O ho Amino Acid Notation - Pyrrolysine, Boemo le Liphetoho tsa Sebopeho
Tripeptide-1 Wholesale Peptide Khahlanong le Protheine O emela pyrrolysine, Pyl e khutsufalitsoeng, ka tatellano ea tatellano ea amino acid e amohelang masalla ana a khouto ea lefutso. E fapane le khoutu e tloaelehileng ea lysine K. Pele o toloka O ho rekoto, netefatsa hore mongolo ke tatellano ea peptide ho sebelisoa tumellano eo: ka mokhoa oa lik'hemik'hale, O e bolela oksijene, 'me letšoao la sebaka le sa hlalosoang le hloka tlhaloso ho e-na le kabelo ea amino acid e ikemetseng.
Liphetoho tse tharo li thusa ho hlophisa tlhaloso: sistimi ea notation, boitsebiso bo abetsoeng masalla, le boemo ba masalla ka ketane. Ho fetola e 'ngoe le e' ngoe ho ka ama qeto e fapaneng. Mehlala e ka tlase e ruta boinahanelo 'me ha e bue ka ketsahalo e lekantsoeng, botsitso, kapa bokhoni ba ho kopanya.
Qala ka mohloli oa letšoao
The RESID database FAQ e tsebahatsa O/Pyl e le pyrrolysine mme e fana ka lintlha tse fapaneng lits'ebetsong tse ling tsa marang-rang le mananeong.. Phapang ke lebaka la ho hlahloba litumellano tsa rekoto, eseng tumello ea ho nkela Pyl sebaka sa lik'hemik'hale ka lysine. Boloka tatelano ea pele le litlhaloso tsa eona ha u fetisetsa sepheo.
Hao le basebetsi mmoho' 2002 pampiri ea sebopeho sa methyltransferase e tlaleha masala a ikhethileng a UAG ka methanogen mme e fana ka tlhahiso ea L-pyrrolysine. Ka ho fapana, the Tafole e tloaelehileng ea liphatsa tsa lefutso tsa NCBI e tšoaea TAG e tsamaellanang ea mofuta oa DNA e le pheliso; NCBI e hlalosa ts'ebeliso ea eona ea T litafoleng tseo tsa RNA U. Boemo ba baeloji bo bohlokoa, kahoo liketsahalo tse sa reroang tsa UAG ha lia tlameha ho fetoloa kaofela ho Pyl.
Ka hona, tlhaloso ea tatellano ea amino acid le phetolelo ea nucleotide ke mesebetsi e fapaneng. Ho bala O tlalehong ea protheine e hlalositsoeng ha ho hloke ho etsa eka O ke nucleotide. Ho fetolela tatellano ea nucleic-acid ho hloka hore ho be le khoutu ea lefutso e nepahetseng le moelelo oa baeloji, ho e-na le ho nkela sebaka se seng le se seng se bonahalang se ema ka amino acid e sa tloaelehang.
E feto-fetohang: fetola maemo a notlo ha o ntse o boloka mophetwa
Mongolo o tšoanang o hatisitsoeng o ka kenya letsoho lipuong tse fapaneng. Sebakeng sa tatellano e nang le kopano e hlakileng ea O/Pyl, e bolela masalla. Ka mokhoa oa limolek'hule, e bala liathomo tsa oksijene. Setšoantšong sa rekoto ea khale, e kanna ea hloka ho khetholloa ho noto ea linomoro. Moelelo o fetola tlhaloso ntle le ho fetola sebopeho sa mophetwa.
