e tsamaeang le matla-field transfer..
Key Takeaway: Sephetho sa mohlala ke boemo, eseng sekhahla. E u bolella hore na ke tatellano kapa boemo bofe bo tloaelehileng ho bokellana, eseng hore na kapele hakae, ho seo morphology, kapa ka boholo ba oligomer peptide ea hau e tla bokana.
Li-Peptide tsa Synthetic src=”https://molchanges.com/wp-content/uploads/2026/09/pub_20260922_044025_896_59a6098c9afc48d9bc0bd7b9f580aa27.png”>
Hobaneng ha Peptide e Tšoanang e Fumana Likarabo tse Fapaneng: Matlafatsa Mabala le Meeli ea Sampling
Lipapiso tse peli tsa tatellano e tšoanang li ka hanana ka mabaka a sa amaneng le peptide. Ea pele ke sebaka sa matla. Tekanyetso ea phetisetso ea matla e fumane hore sistimi e ts'oanang e ka rarolla e le kakaretso ea β-rich tlasa paramethara e le 'ngoe mme e sa sebetse hantle tlasa e' ngoe., ka fensetere ea sampole joalo ka pherekano: e ruile ka har'a makholo a seng makae a nanoseconds ketsahalong e le 'ngoe, e ferekanngoa feela ka mor'a nako e itseng 2 microseconds ho e 'ngoe (PMC8120800). Eo ke benchmark e le 'ngoe e holimo, eseng sehlopha sa lithuto tse kopanang, mme e lokela ho balwa ka tsela eo.
Moeli oa bobeli ke sampling le boholo ba sistimi. Boithuto bo se nang leeme ba liathomo tsohle bo bokeletsoeng 75 microseconds ea amyloidogenic peptide self-assembly e entse joalo bakeng sa 12 limolek'hule tsa peptide ka lebokoseng la li-cubic, ho fihlela li-oligomer ho fihlela ho dodecamer, le linako tsa pele tsa li-oligomers tse kaholimo ho N=4 li ntse li hasane lipakeng 10 li-nanoseconds le makholo a li-nanoseconds ho pholletsa le litsela tse ikemetseng (Litlaleho tsa Mahlale, 2016).
Leha e le moeli ke phoso eo u ka e tlosang. Ho se lumellane ka matla ke lebaka leo ketsiso e le 'ngoe e seng bopaki ba kotsi ea ho bokellana, 'me ke ka lebaka leo meeli ea ho bolela esale pele ea peptide e leng karolo ea mekhoa ea tlaleho ea hau, eseng mongolong o botlaaseng ba leqephe.
Lekhalo la Tekanyo le Nako Pakeng tsa Ketsiso le Benche
Kakaretso e etsisoang e batla e sebetsa haholo ho feta teko eo e reretsoeng ho e tsebisa. A 2025 thuto e nyalisitsoeng e mahoashe e etsisitseng hoo e batlang e le 27 mM ha teko e ntse e atamela 1 mM ke papiso e molemo (Limolek'hule, 2025). Sephetho seo se le seng sa holimo ha se na tlhahiso e ikemetseng eo nka e fumanang, kahoo e nke e le mohlala oa lekhalo ho e-na le ho lekanya kamehla. Tlhahiso ea Peptide
Lekhalo le bohlokoa hobane khatello ea maikutlo e fetoha eo fisiks e laolang. Ho 27 mM, likhohlano li etsahala khafetsa hoo sistimi e etsisitsoeng e kopanang ka nako eo microsecond trajectory e ka fihlelang.. Ho 1 mM, tatellano e tšoanang e ka lula e tsitsitse lihora tse ngata. Ka hona sampole ea Microsecond ha e bonts'e lifensetere tsa lihora le matsatsi ho na le tlhahlobo ea 'nete ea aggregation., le likheo tse peli li kopane: mahloriso a phahameng a potlakisa ketsahalo eo u lekang ho e etsa.
Bakeng sa Keletso: Ketsiso e fetang hole eo u sebetsang ho eona e ka beha tatellano khahlano le e 'ngoe, empa e ke ke ea u fa tekanyo e felletseng ea ho kopanya kapa ho bolela esale pele hore na mokhoa oa ho etsa lintho o sebetsa joang mosebetsing oa hau.
