Peptidmodifikationer
peptidfosforylering
Hvad er peptidfosforylering?
Cellulær fosforylering er en modifikation, der kan ændre aktiviteten, bindende egenskaber, eller cellulær lokalisering af proteiner eller enzymer. Det er også en vigtig reguleringsproces, der spiller en afgørende rolle i mange sygdomspatologier, herunder betændelse, kræft, neurologiske og metaboliske lidelser. Enzymer, der phosphorylerer proteiner ved specifikke aminosyrerester (f.eks., tyrosin, serin, og threonin) kaldes kinaser. Enzymer, der fjerner en fosfatgruppe ved hydrolyse, kaldes fosfataser. Fordi phosphorylering er central for de fleste signaltransduktionsveje, phosphorylerede peptider (dvs., fosfopeptider) anvendes til analyse af proteinkinaser og phosphataser i maj cellulære assays.
Typisk placering af phosphorylgrupper
Fosfordannelse kan forekomme på Serine (S, At være), Threonin (T, Thr) og tyrosin (Y, Tyr) sidekæder ved phosphoesterbindingsdannelse. CPC Scientific kan syntetisere phosphopeptider og inkorporere enkelte eller flere kombinationer af phosphoserin (pS), phosphothreonin (pT), eller phosphotyrosin (pY).

Phosphoserin
Phosphoserin er et kort peptid eller peptidkæde, der indeholder en phosphoryleret serin (pSer), dvs., et peptidfragment, hvori hydroxylgruppen (-Åh) af en serinrest er modificeret af en phosphatgruppe (-PO₄²-).

Phosphothreonin
Phosphothreonin er et kort peptid eller polypeptidkæde, der indeholder phosphothreonin (pThr), dvs. et peptid, hvori hydroxylgruppen (-Åh) af en threoninrest modificeres af en phosphatgruppe (-PO₄²-).

Phosphotyrosin
Phosphotyrosin er en kort peptid- eller polypeptidkæde, der indeholder phosphotyrosin (pTyr), dvs. et peptid, hvori den phenoliske hydroxylgruppe (-Åh) af en tyrosin (Tyr) rest er modificeret af en phosphatgruppe (-PO₄²-).
Udvalgte citater
PRMT5 C-terminal phosphorylering modulerer en 14-3-3/PDZ interaktionsswitch*
PRMT5 er det primære enzym, der er ansvarligt for aflejringen af det symmetriske dimethylarginin i pattedyrsceller. I et forsøg på at forstå, hvordan PRMT5 er reguleret, vi identificerede et threonin-phosphoryleringssted i et C-terminalt halemotiv, som er målrettet af Akt/serum- og glukokortikoid-inducerbare kinaser. Mens vi undersøger funktionen af denne posttranslationelle modifikation, vi opdagede serendipitalt, at dens frie C-terminale hale binder PDZ-domæner (når den ikke er fosforyleret) og 14-3-3 proteiner (når fosforyleret). I det væsentlige, en phosphoryleringshændelse inden for de sidste par rester af den C-terminale hale genererer en posttranslationel modifikationsafhængig PDZ/14-3-3 interaktions-"switch". Det C-terminale motiv af PRMT5 er påkrævet for plasmamembranassociering, og tab af denne koblingskapacitet er ikke foreneligt med livet. Dette signalfænomen blev for nylig rapporteret for HPV E6 oncoproteinet, men er endnu ikke blevet observeret for pattedyrsproteiner. At undersøge forekomsten af PDZ/14-3-3-skift i signaltransduktion, vi byggede et protein domæne mikroarray, der huser PDZ domæner og 14-3-3 proteiner. Vi har brugt denne mikroarray til at udspørge de C-terminale haler af en lille gruppe af kandidatproteiner og identificeret ERBB4, PGHS2, og IRK1 (samt E6 og PRMT5) som i overensstemmelse med denne signaleringstilstand, tyder på, at PDZ/14-3-3-skift kan være et bredt biologisk paradigme.
Relaterede peptidmodifikationstjenester
peptidglykosylering
peptidglykosylering
Peptidglykosylering er en kovalent modifikation, der potentielt kan forbedre de fysisk-kemiske egenskaber af peptider
Læs merepeptidfosforylering
peptidfosforylering
Fosfordannelse kan forekomme på Serine (S, At være), Threonin (T, Thr) og tyrosin (Y, Tyr) sidekæder ved phosphoesterbindingsdannelse
Læs mereHæftede peptider
Hæftede peptider
Introduktion af to unaturlige aminosyrer indeholdende α-methyl, a-alkenylgrupper under fastfasesyntese af peptidkæder.
Læs mereCyklisk peptid
Cyklisk peptid
Peptidcyklisering øger peptidernes konformationelle stabilitet (i forhold til deres lineære analoger) og er en fælles strategi i peptidudvikling.
Læs merepeptidmodifikation
Stor erfaring med peptidmodifikation, giver flere levedygtige veje til peptidforskning.