Progettazione e studi NMR di peptidi ciclici mirati al dominio N-terminale della proteina tirosina fosfatasi YopH

Riportiamo la progettazione e la valutazione di nuovi peptidi ciclici mirati al dominio N-terminale della proteina tirosina fosfatasi YopH di Yersinia. I peptidi ciclici sono stati progettati sulla base di una breve sequenza della proteina SKAP-HOM [DI(pY)DDPF (pY = fosfotirosina)], e contengono tutti il ​​motivo DEZXDPfK (dove Z è una fosfotirosina o un mimetico della fosfotirosina non idrolizzabile, X è un acido aspartico o una leucina e f è una d-fenilalanina). Questi peptidi presentano un’architettura “testa a coda”., consentendo la ciclizzazione attraverso la formazione di un legame ammidico tra le catene laterali del primo acido aspartico e i residui di lisina. Sono stati condotti studi di perturbazione dello spostamento chimico per monitorare il legame di questi peptidi al dominio N-terminale di YopH. I peptidi contenenti una porzione di fosfotirosina mostrano affinità di legame nell'intervallo micromolare basso; la sostituzione della fosfotirosina con un suo derivato non idrolizzabile riduce drasticamente le affinità di legame. Questi studi preliminari potrebbero aprire la strada alla scoperta di ligandi peptidici più potenti e selettivi del dominio N-terminale YopH che potrebbero essere ulteriormente studiati per la loro capacità di inibire le infezioni da Yersiniae.