Seo lilaesense tsa sephetho se phahameng haholo ke tseko e amanang: tatelano A e bokellana kapele ho feta tatelano B tlasa maemo a etsisitsweng a tshwanang. Seo e sa faneng ka laesense ke ntho e felletseng: hore A e tla bokella buffer ea hau, ka mahloriso a hau, ka har'a fensetere ea hau ea botsitso. Boloka lipolelo tseo tse peli li arohane 'me papiso e lula e le molemo.
Ha Ketsiso e Lekane: Screening Aggregation-E Tloaelehileng Sequences
Ketsiso e lekane ha qeto e le boemo ba bonkgetheng, eseng ponelopele ea boitšoaro. In-silico triage e sebetsa e le funele: lekola sete ea mokhethoa ka botlalo ka likhakanyo tsa boemo ba tatellano e potlakileng, boloka feela bonkgetheng ba amohelehang ho pholletsa le lisebelisoa tse 'maloa tsa orthogonal hobane li-algorithms tse fapaneng li totobatsa likarolo tse fapaneng, 'mapa o tšoailoe li-hotspots ka tatellano le sebopeho, ebe o kopanya le ho leka feela lihahi tsa maemo a holimo. Joalo ka tlhahlobo ea li-algorithms tsa in-silico aggregation e beha, lisebelisoa tsena boemo le folakha ho ena le ho bolela esale pele ka bonnete, 'me ha li nkele HIC sebaka, SEC, DLS, HPLC kapa litlhahlobo tsa botsitso.
Moeli oo ha se khopolo-taba. A 2026 Nature Chemistry tlhahlobo ea 539 tatellano ea peptide e fumane tatellano e felletseng ea XGBoost e boletseng esale pele ka-resin aggregation ho 58.0% ± 3.5% nepahalo, thata ka holimo ho 57.7% ± 3.3% e ile ea fihla ka tatellano ea masalla-shuffled, ha tlhamo-vector e fana ka lintlha 59.5% ± 1.9% mme mohlala oa pejana oa Mohapatra o fihlile 60%. Ho kopanya boitšoaro bo bolokehileng: 19 ea 20 li-peptide tse kopaneng li ile tsa lula li kopane, le 14 ea 20 tatellano e sa kopantseng e ile ea lula e sa kopane. A sethala sa tlhabollo se hlophisitsoeng se neng se hlahloba laeborari ea 1.3-million-mutant fumana ho se dumellane ho tshwanang hotswa ka nqa enngwe: li-algorithms tse tharo li tšoailoe 26 masalla joalo ka aggregation-suppressable, empa e koahetsoe feela 8 tsa 12 evolution otla mesaletsa, le feela 3 masalla a ile a tšoauoa ka boraro ba bona.
Sebelisa tlhahlobo ea tatelano e tloaelehileng ho hlophisa mosebetsi oa hau, joale tlohela benche ho e rarolla.
|
Tlhahiso ea mohlala |
Seo e u fang tumello ea ho se etsa |
Ke eng e ntseng e hloka data ea benche |
|---|---|---|
|
Tloaelo ya ho kopanya |
Boemo bo amanang ka har'a sehlopha se le seng |
Tloaelo e felletseng ea ho kopanya |
|
tšekamelo ea β-sheet |
Likarolo life tsa ho fetola kapa ho tshireletsa |
Hore na phetoho e fetola bohloeki bo sa hloekang |
|
Kabo ea boholo ba oligomer |
Hore na li-oligomers lia utloahala |
Kabo ea boholo ba 'nete (SEC, DLS) |
|
Morphology |
E leng morphologies ho lebella |
Fibril khahlano le sebopeho sa amorphous (cryo-TEM) |
|
Polymorphism |
Hore mefuta e mengata e ka ba teng hammoho |
E leng sebopeho sa sehlopha sa hau se se amohelang |
Moo Li-predictors li hlolehang ho ea ka litsela tse fapaneng
Lisebelisoa tsa sehlopha sa AlphaFold le likhakanyo tsa tatellano feela li lahleheloa ke kotsi e ts'oanang ho tsoa mahlakoreng a fapaneng., ke ka lebaka leo ha ho motho a le mong ea rarollang hore na mofuta o tla kopanya. A 2025 tlhahlobo ea ponelopele ea computational aggregation e fumane hore mefuta ea sehlopha sa AlphaFold e khutlisa sebopeho se le seng se matla.: ha ba etse mohlala oa li-conformational ensembles kapa li-intermediate tse mennweng hanyenyane, ha ba na pH, matla a ionic, mocheso, motsoako oa solvent kapa membrane, 'me lintlha tsa bona tsa boitšepo li lekanya ho tsitsa ha sebopeho ho fapana le tšekamelo ea ho kopanya. Li-peptide tse boletsoeng esale pele ka tatellano feela li fetola phoso. Tse ngata li shebane le hexapeptide 'me ha li tsebe hore na sepheo se tla qetella se patiloe, pepesitsoe, kapa e amanang le lera, ka hona ba bolela esale pele ka ho kopanya liprotheine tse phuthoang ha ba ntse ba sebetsa betere ho li-peptide tse ka thoko le libakeng tse sa sebetseng hantle..