| Moelelo | Mokhoa oa ho hlalosa O | Seo u lokelang ho se hlahloba pele u tsoela pele |
|---|---|---|
| Peptide kapa tatelano ea protheine e tšehetsang khoutu e atolositsoeng | Pyrrolysine mesaletsa, Pyl | Tlhaloso ea mohloli, boemo, le litlhaloso tse amehang |
| Foromo ea lik'hemik'hale | Letšoao la element ea oksijene | Syntax ea foromo le lipalo tsa athomo |
| Kgutsufatso ea laboratori ea lehae e sa hlalosoang | Moelelo o lula o sa netefatsoa | Senotlolo sa notation kapa tlhakiso ho tsoa ho sengoli sa rekoto |
| Setšoantšo kapa mongolo o nang le typography e sa hlakang | E ka 'na eaba ke taba e ngotsoeng e hlokang tlhahlobo | Rekoto ea mantlha le phapang lipakeng tsa tlhaku O le zero |
| Tatelano ya Nucleotide kapa tlhahiso ya phetolelo | E hloka tlhahlobo ea kopano ea tšimo le ea phetolelo | Mofuta oa tatellano, tafole ea khoutu, le litlhaloso tsa baeloji |
Phello e lebeletsoeng ea ho hlakisa moelelo ke tlhaloso e betere, eseng phetoho ea molek'hule e ka tlaase. Ho lokisa sengoloa ho ka fetola sepheo se sisintsoeng, leha ho le joalo, haeba tlhaloso ea pejana e ne e fosahetse. Boloka tlaleho ea pele le tokiso e ngotsoeng ho e-na le ho etsa hore taba e be e tloaelehileng ka khutso.
Se ke oa nkela O e sa tšehetsoeng sebaka ka K hobane feela lenaneo le amohela K. Phapanyetso e loketseng tekheniki e ka fetola ntho ea lik'hemik'hale. Li-Peptides tsa Middleman Haeba sesebelisoa se ke ke sa emela masala a reretsoeng, sebedisa tlhaloso e nepahetseng kapa kemedi enngwe eo moelelo wa yona o ka netefatswang.
Tse peli tse feto-fetohang: tlosa pyrrolysine ka lysine sebakeng se le seng
Ho ruta ka boiqapelo: sepheo sa masala a mane se ngotsoe GOAS, ka O e hlalosoang ka ho hlaka e le Pyl maemong 2. Ho fetola masala ao ka K ho fana ka GKAS. Palo ea mesaletsa e sala e le bone, empa boitsebahatso bo setseng le sebopeho sa lik'hemik'hale lia fetoha. Ka hona tatellano e 'meli e lokela ho ba le litlhaloso tse fapaneng tsa sepheo le bongata bo baloang ka nepo.
Phetoho ha e lokafatse ho bolela esale pele ka tefiso, ho qhibiliha, kapa mosebetsi wa baeloji. Kamano ea Pyrrolysine le lysine ha e etse hore liketane tsa bona tsa mahlakoreng li fetohe. Tripeptide 1 Moetsi Ho hlalosa thepa e bonahalang, nahana hantle ka mehaho, karolo e setseng ya tatelano, termini, liphetoho, le maemo a tekanyo.
Papiso e molemo e ka hlakisa hore na projeke e batla ho ithuta eng ho tsoa ho e 'ngoe le ho boloka likarolo tse ling tsa bohlokoa li lumellana. E boetse e lokela ho khetholla thepa leha e le efe e sa kang ea lekanngoa. Phetoho e lekantsoeng ea sebopeho e fapane le phetoho e bonts'itsoeng ea tšebetso.
Bakeng sa taelo, kopa sehlopha sa tekheniki ho netefatsa boitsebiso bo felletseng ba lik'hemik'hale ho e-na le hore feela lengolo le amoheloe ke foromo ea ho odara. Haeba mofani oa thepa a etsa tlhahiso ea e 'ngoe kapa e tsoang ho e sirelelitsoeng, etsa qeto ea hore na e lumellana le sepheo sa ho qetela se reriloeng. Mohloli oa mohaho oa amino acid ha se bopaki bo ikemetseng ba hore peptide e phethiloeng e kopiloeng e se e hlahisitsoe ebile e khetholloa. Sky Peptide
Tse tharo tse feto-fetohang: suthisa O ha o ntse o boloka sebopeho sa masalla
Joale bapisa GOAS le GAOS tlas'a sephetho se tšoanang se boletsoeng le menahano ea phetoho. Ka bobeli li na le Gly, Pyl, Ala, le Ser hang, empa Pyl o boemong 2 tatellanong le boemo ba pele 3 ea bobeli. Sebopeho sa masalla ha se fetohe ha odara e ntse e fetoha.
