Peptidmodifikationer
FRET Peptid
Hvad er FRET-peptid?
FRET-peptidmærkning har et donormolekyle og en acceptor (sprængningsmiddel) molekyle. I de fleste tilfælde, donor- og acceptorparrene er to forskellige farvestoffer. Hvis acceptoren er et ikke-fluorescerende farvestof (sprængningsmiddel), den overførte energi fra den fluorescerende donor omdannes til molekylære vibrationer. Når FRET er afsluttet (ved at adskille donor og acceptor), en stigning i donorfluorescens kan påvises. Når både donor- og acceptorfarvestoffer er fluorescerende, den overførte energi udsendes som lys med længere bølgelængde, gør det muligt at måle ændringer i donor- og acceptorfluorescensintensitetsforholdet. Til effektiv FRET-sprængning, fluorofor- og sprængstofmolekylerne skal være i umiddelbar nærhed af hinanden (~10-100 Å) og sprængmidlets absorptionsspektrum skal overlappe med fluoroforens emissionsspektrum. Omhyggelig sammenligning af donorens fluorescensspektrum og absorptionsspektret af sprængstoffet er påkrævet, når der designes donorsprængende FRET-systemer.
FRET peptider videnskab
Vigtigste fordele ved FRET-peptider:
· Realtidsovervågning af enzymatiske reaktioner og proteinaktivitet.
·Ekstremt høj detektionsfølsomhed på grund af unik nærhedsbaseret energioverførsel.
·Alsidighed til in vitro og in vivo applikationer, give indsigt i komplekse biologiske processer.
|
Fluorofor
|
Quencher
|
Tidligere donor
|
|---|---|---|
|
Abz |
Dnp 2,4-dinitrophenyl |
320 nm/420 nm |
|
Abz |
Dnp 2,4-dinitrophenyl |
320 nm/420 nm |
|
Mca |
Dnp 2,4-dinitrophenyl |
325 nm/392 nm |
|
Trp |
Dnp 2,4-dinitrophenyl |
280 nm/360 nm |
|
FAM |
Dabcyl4-([4'-dimethylamino)phenyl]kan)benzoyl |
492 nm/517 nm |
|
Lucifer gul |
Dabsyl4(Dimethylamino)azobenzen-4'-sulfonyl |
430nm/520 nm |
Udvalgte citater
Ultrafølsomme tumorgennemtrængende nanosensorer for proteaseaktivitet
Evnen til at identificere cancerlæsioner med endogene biomarkører er i øjeblikket begrænset til tumorer ~1 cm i diameter. Vi har for nylig rapporteret en eksogent administreret tumorgennemtrængende nanosensor, der udskilles, som reaktion på tumorspecifikke proteaser, peptidfragmenter, der så kan påvises i urinen. Her, vi rapporterer optimeringen, informeret af en farmakokinetisk matematisk model, af overfladepræsentationen af peptidsubstraterne for både at forbedre on-target protease spaltning og minimere off-target spaltning, og af funktionaliseringen af nanosensorerne med tumorgennemtrængende ligander, der engagerer aktive handelsveje for at øge aktiveringen i tumormikromiljøet. Den resulterende nanosensor skelnede sub-5 mm læsioner i humane epiteltumorer og detekterede knuder med mediandiametre mindre end 2 mm i en ortotopisk model af ovariecancer. Vi demonstrerer også øget receptorafhængig specificitet af signalgenerering i urinen i en immunkompetent model af kolorektale levermetastaser, og in situ aktivering af nanosensorerne i humane tumormikroarrays, når de ombygges som fluorogene zymografiprober.
Relaterede peptidmodifikationstjenester
peptidglykosylering
peptidglykosylering
Peptidglykosylering er en kovalent modifikation, der potentielt kan forbedre de fysisk-kemiske egenskaber af peptider
Læs merepeptidfosforylering
peptidfosforylering
Fosfordannelse kan forekomme på Serine (S, At være), Threonin (T, Thr) og tyrosin (Y, Tyr) sidekæder ved phosphoesterbindingsdannelse
Læs mereHæftede peptider
Hæftede peptider
Introduktion af to unaturlige aminosyrer indeholdende α-methyl, a-alkenylgrupper under fastfasesyntese af peptidkæder.
Læs mereCyklisk peptid
Cyklisk peptid
Peptidcyklisering øger peptidernes konformationelle stabilitet (i forhold til deres lineære analoger) og er en fælles strategi i peptidudvikling.
Læs merepeptidmodifikation
Stor erfaring med peptidmodifikation, giver flere levedygtige veje til peptidforskning.