Liphello tse sebetsang ke hore mekhoa e 'meli ea ho hlōleha e ea tlatsana ho e-na le ho hloka chelete. Motho ea nang le boits'epo bo phahameng ha a bue letho ka karolo e khomarelang e pepesitsoeng, 'me hexapeptide e tšoailoeng ha e bue letho mabapi le hore na karolo eo e ka fihlelleha maemong a mennweng. Ho tšoara sephetho e le qeto mabapi le polelo ea peptide aggregation ho fokotsa skrine ho sehlopha se le seng sa phoso., kahoo mekhoa ea orthogonal e koahelang pono ea sebopeho le tatellano ke eona e sirelelitsoeng.
Ha U Hloka Custom Synthesis, Sebopeho, le Litlhahlobo
Ketsiso e araba lipotso tse amanang. Mosebetsi oa benche o araba tse felletseng: sekhahla, morphology, kutlo ea sebopeho. Ha qeto ea hau e itšetlehile ka leha e le efe ea tsona, tlhahiso ea mohlala ke khopolo-taba ea ho qala, eseng sephetho.
Mokhoa o mong le o mong o araba potso e le 'ngoe' me o na le sebaka sa oona se foufetseng. Circular dichroism e tlaleha litaba tsa lefatše ka bophara tsa sebopeho sa bobeli, empa ke karolelano ea ensemble e ke keng ea tsebahatsa moo phetoho e etsahetseng, 'me e kotsing ea ho hasanya lintho tsa khale; lintho tse ka sebelisoang li tloha ho 0.05 ho 50 mg/mL ha mahloriso ka mg/mL times pathlength ka mm e dula e le haufi 0.1 ho 0.2 (a 2025 tataiso ea ngaka ea ho kopanya sebopeho, 2025). FTIR e bala sebaka sa amide I mme e mamella disampole tse tsepamisitsoeng kapa tse kopaneng, leha ho le joalo e ntse e le lefatšeng ka bophara 'me likabelo tsa eona tsa sehlopha li ntse li sa hlaka.
DLS e fana ka boholo ba hydrodynamic le polydispersity, empa ha e khone ho arola monoma ho dimer 'me e leeme ho likaroloana tse kholoanyane hobane sekala se hasang ka boholo.; libaka tse sebetsang li lula haufi 0.2 ho 50 mg/mL, 'me bakeng sa likarolo tse kholo siling e hasanyang e ka oela hoo e ka bang 0.5 mg/mL (tataiso ea kopo ho DLS bakeng sa ho kopanya peptide, 2026). SEC-MALS e eketsa karohano le boima bo felletseng ba molek'hule, kwahelang 200 E fane 1 GDa le radii ea gyration ho tloha 10 ho 500 nm ka DAWN, e nang le khetho e phahameng ea ho tsepamisa maikutlo ho fihlela ho 180 mg/mL (lisebelisoa tse hatisitsoeng ke morekisi oa SEC-MALS, kgutlisitsoe 2026), leha ho aroloa ho ka hlapolla kapa ho ferekanya likopano tse fokolang tse ka khutlisoang.