Tlas'a maikutlo a tšoanang a lik'hemik'hale, Ka hona, bongata bo sa nke lehlakore bo thehiloeng ho sebopeho boa tšoana. Boima bo tšoanang bo ke keng ba khetholla ka bobona tatellano eo ea boemo. Bopaki bo hlokahalang bo tlameha ho sebetsana le taelo kapa phapang ea sebaka seo e leng sa bohlokoa morerong. Boima bo baliloeng ka nepo bo molemo, empa ha se bopaki bo felletseng ba boitsebiso ba tatelano.
Ho tsamaisa masalla ho ka fetola litšebelisano tsa lehae, empa ha ho tataiso e akaretsang kapa boholo ba phetoho ea tšebetso e latelang mohlaleng ona oa thuto. Se ke oa tšoaea mofuta o le mong hore o tsitsitse, ho qhibiliha ho feta, kapa ho sebetsa haholo ntle le bopaki bo nepahetseng. Ponelopele ya boleng e e tshehetswang mona ke hore dibopeho di a fapana leha ho arolelanoa tlhamo.
Boloka linomoro li tiisitsoe ho tatellano e felletseng le tataiso ea eona e boletsoeng. Haeba rekoto e kenyelletsa selelekela, tag, kapa foromo e sebetsitsoeng, hlakisa hore na ho sebelisoa sistimi efe ea linomoro. Leibole ea boemo ntle le tšupiso eo e ka supa masalla a fapaneng tokomaneng e 'ngoe.
Arola boitsebahatso ba masalla ho tloha boemong ka lipheo tse nne tsa boikaketsi
Liphetoho tse peli tsa sebopeho li ka hlophisoa e le matrix a papiso e nyane. Hlalosa li-peptide tse 'nè tse inahaneloang tse nang le li-termini tsa N le C tsa mahala, ha ho na liphetoho tse eketsehileng, le tlhophiso ea L sebakeng se seng le se seng se setseng sa chiral. Glycine e nkoa e le ea bohlokoa. O e bolela pyrrolysine ka ho hlaka mona. Tsena ke lipehelo tse etselitsoeng ho ruta, ha ho tlalehoe li-syntheses, litekanyo kapa sephetho sa baeloji. Tripeptide 1 Mofani
| Boitsebahatso ba masalla | Masala a khethehileng boemong 2 | Masala a khethehileng boemong 3 |
|---|---|---|
| Pyrrolysine | H-GOSE-OH | H-GAOS-OH |
| Lysine | H-GKAS-OH | H-GAKS-OH |
Bapisa le axis e le 'ngoe pele u toloka ka bobeli
GOAS khahlano le GKAS e fetola boitsebiso boemong ba bobeli ha e siea maemo a mang a tsitsitse. GAOS khahlano le GAKS e etsa hore boitsebiso bo lumellanang bo fetohe boemong ba boraro. Lipapiso tsena ka bobeli li nkela Pyl sebaka ka Lys, ka hona, ha ho na taba ea hore masala a ka fetoha. Ba hlalosa liphapang tse arohaneng tsa limolek'hule tse tla hloka sebopeho sa tsona le litekanyo tse nepahetseng.
GOAS khahlano le GAOS ho fapana le moo e fapanyetsana maemo a Pyl le Ala ha e ntse e boloka lethathamo la masala.. GKAS khahlano le GAKS e etsa phapanyetsano e ts'oanang ea Lys le Ala. Sehlopha se seng le se seng sa phalliso se na le sebopeho se ts'oanang sa mantlha tlasa menahano e boletsoeng, leha tatelano ya yona e fapane. Boima bo tiileng bo ipapisitseng le sebopeho bo ke ke ba etsa qeto ea hore na ke setho sefe sa sehlopha sa phalliso se teng.
Papiso ea diagonal, joalo ka GOAS khahlano le GAKS, e fetola boitshupo le boemo mmoho. E ka ba papiso e molemo bakeng sa morero o itseng, empa phapang e ke ke ea abeloa feela ho nkela Pyl sebaka kapa ho falla feela. Matrix e etsa hore pherekano eo e bonahale pele tekanyo ea thepa e hlalosoa.