ThT e latela kinetics ea amyloid e nang le mesaletsa ea sigmoidal, hangata ho 10 ho 20 µM, ka 20 ho 50 µM ho fana ka lets'oao le phahameng ka ho fetisisa le 50 µM e sebelisitsoeng bakeng sa tlhaloso ea lintlha, empa ha e na kutlo ho protheine ea matsoalloa le ho li-oligomeric tse ngata kapa li-intermediate tsa pele (thuto e tloaelehileng ea mahloriso ea ThT, 2017). Cryo-TEM e bonts'a morphology ka kotloloho ha e ntse e nka karolo e nyane feela ea baahi, mme SAXS e khutlisa qeto e tlase, ensemble-average solution shape e ke keng ea rarolla ka mokhoa o ikhethileng metsoako e fapaneng (phuputso e sebetsang ea mekhoa ea tlhahlobo e sebelisoang ho khetholla liprotheine le peptide aggregates, 2021).
|
Mokhoa |
E araba potso ea aggregation |
Moeli oa ho lemoha kapa kotsi ea tšitiso |
|---|---|---|
|
CD |
Litaba tsa lefats'e la bobeli ba sebopeho |
Ensemble karolelano, ha e khone ho fetola phetoho; ho hasanya lintho tse entsoeng ka matsoho; 0.05-50 mg / mL ka mahloriso × pathlength ≈ 0.1-0.2 |
|
FTIR |
Sebopeho sa bobeli sa lefats'e, amide I |
E ntse e le lefatšeng ka bophara; kabelo ea sehlopha e sa hlakang; e mamella disampole tse tsepamisitsweng |
|
DLS |
Boholo ba Hydrodynamic le polydispersity |
Ha e khone ho arola monoma ho tloha ho dimer; e leeme nqa e kgolonyana; ≈0.2–50 mg/mL, siling e qhalaneng e le 'ngoe ≈0.5 mg / mL bakeng sa likarolo tse kholo |
|
SEC-MALS |
Palo ea batho ba monomer/oligomer, boima bo felletseng ba molek'hule |
Karohano e ka hlapolla kapa ea ferekanya likopano tse fokolang tse ka khutlisoang morao; tsebo e nyane mabapi le sebopeho |
|
ThT |
Sebopeho sa Amyloid fibril le kinetics |
Ha e na kutlo ho protheine ea matsoalloa le ho li-oligomeric tse ngata kapa li-intermediate tsa pele; 10-20 µM e tloaelehileng |
|
Cryo-TEM |
Morphology |
Litšoantšo ke karolo e nyane feela ea baahi |
|
SAXS |
Sebopeho sa tharollo e tlaase |
Ensemble-karolelano; ha e khone ho rarolla ka mokhoa o ikhethileng metsoako e fapaneng |
Lehlakore la synthesis le na le ho hloka botsitso ha lona. SPPS ea tatellano e thata ha se ntho e sa tloaelehang: ka nqane 539 tatellano ea peptide, 49.9% e bonts'itseng ka-resin aggregation, e hlalosoa e le tlhoro ea tšireletso e atolohang ka holimo 20% khahlano le kopano ea pele, hangata ho qala 5 ho 15 masalla a tsoang ho ankora ea resin (a 2026 Nature Chemistry tlhahlobo ea 539 tatellano ea peptide, 2026). Tlhahlobo e tšoanang e fumane hore pseudoproline incorporation e phahamisitse bohloeki bo sa hloekang 23% ho 69% bakeng sa hGH le ho tloha 17% ho 75% bakeng sa GB1, kahoo maano a ho laola ka kopanelo a lefa e le bohloeki ho e-na le ho bolela esale pele.
Tlhokomediso: Tlaleha maemo ao tlhahlobo ea hau e sebelitseng tlas'a ona: mocheso, pH, matla a ionic, khatello ea maikutlo ea peptide, nako ea ho qhoqhoa, le histori ea pherekano. Ntle ho tsona, morphology kapa sekhahla se ke ke sa bapisoa le sephutheloana sefe kapa sefe sa data, ho kenyelletsa le mabelo a hau a pejana.
Ho se nke lehlakore, mohlala o ka phetoang oa ho koala sekheo mohlala o siileng o butsoe: ha mohlala o mennoeng o tšoaea tatellano e le mokhoa oa ho kopanya empa o sa khone ho bolela hore na kakaretso ke fibrillar kapa amorphous, karabo e tsoa bencheng. Liphetoho tsa MOL li ts'ehetsa letsoho ka mokhoa oa peptide synthesis bakeng sa lithuto tse kopaneng, ho kopanya SPPS, RP-HPLC tlhoekiso ho 95% kapa ho feta, le netefatso ea boitsebiso ba ESI-MS kahoo thepa e kenang CD, ThT, kapa SEC-MALS ke tatellano eo u e entseng ho fapana le motsoako oa lihlahisoa tsa ho fokotsa le ho hlakola. Litlhaloso tsa bohloeki, foromo ea counterion, 'me meeli ea endotoxin e lokela ho boleloa ka lotho, hobane e 'ngoe le e' ngoe e fetola 'malo o hlahisoang ke tlhahlobo e tlase.
Ho Rala Assay Kahoo Sephetho se Bolela Ho hong
Aggregation assay ke factorial matrix, ha ho tekanyo e le nngwe. Fapanya ho tsepamisa mohopolo, pH, matla a ionic, mocheso, le nako mmoho, hobane kakaretso ea mohlala e bolela esale pele ke eona e hlahang tlas'a motsoako o itseng oa mefuta eo. Sebelisa buffer-feela, protheine feela, le dae kapa ditaolo tsa ho hasana ka thoko ho sampole, 'me u nke lintlha tsa nako e lekaneng ho arola qaleho le tsoelo-pele. Ho bala ntlha e le 'ngoe ho ke ke ha khetholla tse peli.
Litšebeletso Phapang e etsang qeto ea hore na u ka batla eng ke kinetic le thermodynamic control. Tlas'a taolo ea kinetic, kakaretso e shebiloeng ke mofuta o hlahang kapele ka tlasa maemo ao. Tlas'a taolo ea thermodynamic, ke mofuta o tsitsitseng kapa o leka-lekaneng ka mor'a nako e lekaneng bakeng sa ho khutlisetsoa morao le ho hlophisoa bocha. Phuputso ea protocol ea transthyretin aggregation e hlalosa hore na mebuso ena e aroloa joang ka liteko le hore na protocol e tlameha ho tlaleha eng hore papiso e tšoarelle..
Taeo eo ea ho tlaleha ke ka lebaka leo lipapiso tse ngata tse phatlalalitsoeng tse kopantseng li sa bapisoang: matrices a fapaneng, lifensetere tsa nako tse fapaneng, ditaolo tse fapaneng. Fumana mohato ona hantle 'me boemo ba mohlala bo fetoha polelo e ka sireletsoang ka peptide ea hau.
Maikutlo a Tloaelehileng a Folding ka Peptide Folding Models le Aggregation
Lintlha tsa kholiseho ha se lintlha tse kopaneng. pLDDT le metrics e ts'oanang e hlalosa kamoo mohlala o hlahisang lesapo la ona le boletsoeng esale pele, eseng hore na lesaka leo le tla ikamahanya le tharollo. Tokiso ke ho tšoara boits'epo e le sesefa mabapi le ho nepahala ha sebopeho le ho hlahisa kotsi ea ho bokellana ho tsoa ho li-predictors tse inehetseng kapa, betere, ho tsoa boitšoarong bo lekantsoeng.
Sebaka se le seng sa matla ha se 'nete ea motheo. Tatelano e ts'oanang e ka boleloa esale pele hore e tla hokahanngoa tlas'a paramethara e le 'ngoe' me e be bonolo tlasa e 'ngoe, ke ka lebaka leo liphetho tsa motho a le mong li lokelang ho tlalehoa e le mokhoa o itšetlehileng ka mokhoa ho e-na le thepa ea tsamaiso. Matha bonyane likarolo tse peli tsa matla kapa liprothokholo tsa sampole 'me u tšoare ho se lumellane e le lets'oao.
Ho tsepamisa mohopolo ha ho sebetse. Phapang pakeng tsa ketsiso-scale le benche-scale concentration is orders of the magnitude, kahoo mohlala o itšoereng hantle maemong a phahameng a etsisitsoeng o bua hanyane ka a 1 MM boitokisetso ba liteko. Kopanya tsamaiso ea mohlala le teko pele u etsa liqeto.