Nomoro ea boemo e supa masalla, eseng tikoloho e felletseng ea lehae
Ho tsamaisa masala a khethehileng ho tloha boemong ba bobeli ho ea ho ba boraro ho fetola baahelani ba eona ba tatellano: e pakeng tsa Gly le Ala tokisetsong ea pele le pakeng tsa Ala le Ser ka lekhetlo la bobeli. Termini e reriloeng e lula e tšoana, empa bohole ba bona ba tatelano ho masalla ao le bona bo fapane. Tsena ke litebello tsa sebopeho, eseng likhakanyo tsa phetoho e itseng ea taolo, conformation, ho qhibiliha kapa mosebetsi.
Haeba teko ea morao-rao e fumana phapang, e hlalosa e le phello ea para e hlalositsoeng tlas'a maemo a eona a lekantsoeng. Se ke oa e kenyelletsa ho peptide e 'ngoe le e' ngoe e nang le Pyl. Sephetho se ka itšetleha ka tatellano e potolohileng le thepa e lekantsoeng. Moralo oa lipheo tse 'ne o etsa hore litšepiso tseo li buisane ka tsona ntle le ho fana ka tataiso kapa boholo bo iqapetsoeng.
Sebelisa litekanyo tse 'nè ho botsa potso e nang le maemo
Ha re re, ka boikakanyo, hore pheletso e nepahetseng e lekantsoe bakeng sa lipheo tse nne tse tšoailoeng tlas'a maemo a bapisoang. Bapisa phapang ea phalliso bakeng sa para ea Pyl le phapano ea phalliso bakeng sa sehlopha sa Lys. Haeba liphapang tseo li ka khetholloa ka lebaka la ho se tsitse ha tekanyo, phello ea boemo ha e tšoane bakeng sa boitsebiso ba masala a mabeli tsamaisong ena.
Ena ke moralo oa tlhahlobo, eseng polelo ya hore tšebelisano e teng. Ha ho lintlha tsa ho qetela tse fanoeng mona. Tumellano le eona e tla hloka tlhaloso e hlokolosi: mokhoa o sa tsotelleng kapa liphetho tse sa nepahalang li ka pata phapang. Khetha thepa le papiso e utloahalang pele u bokella litekanyetso ho e-na le ho nka linomoro leha e le life tse 'nè e le tlhaloso e feletseng ea limolek'hule..
Khetha bopaki ba sebopeho pele u toloka setša
Boima bo tiileng bo tsamaellanang le GOAS bo ka thusa ho khetholla mekhoa e meng ea ho fetola sebopeho, ho kenyelletsa le phetisetso ea Lys e tsamaellanang, empa e ke ke ea theha feela taelo ea GOAS-khahlanong le GAOS. Bopaki ba boitsebiso bo lokela ho shebana le phapang e amanang le sehlopha ka seng. Phapang ea thepa e thata ho e hlalosa haeba tatellano e le 'ngoe ea tokiso kapa masala a kenyelletsoeng a ntse a sa rarolloe..
Hape boloka motheo oa palo ea papiso le mefuta ea ho qetela ea lik'hemik'hale e lumellana ka ho lekaneng bakeng sa ho qetela. Haeba tokiso e le 'ngoe e hlahlojoa ka boima ba phofshoana e 'ngoe 'me e 'ngoe ka tekanyo e fanoeng, phapang e bonahalang e ka kenyelletsa phapang ea palo-kabelo. Haeba li-termini kapa lihlopha tse ling li fapana, ngola liphetoho tseo ho fapana le hore ntho e 'ngoe le e 'ngoe e amahanngoa le lilepe tse peli tsa matrix.
Qetello e molemo ke phapang e lekanyelitsoeng: eo sebopeho sa molek’hule se ileng sa fetoha, e leng tšobotsi e ileng ea lula e tsitsitse, ke bopaki bofe bo thehang lipheo tse bapisoang, le seo ntlha ea ho qetela e khethiloeng e ka se bontšang. Sena se fetola moelelo oa O ho potso e itseng ea lik'hemik'hale ha e ntse e siea boitšoaro bo sa lekanyetsoang bo sa tsejoe ka ho hlaka.