Li-predictors tsa tatellano feela ha lia etsetsoa liprotheine tse mennweng. Lisebelisoa tsena li bolela esale pele kotsi ea ho bokellana ha li sebelisoa ho tatellano e kenang ka har'a meaho e tsitsitseng ea globular., hobane libaka tse patiloeng tsa hydrophobic ha li senoloe naheng ea habo. Netefatsa taba e mennweng pele o amohela mohala o kotsi haholo.
Teko e le 'ngoe ha se setšoantšo sohle. CD, DLS, SEC-MALS, ThT, cryo-TEM le SAXS e 'ngoe le e' ngoe e araba potso e fapaneng 'me e' ngoe le e 'ngoe e na le sebaka se sa boneng: ThT e hloloheloa li-aggregate tse seng tsa fibrillar, DLS e sokola ho rarolla metsoako, 'me CD e tlaleha ka karolelano sebopeho sa bobeli ho e-na le ho ajoa ha mefuta. Kopanya mekhoa ea orthogonal pele u phatlalatsa hore foromo e hloekile.
Key Takeaway: Haeba qeto e hloka nomoro e felletseng, morphology, kapa karabo ea tlhahiso, mohlala ha se sebetsa.
Kamoo Katleho e Shebahalang Kateng: Qetello ea Pokello e ka Tšireletsoang
Haeba ts'ebetso e sebetsa hantle, joale u ka bolela lintho tse hlano ntle le ho kheloha. Ea pele, ke bonkgetheng bafe bao o ba beileng pele le ka mabaka afe: tlhahiso e khethehileng ea mohlala, eseng maikutlo a akaretsang a hore li shebahala li le kotsi. Ea bobeli, moaho o le mong o tsoileng pele ho kopanyo. Ea boraro, seo boitsebiso le bohloeki netefatso di bontshitseng. Ea bone, se tlalehiloeng ke 'malo oa sebopeho sa bobeli. Ea bohlano, seo teko ea ho kopanya e lekantsoeng ka tlasa boemo bo boletsoeng ka botlalo.
Matshwao ao a mahlano a konkreite mme a ka hlahlojwa. Bohloeki bo tlalehoa e le setšoantšo sa RP-HPLC khahlano le moeli o boletsoeng, ka tloaelo 95% kapa ho feta bakeng sa lisebelisoa tsa boemo ba tlhahlobo. Boitsebiso bo netefatsoa ke ESI-MS khahlanong le boima bo baloang. Sebopeho sa bobeli se tsoa ho CD kapa FTIR bala. Teko e kenya letsoho thupelong ea nako le qalo e arohaneng le tsoelopele, kahoo o ka khetholla moaho o kopanyang hanghang ho o senyehang ka lihora tse ngata.
Hang ha boemo boo ba motheo bo behiloe bo lokisitsoe, sepheo se hlakileng sa ho otlolla ke sebopeho-sensitivity kapa thuto e khuts'oane ea botsitso kahong e tšoanang. U se u ntse u e-na le sebaka sa litšupiso; ho fetola phetoho e le 'ngoe ka nako ho tloha moo ho theko e tlaase ha ho bapisoa le ho tsosolosa motheo.
Lipotso Tse Botsoang Khafetsa
A na nka sebelisa AlphaFold ke le mong ho beha maemo a tloaelehileng a ho kopanya?
Che. AlphaFold e bolela esale pele sebopeho se le seng se tsitsitseng, kahoo ha e khutlisetse kopano e lumellanang le maemo a tikoloho joalo ka pH, matla a ionic, kapa ho tsepamisa maikutlo. Kakaretso e ipapisitse le likhechana tsa nakoana tse pepesehileng le ho palo ea batho ba linaha tse seng li sa phutholoha, leha e le ho eona mohlala o le mong o hapang. Sebelisa AlphaFold e le tlhahiso e le 'ngoe, ebe u beha boemo ba bakhethoa ka kakaretso e hlakileng ea aggregation kapa ensemble e khuts'oane ea papiso.
Hobaneng lipapiso tse peli tsa peptide e le 'ngoe li sa lumellane?
Mabala a qobelloang a kenyelletsa likhetho tse fapaneng tsa torsional le kalafo e fapaneng ea tharollo, kahoo tatelano e tšoanang e ka hlahisa mekhoa e fapaneng ea sebopeho sa bobeli tlas'a e 'ngoe le e' ngoe. Sampling e eketsa mohloli oa bobeli oa phapang: ho matha ho sa phonyoheng beisi ya yona e qalang e tlaleha beisine e qalang, eseng sehlopha se fumanehang. Pele o bapisa liphetho tse peli, hlahloba hore na ke sebaka sefe sa matla le hore na ke fensetere efe e sebetsang ea sampole e sebelisitsoeng.
Teko ea ho kopanya e nka nako e kae, le se behang nako?
Nako e latela potso. Ho bala kinetic joalo ka thioflavin T fluorescence e rarolla nucleation le elongation ka lihora tse ngata ho isa matsatsing., athe ntlha ya thermodynamic joalo ka solubility Reka kapa tekanyo ea sedimentation e hloka hore sistimi e fihlelle tekano, e ka nkang nako e telele. Beha fensetere ho tsoa ts'ebetsong eo u lekang ho e shebella, eseng ho tsoa molemong oa lisebelisoa.
Ke mokhoa ofe o le mong oo ke lokelang ho o sebelisa haeba ke khona ho tsamaisa o le mong feela?
Ha ho mokhoa o le mong. 'Mapa oa potso ho mokhoa: RP-HPLC le ESI-MS bakeng sa boitsebiso le bohloeki, circular dichroism kapa FTIR bakeng sa sebopeho sa bobeli, DLS kapa SEC-MALS bakeng sa boholo ba oligomer, le cryo-TEM bakeng sa morphology. Mokhoa o mong o araba potso e le 'ngoe, kahoo khetha e lekang mokhoa o itseng oa ho hlōleha oo u o belaellang.
E etsisoa aggregation at high concentration ntse le molemo?
Ee bakeng sa maemo, che bakeng sa litefiso tse felletseng. Lisistimi tse etsisoang hangata li lula hole le ts'ebetso ea liteko, kahoo ho hlophisoa ha mefuta e fapaneng ho ka fetisa ha nako e boletsoeng esale pele e sa etse joalo. Tšoara sephetho e le boemo bo lekanyelitsoeng 'me u tiise bakhethoa ba ka sehloohong maemong a mahloriso a bencheng.
Ke bohloeki bofe boo ke lokelang ho bo lebella bakeng sa tatellano e thata?
Ho thata ho etsa tatelano e tloaelehileng ea ho kopanya, le on-resin aggregation nakong ea kopano ea ketane ke sesosa se tloaelehileng sa bohloeki bo tlase. Li-block tsa pseudoproline dipeptide li sitisa ho bokellana ha resin le ho ntlafatsa bohloeki ba tatellano e thata., kahoo tlhaloso e ka finyelloang e itšetlehile ka tatellano le ka leano la ho kopanya le khethiloeng bakeng sa lona.
Qetello
Hona joale o ka arola lipotso ka mokhoa o bonolo oa ho mena oa peptide le phallo ea mosebetsi oa aggregation e ka arabang ho tse kopaneng feela., tlhabollo, mme tlhahlobo e ka fela. Boemo ba mehlala le tatelano ea bakhethoa ba lifolakha; ha ba bolele esale pele ho bokellana ka kholiseho, 'me ha li nkele HIC sebaka, SEC, DLS, HPLC, kapa lithuto tsa botsitso, joalo ka tlhahlobo ea li-algorithms tsa in-silico aggregation e behiloeng. Tšoara khakanyo e le khopolo-taba ea ho leka, eseng sephetho ho tlaleha. About
Haeba mohato o latelang o hlahisa bopaki boo, Liphetoho tsa MOL li tšehetsa mokhoa oa ho kopanya, tlhoekiso, le tlhaku bakeng sa tatelano e tlwaelehileng ya ho kopanya, ho tloha ho milligram screening lots ho isa ho kilogram scale. U ka buisana le setsebi mabapi le lipuisano tsa libapali le ho lekola liteko tseo tatellano ea hau e hlileng e li hlokang.
Tsebiso: Liphetoho tsa MOL li fana ka lits'ebeletso tsa ho kopanya peptide le lits'ebeletso tsa sebopeho, kahoo e na le thahasello ea khoebo ho litekanyetso tsa boleng tse boletsoeng mona.