Boloka tlaleho ea bongata le moeli oa bopaki o hlakile
Pyrrolysine ea mahala le masala a pyrrolysine a kentsoeng peptide ke lintho tse fapaneng tsa accounting.. Bakeng sa ketane e sa fetotsoeng e nang le N- le C-termini, lipalo tse thehiloeng ho masalla li akaretsa menehelo e setseng mme e eketsa molek'hule e le 'ngoe ea metsi bakeng sa ketane.. Termini e fetotsoeng, likhokahano, le liphetoho tse ling tsa lik'hemik'hale li hloka tlaleho ea tsona.
Hlalosa hore na lipalo li sebelisa boima ba monoisotopic kapa boima bo tloaelehileng ba molar, mme o sebedise diyuniti tse nepahetseng. Bolela sebopeho se reriloeng sa isotope 'me u khetholle boima bo sa nke lehlakore ho tekanyo e lekantsoeng ea boima ba ion ho ea ho tjhaja. Sengoliloeng sena ha se fane ka bongata ba lipalo ho sepheo sa boikaketsi hobane litlhaloso tsa bona tsa lik'hemik'hale tse felletseng li tla hloka netefatso pele..
| Phapang e fetohile | Phello ea boleng e tšehelitsoe | Qetello ha e tšehetsoe ka bo eona | Netefatso ea hlokahala |
|---|---|---|---|
| Boemo ba Notation | E fetola tsela eo mophetwa a hlalosoang ka yona | Ha e fane ka bopaki ba hore sampole ea sebele e na le mesaletsa e itseng | Kopano ea mohloli, mofuta oa tšimo, le ho hlakisa ho se hlaka |
| O/Pyl e nketsoe sebaka ke K/Ls | E fetola boitsebahatso ba masalla le sebopeho ha o ntse o boloka bolelele ba ketane | Ha e thehe tefiso e akaretsang kapa phetoho ea tšebetso | Sebopeho se felletseng le litekanyo tse amanang le papiso e reriloeng |
| O kenelletse ka har'a sebopeho se tšoanang | E fetola tatellano ea tatellano ha e siea boima bo thehiloeng ho sebopeho bo sa fetohe tlas'a likhakanyo tse tsamaellanang | Ha e thehe tekano ea ts'ebetso | Bopaki ba boitsebiso ba boemo bo tsebang le tlhahlobo efe kapa efe e hlokahalang ea ts'ebetso |
Ho nkela Pyl sebaka ka Lys le ho isa Pyl sebakeng se seng ke liphetoho tse fapaneng tsa sebopeho. Ea pele e fetola boitsebahatso ba masalla le sebopeho; ea bobeli e fetola tatellano ha e ntse e boloka sebopeho tlasa menahano ea lik'hemik'hale e tsamaellanang. Boloka liphapang tseo ha u khetha bopaki le ho toloka papiso.
Pele o sebelisa rekoto, netefatsa kopano ya khoutu, tatelano e felletseng, N-to-C tataiso, maemo, stereochemistry, termini, le liphetoho. Kopanya bopaki bofe kapa bofe ba tlhahlobo le sampole ea sebele. Tšoaea tlhahisoleseding e sa rarolloang ka ho hlaka ho e-na le ho e tlatsa ka amino acid e haufi e tloaelehileng.
Lipotso tse botsoang khafetsa
Na ho tsamaisa Pyl ho tloha boemong ba bobeli ho isa ho ba boraro ho fetola sebopeho? Eseng bakeng sa para ea GOAS/GAOS tlas'a terminal e tšoanang le menahano ea phetoho. Odara liphetoho, kahoo sebopeho se sa fetoheng se le seng ha se khone ho khetholla para.
Na papiso ea GOAS-to-GAKS e ka arola phello ea sebaka sa Pyl-to-Lys? Che. E fetola masala a boitsebiso le boemo hammoho. Sebelisa liphapano tse bolokang sebopeho se tsitsitse.
Na matrix ena e bolela esale pele hore na ke sepheo sefe se sebetsang kapa se qhibilihang haholoanyane? Che. E hlalosa papiso ea meralo e inahaneloang. Sephetho sa thepa se hloka litekanyo tse nepahetseng mabapi le litokisetso tsa sebele tse tšoailoeng.
